Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2011
• Auteurs : Francois BocquierMarc BenoitGabriel LaignelBenoit DedieuSylvie CournutCécile FiorelliMagali JouvenCharles-Henri MoulinClaire AubronAmandine LurettePaul LapeyroniePhilippe HassounMichel MeuretCyril AgreilMartine NapoleoneHervé HosteNicolas N.C. FriggensMuriel TichitEliel González GarcíaDominique HazardDominique FrancoisMaria-Teresa Pellicer-RubioPhilippe GuillouetKarine BoissardClaude Fabre-NysNathalie DebusJacques TeyssierHervé TournadreMartine MigaudBenoit MalpauxPhilippe ChemineauLoys BodinSophie PracheJacques BouixFrancis BarilletJean-Pierre BoutonnetEduardo ChiaJacques LasseurMichel EtienneAnnick GibonJean-Philippe ChoisisJulie LabatutJean Christophe PaoliPierre-Mathieu Santucci
• Organismes : Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Unité de Recherches sur les Herbivores Unité de Recherches sur les Herbivores Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Unité de recherche d'Écodéveloppement Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Unité de recherche d'Écodéveloppement Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse Institut National de la Recherche Agronomique Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Station d'Amélioration Génétique des Animaux Station d'Amélioration Génétique des Animaux Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] Unité Expérimentale d'Insémination Caprine et Porcine Unité Expérimentale d'Insémination Caprine et Porcine Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Unité de Recherches sur les Herbivores Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] Station d'Amélioration Génétique des Animaux Unité de Recherches sur les Herbivores Station d'Amélioration Génétique des Animaux Station d'Amélioration Génétique des Animaux Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Agro-alimentaire Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural AGroécologie, Innovations, teRritoires Laboratoire de Recherches sur le Développement de l'Elevage Laboratoire de Recherches sur le Développement de l'Elevage
• Publié dans Innovations Agronomiques le 24/10/2020

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Résumé : Les systèmes d’élevage ovins et les caprins, comme les autres productions animales, sont confrontés aux multiples défis environnementaux : limiter les nuisances et contribuer positivement à l’entretien ou à l’amélioration du milieu. Les travaux de l’INRA, et de ses partenaires, se sont largement impliqués dans ces questions en considérant ces élevages de petits ruminants comme faisant partie d‘agroécosystèmes complexes. Cette synthèse collective rassemble, en privilégiant les niveaux d’approche, les actions dans lesquels l’INRA intervient. Considérant tout d’abord les grandes tendances sur les effectifs d’animaux et leur répartition géographique, les adaptations ou les disparitions de ces élevages se repèrent par les approches technico-économiques. Dans ce contexte, il était important pour l’INRA de s’intéresser surtout aux origines des changements et de déceler les innovations techniques, organisationnelles et opérationnelles qui interviennent. Globalement, les trois leviers de ces évolutions ont été l’accroissement de la taille des troupeaux et des surfaces, la simplification des conduites (travail) et la réduction de l’utilisation des intrants (charges) au profit des ressources fourragères naturelles locales. Dans ce cadre, l’INRA y évalue également l’acceptabilité de certaines de ses inventions. Dans un tel contexte, les aptitudes d’élevage des animaux ne se limitent plus à la seule maximisation de la productivité individuelle. Des travaux spécifiques à ces espèces s’avèrent nécessaires pour identifier les caractères d’élevage qui sont déterminants dans des systèmes capables d’absorber des aléas. L’idée dominante est qu’il faut transférer sur les animaux eux-mêmes des capacités adaptatives qui étaient précédemment sous-utilisées, voire ignorées. La maîtrise de la reproduction pose encore de sérieux problèmes environnementaux chez ces espèces saisonnées et pour lesquelles l’INRA prépare des solutions alternatives à l’interdiction de l’utilisation de traitements hormonaux qui relarguent des résidus et posent des questions éthiques quant à leur utilisation. Pour quantifier les performances environnementales de ces élevages, l’INRA s’est doté de deux plateformes pluridisciplinaires, et mobilise des domaines expérimentaux où des systèmes d’élevages y sont étudiés à long terme. Par une approche pluridisciplinaire, des analyses multicritères permettent d’évaluer les performances environnementales de ces conduites tant sur le plan des GES, de l’énergie fossile que de la biodiversité. Une telle approche permet surtout d’évaluer objectivement les compromis productivité – performances environnementales. Enfin, à des échelles plus vastes de bassins de production et de micro-régions, des démarches de recherche action sur la coordination des acteurs permettent d’évaluer des coordinations d’acteurs qui ménagent des objectifs de production (régularité de la production) avec la valorisation raisonnée d’écosystèmes pâturés. Ces études s’étendent jusqu’à des échelles territoriales où la dimension paysagère est prise en compte, notamment parce que, par exemple, le rôle anti-incendie de l’élevage de petits ruminants est incontestable. Quels que soient les niveaux d’approche, l’évaluation des performances environnementale des élevages ovins et caprins repose largement sur la modélisation des systèmes et/ou sur des simulations.

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Fichiers liés : Bocquier_16345.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2011
• Auteurs : Changhwan OhJulien LegrandKyungsik KimMarc PhilippeIn Sungpaik
• Organismes : Division of Biological Sciences Centre de recherche sur la Paléobiodiversité et les Paléoenvironnements Division of Biological Sciences Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement Department of Environmentam Geoscienc
• Publié dans Journal of Southeast Asian earth sciences le 01/11/2020

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Résumé : Mesozoic fossil floras are distributed over eastern Asia (China, Mongolia, Siberia, Korea and Japan) according to a regular latitudinal pattern. Two floras are usually distinguished, a northern type and a southern type, the distribution of which oscillated during the Mesozoic. In Japan, this regular pattern is disrupted by a sharp inflexion of the boundary between the two floras. Two competing hypotheses have been proposed to explain this disruption. One hypothesis advocates later tectonic motion clouding the original pattern, while the other hypothesis proposes that a warm oceanic current allowed the southern flora to grow much further north in coastal areas. We used fossil wood, a biotic component that has not previously been used, for a palaeobiogeographical study of the region. The observed fossil wood diversity at the generic level, does not fit with the hypothesis of a warm oceanic current, unless this hypothesis is modified to include alternating warm northbound and cold southbound oceanic currents. Ou

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2011
• Auteurs : Agnès NeuvilleCéline NicoletNicolas MeyerAnne SchneiderMichèle LegrainCécile BrigandBernard DuclosPhilippe BachellierPierre OudetJean-Pierre BellocqMichèle KedingerMarie-Pierre GaubDominique Guenot
• Organismes : Laboratoire de Neurobiologie et Pharmacologie Cardiovasculaire Service de pathologie [CHU Strasbourg] Laboratoire de Neurobiologie et Pharmacologie Cardiovasculaire Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Pôle des Pathologies Digestives Hépatiques et Transplantation [Hôpital Hautepierre-Strasbourg] Pôle des Pathologies Digestives Hépatiques et Transplantation [Hôpital Hautepierre-Strasbourg] Pôle des Pathologies Digestives Hépatiques et Transplantation [Hôpital Hautepierre-Strasbourg] Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Service de pathologie [CHU Strasbourg] De l'homéostasie tissulaire au cancer et à l'inflammation Laboratoire de Neurobiologie et Pharmacologie Cardiovasculaire Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Laboratoire de Neurobiologie et Pharmacologie Cardiovasculaire
• Publié dans Human Pathology le 26/10/2020

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Résumé : Colon carcinogenesis encompasses the stepwise accumulation of genomic aberrations correlated with the transition of aberrant crypt-adenoma-carcinoma. Recent data have revealed that, in addition to the microsatellite-instable phenotype, the chromosome instability pathway, representing four fifth of the colon carcinoma, could be involved in heterogeneous molecular alterations. Our project was aimed at determining the existence of distinct molecular subtypes in 159 non-microsatellite-instable colon polyps and their correlation with histology and dysplasia, using allelotyping, MGMT promoter gene methylation status, and K-RAS mutation analyses. Allelic imbalance, MGMT methylation, and K-RAS mutations arise in 62%, 39%, and 32% of polyps, respectively. Only 14% of polyps had no alterations. A 2-way hierarchical clustering analysis of the allelic imbalances identified subgroups of polyps according to their allelic imbalance frequency and distribution. Not only tubulovillous adenoma but also high-grade adenomas were correlated with high global allelic imbalance frequency (P = .005 and P = .003), with allelic imbalance at microsatellites targeting chromosomes 1, 6, and 9. In conclusion, the data presented in this study show that a large heterogeneity exists in the molecular patterns of alterations in precancerous colon lesions, favoring different modes of tumor initiation. Therefore, molecular alterations correlated with tubulovillous-type and high-grade dysplasia could represent targets identifying predictive factors of progression.

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Fichiers liés : Human Pathology.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2011
• Auteurs : Jean-Philippe MaitreChristian DépretErica de VriesJacques Baillé
• Organismes : Laboratoire des Sciences de l'Éducation (Grenoble) Laboratoire des Sciences de l'Éducation (Grenoble) Laboratoire des Sciences de l'Éducation (Grenoble) Laboratoire des Sciences de l'Éducation (Grenoble)
• Publié dans ZDM le 27/10/2020

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2011
• Auteurs : Jessica CoelhoLaurent BeaugerieJean Frédéric ColombelXavier HébuterneEric LereboursMarc LémannPhilippe BaumerJacques CosnesArnaud BourreilleJean Pierre GendrePhilippe SeksikAntoine BlainEtienne H MetmanAndrée NisardGuillaume CadiotMichel VeyracBenoît CoffinXavier DrayFabrice CarratPhilippe MarteauNon Renseigné
• Organismes : Institut de Génomique Fonctionnelle CHU Saint-Antoine [AP-HP] Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 Centre d'Investigation Clinique - Innovation Technologique de Lille - CIC 1403 - CIC 9301 Hépato-Gastroentérologie Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen] Appareil Digestif Environnement Nutrition Service de gastro-entérologie Service de Gastro-Entérologie et Nutrition Neuropathies du système nerveux entérique et pathologies digestives : implication des cellules gliales entériques Institut des Maladies de l'Appareil Digestif CHU Saint-Antoine [AP-HP] Université de Reims Champagne-Ardenne Fédération Médico-Chirurgicale des Maladies de l'Appareil Digestif Département de Gastroentérologie Epidémiologie des maladies infectieuses et modélisation Service de gastro-entérologie
• Publié dans Gut le 25/10/2020

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Résumé : BACKGROUND AND AIMS: Few studies have been conducted addressing the safety of thiopurine treatment in pregnant women with inflammatory bowel disease (IBD). The aim of this study was to evaluate the pregnancy outcome of women with IBD who have been exposed to thiopurines. METHODS: 215 pregnancies in 204 women were registered and documented in the CESAME cohort between May 2004 and October 2007. Physicians documented the following information from the women: last menstrual date, delivery term, details of pregnancy outcome, prematurity, birth weight and height, congenital abnormalities, medication history during each trimester, smoking history and alcohol ingestion. Data were compared between three groups: women exposed to thiopurines (group A), women receiving a drug other than thiopurines (group B) and women not receiving any medication (group C). RESULTS: Mean age at pregnancy was 28.3 years. 75.7% of the women had Crohn's disease and 21.8% had ulcerative colitis, with a mean disease duration of 6.8 years at inclusion. Of the 215 pregnancies, there were 138 births (142 newborns), and the mean birth weight was 3135 g. There were 86 pregnancies in group A, 84 in group B and 45 in group C. Interrupted pregnancies occurred in 36% of patients enrolled in group A, 33% of patients enrolled in group B, and 40% of patients enrolled in group C; congenital abnormalities arose in 3.6% of group A cases and 7.1% of group B cases. No significant differences were found between the three groups in overall pregnancy outcome. CONCLUSIONS: The results obtained from this cohort indicate that thiopurine use during pregnancy is not associated with increased risks, including congenital abnormalities.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2011
• Auteurs : Philippe SeksikJean-Yves MaryLaurent BeaugerieMarc LémannJean-Frederic ColombelGwenolla Vernier-MassouilleJacques Cosnes
• Organismes : CHU Saint-Antoine [AP-HP] Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 Biostatistique et épidemiologie clinique CHU Saint-Antoine [AP-HP] Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 Service de gastro-entérologie Service d'Hépato-gastroentérologie Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 Service de Gastro-Entérologie et Nutrition
• Publié dans Inflammatory Bowel Diseases le 27/10/2020

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Résumé : BACKGROUND: Nodular regenerative hyperplasia (NRH) is a rare hepatic disorder that may lead to severe portal hypertension. Cases of NRH have been reported in patients receiving thiopurines for inflammatory bowel disease (IBD). Since azathioprine (AZA) is used more and more frequently as a maintenance treatment in IBD, the risk of NRH must be known. The objective of this study was to evaluate the prevalence of NRH and its predictive factors in IBD patients treated with AZA. MATERIALS AND METHODS: From the same tertiary referral center, 1888 consecutive IBD patients treated with AZA were studied. Clinical diagnosis of NRH was proven by liver biopsy in all cases except one. The cumulative risk of NRH was estimated with the Kaplan-Meier method. Factors associated with NRH were tested independently with the log-rank method and multivariate proportional hazards model with time-dependent covariates. RESULTS: Fifteen patients developed NRH in a median treatment duration of 52.4 months (SE 1.6). The cumulative incidence of NRH was 1.28±0.45% at 10 years. Only two variables were independently associated with NRH occurrence: male gender (P=0.0001, hazard ratio [HR] 8.5, 95% confidence interval [CI] 1.9-37.9) and small bowel resection≥50 cm (P<0.0001, HR 6.6, 95% CI 2.2-20.0), either prior to or after AZA initiation. CONCLUSIONS: The risk of developing NRH during AZA treatment is low. This study suggests that male patients with small bowel resection≥50 cm constitute the group with the higher risk of developing NRH while treated with AZA.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2011
• Auteurs : Sarah Beseme NambotinLydie LefrancoisXavier SainsilyPascale BerthillonMiran KimJack R WandsMichele ChevallierPierre JalinotJean-Yves ScoazecChristian TrepoFabien ZoulimPhilippe Merle
• Organismes : Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon The Liver Research Center Brown medical school Biomnis Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Service d'hépatologie et de gastroentérologie Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
• Publié dans Journal of Hepatology le 23/10/2020

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Résumé : BACKGROUND & AIMS: We previously reported the frequent overexpression of the FZD7 membrane receptor in hepatocellular carcinoma (HCC) and its role for controlling cancer phenotype. Herein, this study aimed at assessing the anticancer properties of compounds inhibiting FZD7 activity by disrupting its binding with the cytosolic Dishevelled (DVL) adaptator. METHODS: We have designed small interfering peptides (RHPDs) that are able to enter within cells and to competitively antagonize the binding of FZD7 to the PDZ domain of DVL. Their anti-neoplastic properties were assessed in vitro on a panel of human HCC cell lines and in vivo on the SV40-TAg transgenic mouse model of HCC. RESULTS: We have shown that RHPDs decrease cell viability via apoptosis depending on their affinity for PDZ, with a therapeutic index between cancerous and non-cancerous cells. RHPD properties were linked to β-catenin degradation and PKCδ activation. In transgenic mice, intra-tumor injection of RHPDs inhibited HCC progression. CONCLUSIONS: We have completed a proof-of-concept showing that in vitro and in vivo the pharmacological inhibition of FZD7 displays anti-cancerous properties against HCC. The mechanisms can involve β-catenin and PKCδ modulations. Further studies are warranted to design protocols showing the compatibility with systemic in vivo applications.

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 24/01/2011
• Auteurs : Pierre FormontJean-Philippe OvarlezFrédéric PascalGabriel VasileLaurent Ferro-Famil
• Organismes : Sondra, CentraleSupélec, Université Paris-Saclay (COmUE) ONERA - The French Aerospace Lab [Toulouse] Sondra, CentraleSupélec, Université Paris-Saclay (COmUE) GIPSA - Signal Images Physique Institut d'Electronique et de Télécommunications de Rennes

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Résumé : We discuss in the paper the use of the Riemannian mean given by the differential geometric tools. This geometric mean is used in this paper for computing the class centers in the polarimetric H/α unsupervised classification process. We show that the class centers remain more stable during the iteration process, leading to a different interpretation of the H/α /A classification. This technique can be applied both on classical Sample Covariance Matrix and on Fixed Point covariance matrices. Used jointly with the Fixed Point covariance matrix estimate, this technique can give more robust results when dealing with high resolution and highly textured polarimetric SAR images classification.

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Fichiers liés : Full_paper_Polinsar_2011.pdf

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 24/01/2011
• Auteurs : Gabriel VasileFrédéric PascalJean-Philippe Ovarlez
• Organismes : GIPSA - Signal Images Physique Sondra, CentraleSupélec, Université Paris-Saclay (COmUE) ONERA - The French Aerospace Lab [Toulouse]

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Résumé : This paper presents a new estimation scheme for optimally deriving clutter parameters with high resolution POLSAR data. The heterogeneous clutter in POLSAR data is described by the Spherically Invariant Random Vectors model. Three parameters are introduced for the high resolution POLSAR data clutter: the span, the normalized texture and the speckle normalized covariance matrix. The asymptotic distribution of the novel span estimator is investigated. A novel heterogeneity test for the POLSAR clutter is also discussed. The proposed method is tested with airborne POLSAR images provided by the ONERA RAMSES system.

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Fichiers liés : 2100245vasile.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 20/01/2011
• Auteurs : Cécile StraubPhilippe QuillardetJulia VergalliNicole Tandeau de MarsacJean-François Humbert
• Organismes : Collection des Cyanobactéries Collection des Cyanobactéries Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie Laboratoire de chimie bactérienne Biogéochimie et écologie des milieux continentaux
• Publié dans PLoS ONE le 25/10/2020

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Résumé : The cyanobacterium, Microcystis aeruginosa, is able to proliferate in a wide range of freshwater ecosystems and to produce many secondary metabolites that are a threat to human and animal health. The dynamic of this production and more globally the metabolism of this species is still poorly known. A DNA microarray based on the genome of M. aeruginosa PCC 7806 was constructed and used to study the dynamics of gene expression in this cyanobacterium during the light/dark cycle, because light is a critical factor for this species, like for other photosynthetic microorganisms. This first application of transcriptomics to a Microcystis species has revealed that more than 25% of the genes displayed significant changes in their transcript abundance during the light/dark cycle and in particular during the dark/light transition. The metabolism of M. aeruginosa is compartmentalized between the light period, during which carbon uptake, photosynthesis and the reductive pentose phosphate pathway lead to the synthesis of glycogen, and the dark period, during which glycogen degradation, the oxidative pentose phosphate pathway, the TCA branched pathway and ammonium uptake promote amino acid biosynthesis. We also show that the biosynthesis of secondary metabolites, such as microcystins, aeruginosin and cyanopeptolin, occur essentially during the light period, suggesting that these metabolites may interact with the diurnal part of the central metabolism.

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Fichiers liés : PLoS_One_Revised2.pdf

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