Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2011
• Auteurs : Véronique CheretJean-Philippe DenuxChristelle GacherieuJean-Pierre Ortisset
• Organismes : Ecole d'Ingénieurs de Purpan Ecole d'Ingénieurs de Purpan Office National des Forêts Centre National de la Propriété Forestière
• Publié dans Rendez-vous Techniques de l'ONF le 29/10/2020

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Résumé : La canicule de 2003 a provoqué dans le Sud Massif Central des dépérissements résineux brutaux et massifs. Après la crise est venu le temps de l’analyse, en évaluant d’abord l’étendue des impacts, ne serait-ce que pour organiser les reconstitutions à l’échelle régionale. La méthode de télédétection imaginée et mise en oeuvre avec succès est bien adaptée à ce type de phénomène, avec ceci d’original qu’elle intègre les coupes sanitaires d’urgence comme indicateur de l’intensité du dépérissement. Mais gardons-nous de généraliser, car de ce fait même elle ne se prêterait pas à l’évaluation d’autres types de dépérissement, plus diffus ou aux symptômes plus « subtils ».

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Fichiers liés : cheret_16389.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2011
• Auteurs : Wildriss ViranaickenLaila GasmiAlexandre ChaumetChristiane DurieuxVirginie GeorgetPhilippe DenouletJean-Christophe Larcher
• Organismes : Laboratoire de Biologie du Développement Laboratoire de Biologie du Développement Laboratoire de Biologie du Développement Institut Jacques Monod Institut Biologie Intégrative Laboratoire de Biologie du Développement Laboratoire de Biologie du Développement
• Publié dans PLoS ONE le 25/10/2020

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Résumé : Ilf3 and NF90, two proteins containing double-stranded RNA-binding domains, are generated by alternative splicing and involved in several functions. Their heterogeneity results from posttranscriptional and posttranslational modifications. Alternative splicing of exon 3, coding for a 13 aa N-terminal motif, generates for each protein a long and short isoforms. Subcellular fractionation and localization of recombinant proteins showed that this motif acts as a nucleolar localization signal. Deletion and substitution mutants identified four arginines, essential for nucleolar targeting, and three histidines to stabilize the proteins within the nucleolus. The short isoforms are never found in the nucleoli, whereas the long isoforms are present in the nucleoplasm and the nucleoli. For Ilf3, only the posttranslationally-unmodified long isoform is nucleolar, suggesting that this nucleolar targeting is abrogated by posttranslational modifications. Confocal microscopy and FRAP experiments have shown that the long Ilf3 isoform localizes to the granular component of the nucleolus, and that L-Ilf3 and L-NF90 exchange rapidly between nucleoli. The presence of this 13 aminoacid motif, combined with posttranslational modifications, is responsible for the differences in Ilf3 and NF90 isoforms subcellular localizations. The protein polymorphism of Ilf3/NF90 and the various subcellular localizations of their isoforms may partially explain the various functions previously reported for these proteins.

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Fichiers liés : journal.pone.0022296.PDF

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2011
• Auteurs : Fanny KiekenGaud DervillyJean-Philippe AntignacAnne-Christelle ParisPatrice GarciaMarie-Agnès PopotMorgane GrallVictoria MercadierPierre-Louis ToutainYves BonnaireBruno Le Bizec
• Organismes : Laboratoire des Courses Hippiques Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments Laboratoire des Courses Hippiques Laboratoire des Courses Hippiques Laboratoire des Courses Hippiques Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales ToxAlim Toxicologie Alimentaire Laboratoire des Courses Hippiques Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
• Publié dans Metabolomics le 28/10/2020

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Résumé : Growth hormones are proteins produced by the anterior pituitary gland responsible for bone and tissue growth through their effects on carbohydrates, lipids and proteins metabolisms. Despite strict regulations banning the use of recombinant equine growth hormone, this substance is suspected to be misused to improve the horse physical performances. In order to check whether the regulation is fulfilled or not, controls are organized and a new analytical screening tool potentially able to detect such abuse was investigated in this paper. An untargeted metabolomics approach, based on liquid chromatography coupled to high resolution mass spectrometry, was developed and applied to characterize and compare horse urinary and plasmatic metabolic profiles upon reGH administrations. After minimal sample preparation, biological fluids were analyzed by LC-ESI(+/-)-Q-TOF. Data processing was performed by XCMS software and multivariate data analysis applied to the generated data set allowed building OPLS models to discriminate control versus treated populations. Results demonstrated significant metabolic modifications consecutively to the reGH treatment. A comparative study between urinary and plasmatic signatures was performed to evaluate the resulting metabolomic models and to asses their respective interests in the scope of real application for screening reGH administration.

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Fichiers liés : Kieken Fanny_{1F83B1E6-8145-4348-8DDD-99CD7DC7D130}.pdf

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• Type de publi. : Rapport
• Date de publi. : 01/01/2011
• Auteurs : Eszter KelemenKatalin BalazsJean-Philippe ChoisisNorma N. ChoisisPeter DennisTiziano GomieroEszter KovacsGeneviève NguyenMaurizio PaolettiLászló PodmaniczkyJulie RyschawyJean-Pierre Sarthou
• Organismes : Institute of Environmental and Landscape Management Institute of Environmental and Landscape Management Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural Institute of Biological, Environmental and Rural Sciences Università degli Studi di Padova = University of Padua Institute of Environmental and Landscape Management AGroécologie, Innovations, teRritoires AGroécologie, Innovations, teRritoires Università degli Studi di Padova = University of Padua Szent István University Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural

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Fichiers liés : 2011_Kelemen_BioBio_1.pdf

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• Type de publi. : Chapître d'ouvrage
• Date de publi. : 01/01/2011
• Auteurs : Jean-Claude BertrandPierre DoumenqRemy GuyoneaudBenoît MarrotFabrice Martin-LaurentRobert MatheronPhilippe MoulinGuy Soulas
• Organismes : Université de Provence - Aix-Marseille 1 Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2 Université de Pau et des Pays de l'Adour Université de Provence - Aix-Marseille 1 Microbiologie Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2 Mécanisme Moléculaire du Diabète Oenologie

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• Type de publi. : Chapître d'ouvrage
• Date de publi. : 01/01/2011
• Auteurs : Charles BostAnne GoarantAnnette SchefferPhilippe KoubbiG. DuhamelJean-Benoît Charrassin
• Organismes : Centre d'Études Biologiques de Chizé Laboratoire d'océanographie de Villefranche Centre d'Études Biologiques de Chizé Laboratoire d'océanographie de Villefranche Département Milieux et Peuplements Aquatiques Couplage physique-biogéochimie-carbone

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Résumé : ABSTRACT. - Understanding how climate change affects the foraging ecology of key marine predators is an important issue in the study of southern ocean food webs. since 1998, we have conducted a long term research program on the foraging ecology of a top-diving predator, the King penguin Aptenodytes patagonicus, simultaneously at Kerguelen and Crozet islands with the support of the iPeV (institut Polaire français). King penguin is one of the most important predatory birds at Kerguelen. in summer, they forage preferentially along large-scale physical features and use the three dimensions of hydrographic features to feed on myctophid fishes (the penguins' main prey and a major prey species in the Southern Ocean). Primarily, this study aims to evaluate how the change in foraging parameters and success of penguins reflect the impact of oceanographic conditions on key food webs in the polar frontal zone. each summer, breeding (incubation and brooding) penguins from the ratmanoff colony (Courbet Peninsula, Kerguelen; 100 000 pairs) are instrumented with Argos transmitters or GPS with time-temperature-depth recorders. Here we provide a first modelling approach to the King penguin's foraging habitat during summer from static variables (bathymetry), dynamic variables (SSHt, SST, Chlorophyll) and their related trends (gradients). In addition, trawl data on the distribution of myctophid fishes have been integrated. The most important factors explaining penguin foraging location are the ssht, the bathymetry gradient and the sst. results of interannual change in penguins at-sea trajectories, diving behaviour, foraging success and effort are discussed according to the interannual changes in the hydrographic structure in the Kerguelen region. RÉSUMÉ. - Habitat d'alimentation du manchot royal (Aptenodytes patagonicus) à Kerguelen. Comprendre comment les changements climatiques vont affecter les prédateurs supérieurs marins de l'océan Austral et les chaînes trophiques dont ils dépendent est d'un intérêt majeur. Depuis 1998, nous menons un programme de recherche à long terme sur les stratégies alimentaires d'un prédateur marin plongeur, le manchot royal Aptenodytes patagonicus aux îles Kerguelen et Crozet, avec le support de l'IPEV (Institut Polaire Français). Le manchot royal est un des prédateurs marins les plus importants de Kerguelen, en termes de biomasse consommante. en été, les manchots royaux se nourrissent préférentiellement de poissons de la famille des myctophidés, un groupe clé des chaînes trophiques de l'océan Austral. Ils recherchent leurs proies préférentiellement au niveau de caractéristiques physiques à grande échelle et utilisent les 3 dimensions de la structure hydrologique. Un des objectifs de notre étude est d'évaluer comment les changements dans l'écologie alimentaire des manchots vont refléter l'impact des conditions océanographiques à l'échelle locale et à grande échelle, sur les chaînes alimentaires dont ils dépendent. A cette fin, des manchots partant en mer pour se nourrir sont équipés de balises Argos, GPS ou enregistreurs de plongée / température de l'eau, durant chaque été austral. A Kerguelen, la colonie étudiée est située à ratmanofff, sur la façade est de la péninsule Courbet (100 000 couples). nous présentons ici la première approche de modélisation de l'habitat alimentaire en mer des manchots, à partir de l'analyse des variables statiques (bathymétrie) et dynamiques (température et hauteur de l'eau et leurs gradients, chlorophylle et gradients associés). Les données des pêches scientifiques existantes sur la distribution des myctophidés ont été intégrées. Les facteurs explicatifs les plus importants vis-à -vis de la distribution en mer des manchots sont les anomalies des hauteurs d'eau et les gradients associés, la température de l'eau et le gradient de bathymétrie. Les résultats des changements d'année en année des trajectoires en mer des manchots, du comportement de plongée et de leur effort de pêche sont discutés en perspectives des changements hydrologiques affectant l'écosystème de Kerguelen.

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 01/01/2011
• Auteurs : Germain RousseauxG. JannesRobert PiquetJ. ChalinePhilippe MaïssaChristian MathisPierre CoulletThomas PhilbinUlf Leonhardt
• Organismes : Laboratoire Jean Alexandre Dieudonné Laboratoire Jean Alexandre Dieudonné Laboratoire Jean Alexandre Dieudonné Laboratoire Jean Alexandre Dieudonné Laboratoire Jean Alexandre Dieudonné Laboratoire Jean Alexandre Dieudonné Laboratoire Jean Alexandre Dieudonné SUPA School of Physics and Astronomy [University of St Andrews] SUPA School of Physics and Astronomy [University of St Andrews]

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2011
• Auteurs : Catherine FéartCatherine HelmerHervé FleuryYannick BéjotKaren RitchiePhillippe AmouyelSusanna Schraen-MaschkeLuc BuéeJean-Charles LambertLuc LetenneurJean-François Dartigues
• Organismes : Epidémiologie et Biostatistique [Bordeaux] Epidémiologie et Biostatistique [Bordeaux] Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2 Centre d'épidémiologie des populations Service de Neurologie générale, vasculaire et dégénérative (CHU de Dijon) Neuropsychiatrie : recherche épidémiologique et clinique Division of Diabetes, Endocrinology & Metabolism Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U837 Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U837 Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations Epidémiologie et Biostatistique [Bordeaux] Epidémiologie et Biostatistique [Bordeaux]
• Publié dans PLoS ONE le 25/10/2020

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Résumé : OBJECTIVE: Herpes simplex virus (HSV) reactivation has been identified as a possible risk factor for Alzheimer's disease (AD) and plasma amyloid-beta (Aβ) levels might be considered as possible biomarkers of the risk of AD. The aim of our study was to investigate the association between anti-HSV antibodies and plasma Aβ levels. METHODS: The study sample consisted of 1222 subjects (73.9 y in mean) from the Three-City cohort. IgM and IgG anti-HSV antibodies were quantified using an ELISA kit, and plasma levels of Aβ(1-40) and Aβ(1-42) were measured using an xMAP-based assay technology. Cross-sectional analyses of the associations between anti-HSV antibodies and plasma Aβ levels were performed by multi-linear regression. RESULTS: After adjustment for study center, age, sex, education, and apolipoprotein E-e4 polymorphism, plasma Aβ(1-42) and Aβ(1-40) levels were specifically inversely associated with anti-HSV IgM levels (β = -20.7, P = 0.001 and β = -92.4, P = 0.007, respectively). In a sub-sample with information on CLU- and CR1-linked SNPs genotyping (n = 754), additional adjustment for CR1 or CLU markers did not modify these associations (adjustment for CR1 rs6656401, β = -25.6, P = 0.002 for Aβ(1-42) and β = -132.7, P = 0.002 for Aβ(1-40;) adjustment for CLU rs2279590, β = -25.6, P = 0.002 for Aβ(1-42) and β = -134.8, P = 0.002 for Aβ(1-40)). No association between the plasma Aβ(1-42)-to-Aβ(1-40) ratio and anti-HSV IgM or IgG were evidenced. CONCLUSION: High anti-HSV IgM levels, markers of HSV reactivation, are associated with lower plasma Aβ(1-40) and Aβ(1-42) levels, which suggest a possible involvement of the virus in the alterations of the APP processing and potentially in the pathogenesis of AD in human.

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Fichiers liés : journal.pone.0029480.pdf

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• Type de publi. : Chapître d'ouvrage
• Date de publi. : 01/01/2011
• Auteurs : Xavier ChardonCyrille RigolotChristine BaratteRoger Martin-ClouaireJean-Pierre RellierC. RaisonAndré Le GallJean-Claude PoupaJean-Yves DourmadLuc DelabyThierry MorvanPhilippe LetermeJean-Marie PaillatS. EspagnolPhilippe Faverdin
• Organismes : Production du lait Production du lait Production du lait Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (ancêtre de MIAT) Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (ancêtre de MIAT) Institut de l'élevage Institut de l'élevage Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires Systèmes d'élevage, nutrition animale et humaine Production du lait Sol Agro et hydrosystème Spatialisation Sol Agro et hydrosystème Spatialisation Sol Agro et hydrosystème Spatialisation Institut du Porc Production du lait

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Résumé : A whole farm-model to simulate the environmental impacts of animal farming system: MELODIE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2011
• Auteurs : Emilie E. GuittardCatherine C. BlaisAnnick A. MariaJean-Philippe J.-P. ParvyShivani S. PasrichaChristopher C. LumbRené R. LafontPhillip J. P. J. DabornChantal C. Dauphin-Villemant
• Organismes : Biogenèse des Signaux hormonaux Physiologie de l'Insecte : Signalisation et Communication Physiologie de l'Insecte : Signalisation et Communication Biogenèse des Signaux hormonaux Department of Genetics, Bio21 Molecular Science and Biotechnology Institute Department of Genetics, Bio21 Molecular Science and Biotechnology Institut Biosynthèse des Signaux Peptidiques [IBPS] Department of Genetics, Bio21 Molecular Science and Biotechnology Institute Biogenèse des Signaux hormonaux
• Publié dans Developmental Biology le 02/11/2020

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Résumé : Ecdysteroids are steroid hormones, which coordinate major developmental transitions in insects. Both the rises and falls in circulating levels of active hormones are important for coordinating molting and metamorphosis, making both ecdysteroid biosynthesis and inactivation of physiological relevance. We demonstrate that Drosophila melanogaster Cyp18a1 encodes a cytochrome P450 enzyme (CYP) with 26- hydroxylase activity, a prominent step in ecdysteroid catabolism. A clear ortholog of Cyp18a1 exists in most insects and crustaceans. When Cyp18a1 is transfected in Drosophila S2 cells, extensive conversion of 20- hydroxyecdysone (20E) into 20-hydroxyecdysonoic acid is observed. This is a multi-step process, which involves the formation of 20,26-dihydroxyecdysone as an intermediate. In Drosophila larvae, Cyp18a1 is expressed in many target tissues of 20E. We examined the consequences of Cyp18a1 inactivation on Drosophila development. Null alleles generated by excision of a P element and RNAi knockdown of Cyp18a1 both result in pupal lethality, possibly as a consequence of impaired ecdysteroid degradation. Our data suggest that the inactivation of 20E is essential for proper development and that CYP18A1 is a key enzyme in this process.

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