Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Veronique V. CheretJean-Philippe J.-P. DenuxChristelle GacherieuJean-Pierre Ortisset
• Organismes : Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural Institut National Polytechnique (Toulouse) Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural Institut National Polytechnique (Toulouse) Office National des Forêts Centre National de la Propriété Forestière
• Publié dans Rendez-vous Techniques de l'ONF le 29/10/2020

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Fichiers liés : 2011_Cheret_RDVTechniques_1.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Philippe DebaekePierre CasadebaigBertrand HaquinEmmanuelle MestriesJean-Pierre PalleauF. Salvi
• Organismes : AGroécologie, Innovations, teRritoires AGroécologie, Innovations, teRritoires AGroécologie, Innovations, teRritoires Terres Inovia Terres Inovia Terres Inovia
• Publié dans Oléagineux, Corps Gras, Lipides le 30/10/2020

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Résumé : Variety assessment could be supported by the use of dynamic crop modelling. The SUNFLO model was developed to simulate the achene yield and oil concentration of sunflower crop with a special attention paid to the description of varietal diversity. For that purpose, a variety was characterized in the model by 12 parameters of phenology, leaf area development, allocation and response to water stress. These parameters were measured either in field conditions (dense stands) or in greenhouse pot experiments. In 2008, two variety trials were carried out by CETIOM in non limiting conditions and a greenhouse experiment was conducted by INRA to calibrate the response of leaf expansion and plant transpiration to soil water depletion. The model parameterized with these 3 experiments on 18 commercial varieties was evaluated for yield in 42 situations of the post-registration network conducted by CETIOM in France in 2008. The yield of a given variety in a given environment was simulated with a mean error of 5 q/ha (relative error = 16%). When averaging a variety over all the environments or an environment over all the varieties, the error was of 3.5 q/ha (relative error = 11%). The model could be used to rank environments (through sunflower crop response) in a variety assessment network and to separate varieties with sufficient phenotypic differences

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Fichiers liés : 2010_Debaeck_OCL_1.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Jean-Paul LaclauJoseph LevillainPhilippe DeleporteJean de Dieu NzilaJean-Pierre BouilletLaurent Saint‐andréAntoine VersiniLouis MareschalYann NouvellonArmel Thongo M'BouJacques J. Ranger
• Organismes : Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement Centre de Recherche sur la Durabilité et la Productivité des Plantations Industrielles Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement Centre de Recherche sur la Durabilité et la Productivité des Plantations Industrielles Centre de Recherche sur la Durabilité et la Productivité des Plantations Industrielles Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement Centre de Recherche sur la Durabilité et la Productivité des Plantations Industrielles Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers
• Publié dans Forest Ecology and Management le 26/10/2020

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Résumé : Tropical plantation forests are meeting an increasing proportion of global wood demand and comprehensive studies assessing the impact of silvicultural practices on tree and soil functioning are required to achieve sustainable yields. The objectives of our study were: (1) to quantify the effects of contrasting organic residue (OR) retention methods on tree growth and soil nutrient pools over a full Eucalyptus rotation and (2) to assess the potential of soil analyses to predict yields of fast-growing plantations established on tropical sandy soils. An experiment was set up in the Congo at the harvesting of the first rotation after afforestation of a native herbaceous savanna. Six treatments were set up in 0.26 ha plots and replicated in 4 blocks, with OR mass at planting ranging from 0 to 46.5 Mg ha(-1). Tree growth over the whole rotation was highly dependent on OR management at planting. Over-bark trunk volume 7 years after planting ranged from 96 m(3) ha-1 in the treatment with forest floor and harvest residue removal at planting to 164 m(3) ha(-1) in the treatment with the largest amount of OR. A comparison of nutrient stocks within the ecosystem at planting and at the end of the rotation suggested that nutrient contents in OR were largely involved in the different response observed between treatments. OR management treatments did not significantly modify most of the nutrient concentrations in the upper layers of the mineral soil. Conventional soil analyses performed before planting and at ages 1 and 3 years were unable to detect differences between treatments despite large differences in tree growth. In contrast, linear regressions between stand aboveground biomass at harvesting and OR mass at planting (independent variable) showed that OR mass was an excellent predictor of stand yield (R(2) = 0.99). A large share of soil fertility comes from organic material above the mineral soil in highly weathered sandy soils and OR mass at planting might be used in conjunction with soil analyses to assess the potential of these soils to support forest plantations.

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• Type de publi. : Chapître d'ouvrage
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Philippe Ménard
• Organismes : Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Philippe LouâpreJacques J.M. J.M. van AlphenJean-Sébastien Pierre
• Organismes : Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] Paysages, Changements Climatique, Biodiversité Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes]
• Publié dans PLoS ONE le 25/10/2020

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Résumé : Behavioral ecologists assume that animals use a motivational mechanism for decisions such as action selection and time allocation, allowing the maximization of their fitness. They consider both the proximate and ultimate causes of behavior in order to understand this type of decision-making in animals. Experimental psychologists and neuroeconomists also study how agents make decisions but they consider the proximate causes of the behavior. In the case of patch-leaving, motivation-based decision-making remains simple speculation. In contrast to other animals, human beings can assess and evaluate their own motivation by an introspection process. It is then possible to study the declared motivation of humans during decision-making and discuss the mechanism used as well as its evolutionary significance. In this study, we combine both the proximate and ultimate causes of behavior for a better understanding of the human decision-making process. We show for the first time ever that human subjects use a motivational mechanism similar to small insects such as parasitoids [1] and bumblebees [2] to decide when to leave a patch. This result is relevant for behavioral ecologists as it supports the biological realism of this mechanism. Humans seem to use a motivational mechanism of decision making known to be adaptive to a heterogeneously distributed resource. As hypothesized by Hutchinson et al. [3] and Wilke and Todd [4], our results are consistent with the evolutionary shaping of decision making because hominoids were hunters and gatherers on food patches for more than two million years. We discuss the plausibility of a neural basis for the motivation mechanism highlighted here, bridging the gap between behavioral ecology and neuroeconomy. Thus, both the motivational mechanism observed here and the neuroeconomy findings are most likely adaptations that were selected for during ancestral times.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Jean-Loup AbbéMichel BarbazaFrançois-Xavier FauvelleNicolas ValdeyronPhilippe FosseJean-Marc FabreFrançois BonThierry RufPierre MoretNicolas TeyssandierVincent MourreChristine RenduCarine CalastrencSandrine Baron
• Organismes : France, Amériques, Espagne, Sociétés, Pouvoirs, Acteurs Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Dynamiques environnementales entre forêt, agriculture et biodiversité : des pratiques locales sur la nature aux politiques de conservation Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés France, Amériques, Espagne, Sociétés, Pouvoirs, Acteurs France, Amériques, Espagne, Sociétés, Pouvoirs, Acteurs Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés
• Publié dans Les Nouvelles de l'archéologie le 26/10/2020

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Mikołaj SłabickiMirko TheisDragomir B. KrastevSergey SamsonovEmeline MundwillerMagno JunqueiraMaciej Paszkowski-RogaczJoan TeyraAnne-Kristin HeningerIna PoserFabienne PrieurJérémy TruchettoChristian ConfavreuxCécilia MarelliAlexandra DürrJean Philippe CamdessancheAlexis BriceAndrej ShevchenkoM Teresa PisabarroGiovanni StevaninFrank Buchholz
• Organismes : Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics Structural Bioinformatics Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics Structural Bioinformatics Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics Service de Génétique Clinique Chromosomique et Moléculaire Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière Hôpital neurologique Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière Service de Génétique Clinique Chromosomique et Moléculaire Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics Structural Bioinformatics Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics
• Publié dans PLoS Biology le 27/10/2020

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Résumé : DNA repair is essential to maintain genome integrity, and genes with roles in DNA repair are frequently mutated in a variety of human diseases. Repair via homologous recombination typically restores the original DNA sequence without introducing mutations, and a number of genes that are required for homologous recombination DNA double-strand break repair (HR-DSBR) have been identified. However, a systematic analysis of this important DNA repair pathway in mammalian cells has not been reported. Here, we describe a genome-scale endoribonuclease-prepared short interfering RNA (esiRNA) screen for genes involved in DNA double strand break repair. We report 61 genes that influenced the frequency of HR-DSBR and characterize in detail one of the genes that decreased the frequency of HR-DSBR. We show that the gene KIAA0415 encodes a putative helicase that interacts with SPG11 and SPG15, two proteins mutated in hereditary spastic paraplegia (HSP). We identify mutations in HSP patients, discovering KIAA0415/SPG48 as a novel HSP-associated gene, and show that a KIAA0415/SPG48 mutant cell line is more sensitive to DNA damaging drugs. We present the first genome-scale survey of HR-DSBR in mammalian cells providing a dataset that should accelerate the discovery of novel genes with roles in DNA repair and associated medical conditions. The discovery that proteins forming a novel protein complex are required for efficient HR-DSBR and are mutated in patients suffering from HSP suggests a link between HSP and DNA repair.

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Fichiers liés : journal.pbio.1000408.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Olivier LeroyJean-Paul MiraPhilippe MontraversJean-Pierre GangneuxOlivier Lortholary
• Organismes : Service de Réanimation Médicale et des Maladies Infectieuses Service de Réanimation Médicale Institut Cochin Service d'anesthésie - réanimation chirurgicale Service de Parasitologie-Mycologie [Rennes] Signalisation et Réponses aux Agents Infectieux et Chimiques Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker] Centre National de Référence Mycologie et Antifongiques-Mycologie Moléculaire
• Publié dans Critical Care le 31/10/2020

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Résumé : INTRODUCTION: Candidemia raises numerous therapeutic issues for intensive care physicians. Epidemiological data that could guide the choice of initial therapy are still required. This analysis sought to compare the characteristics of intensive care unit (ICU) patients with candidemia due to non-albicans Candida species with those of ICU patients with candidemia due to Candida albicans. METHODS: A prospective, observational, multicenter, French study was conducted from October 2005 to May 2006. Patients exhibiting candidemia developed during ICU stay and exclusively due either to one or more non-albicans Candida species or to C. albicans were selected. The data collected included patient characteristics on ICU admission and at the onset of candidemia. RESULTS: Among the 136 patients analyzed, 78 (57.4%) had candidemia caused by C. albicans. These patients had earlier onset of infection (11.1 +/- 14.2 days after ICU admission vs. 17.4 +/- 17.7, p = 0.02), higher severity scores on ICU admission (SOFA: 10.4 +/- 4.7 vs. 8.6 +/- 4.6, p = 0.03; SAPS II: 57.4 +/- 22.8 vs. 48.7 +/- 15.5, P = 0.015), and were less often neutropenic (2.6% vs. 12%, p = 0.04) than patients with candidemia due to non-albicans Candida species. CONCLUSIONS: Although patients infected with Candida albicans differed from patients infected with non-albicans Candida species for a few characteristics, no clinical factor appeared pertinent enough to guide the choice of empirical antifungal therapy in ICU.

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Fichiers liés : cc9033.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Rémy RocaPhilippe ChambonIsabelle JobardPierre-Emmanuel KirstetterMarielle GossetJean Claude Bergès
• Organismes : Laboratoire de Météorologie Dynamique (UMR 8539) Laboratoire de Météorologie Dynamique (UMR 8539) Laboratoire de Météorologie Dynamique (UMR 8539) SPACE - LATMOS Laboratoire d'étude des transferts en hydrologie et environnement Pôle de recherche pour l'organisation et la diffusion de l'information géographique
• Publié dans Journal of Applied Meteorology and Climatology le 02/11/2020

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Résumé : Monsoon rainfall is central to the climate of West Africa and understanding its variability is a challenge for which satellite rainfall products could be well suited to contribute to. Their quality in this region has received less attention than elsewhere. The focus is set on the scales associated with atmospheric variability and a meteorological benchmark is set up with ground-based observations from the AMMA program. The investigation is performed at various scales of accumulation using four gauge networks. The seasonal cycle is analyzed using 10-day averaged products, the synoptic scale variability using daily means and finally the diurnal cycle of rainfall is analyzed at the seasonal scale using composite and at the diurnal scale using 3-hourly accumulations. A novel methodology is introduced that accounts for the errors associated with the areal-time rainfall averages. The errors from both satellite and ground rainfall data are computed using dedicated techniques that come down to an estimation of the sampling errors associated to these measurements. The results show that the new generation of combined IR/MW satellite products is describing the rain variability similarly to ground measurements. At the 10-day scale, all products reveal high regional and seasonal skills. The day-to-day comparison indicates that some products perform better than others, while all of them exhibit high skills when the African Easterly Waves spectral band is considered. The seasonal variability of the diurnal scale as well as its relative daily importance is only captured by some products. Plans for future extensive intercomparisons exercise are briefly discussed

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Fichiers liés : 2009jamc2318_1.pdf

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• Type de publi. : Rapport
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Didier MiallierPierre BoivinNicolas CluzelE. AuzanneauJean-Claude BessonJ. BessonSandra ChabertJ.‑p. CouturiéM. DandoJean-Luc DevidalBertrand DevouardFranck DonnadieuA. DupouxF. PointudB. FarriéJean-Louis FruquièreV. HéritierPhilippe LabazuyAntoine MerleG. MeunierD. ParentS. PetitL. PruneyrollesP. VerdierBertrand Dousteyssier
• Organismes : Laboratoire de Physique Corpusculaire - Clermont-Ferrand Laboratoire Magmas et Volcans Laboratoire Magmas et Volcans Laboratoire Magmas et Volcans Centre d'Histoire "Espaces et Cultures" Centre d'Histoire "Espaces et Cultures" Laboratoire Magmas et Volcans Maison des Sciences de l'Homme de Clermont-Ferrand Laboratoire Magmas et Volcans Laboratoire Magmas et Volcans Laboratoire Magmas et Volcans Centre d'Histoire "Espaces et Cultures" Laboratoire Magmas et Volcans Laboratoire Magmas et Volcans Laboratoire Magmas et Volcans Centre d'Histoire "Espaces et Cultures" Institut national de recherches archéologiques préventives Maison des Sciences de l'Homme de Clermont-Ferrand Centre d'Histoire "Espaces et Cultures" Centre d'Histoire "Espaces et Cultures"

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Résumé : En 2008, l'existence de carrières souterraines médiévales avait été mise en évidence dans la pente ouest du Bois de Manson qui domine la dépression du Cratère Kilian, au pied sud du puy de Dôme. En 2009-2010, des sondages et prospections ont été étendus à tout l'ensemble du Kilian de façon à préciser l'étendue et, si possible, la chronologie de son exploitation dans le passé. Ces travaux ont permis d'observer, dans le fond du cratère et sur son flanc interne ouest, des amoncellements de déblais d'un volume considérable, témoignant d'une extraction de roche à grande échelle durant le haut Moyen Âge et très probablement aussi à l'époque gallo-romaine. Une nouvelle carrière souterraine a été découverte dans la pente interne ouest du cratère. La base du remplissage de cette carrière a livré des charbons datés entre la fin du IV e siècle et le début du VI e siècle par le radiocarbone, tandis que le sommet du remplissage contenait des tessons de céramique datables, par leur typologie, de la fin du V e siècle au début du VIII e siècle. L'état actuel des investigations conduit à faire l'hypothèse que les gallo-romains ont exploité, au fond du cratère, un trachyte compact dont on ne trouve aujourd'hui que les déchets de taille, et dont les affleurements sont masqués par les déblais, tandis que les artisans du Moyen Âge ont recherché un trachyte plus tendre dans les pentes hautes du cratère. Le Kilian doit donc s'ajouter aux trois sources actuellement connues de trachyte d'oeuvre dans le passé, à savoir les volcans Sarcoui, Aumône (ou petit Suchet) et Cliersou. Dès cette découverte, en 2008, s'est posée la question de savoir quelle part éventuelle le trachyte du Kilian avait pu prendre dans la construction du temple de Mercure au sommet du puy de Dôme et dans l'agglomération gallo-romaine située au col de Ceyssat. Pour y répondre, une campagne d'analyses géochimiques et pétrographiques été engagée pour caractériser, aux fins de comparaison, non seulement les trachytes du Kilian et ceux des ruines gallo-romaines, mais, de plus, les trachytes du Cliersou, de l'Aumône et du Sarcoui. Ces analyses ont finalement montré qu'il est possible de faire une discrimination statistiquement significative entre les différents trachytes étudiés, à l'exception de ceux du couple Cliersou-Aumône dont les laves sont très peu différentes les unes des autres. Le résultat le plus remarquable est que tous les trachytes gallo-romains échantillonnés (dont 10 échantillons distincts au temple de Mercure et 10 au col de Ceyssat) se rattachent sans ambiguïté au Kilian. En toute rigueur, ces nouvelles données ne permettent pas d'exclure sans appel la possibilité d'utilisation à l'époque gallo-romaine, au temple de Mercure et au col de Ceyssat, de trachytes provenant d'autres sources que le Kilian (cas des chaperons de mur du col de Ceyssat, provenant du puy de Dôme). Cependant, il faut ajouter qu'un examen visuel des trachytes d'oeuvre dans ces deux sites, portant sur un nombre de moellons et d'éléments architecturaux bien supérieur au nombre de ceux qui ont été analysés, conduit à conclure que leur source est probablement commune. Cette conclusion est basée sur un faciès minéralogique particulier, observable à l'oeil nu ou à la loupe.

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Fichiers liés : Rapport_DMiallier.pdf

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