Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : J. Mark CockLieven SterckPierre RouzéDelphine ScornetAndrew E. AllenGrigoris AmoutziasVéronique AnthouardFrançois ArtiguenaveJean-Marc AuryJonathan H BadgerBank BeszteriKenny BilliauEric BonnetJohn H. BothwellChris BowlerCatherine BoyenColin BrownleeCarl J CarranoBénédicte CharrierGa Youn ChoSusana M. CoelhoJonas CollénErwan CorreCorinne Da SilvaLudovic DelageNicolas DelaroqueSimon M. DittamiSylvie DoulbeauMarek EliasGarry FarnhamClaire M. M. GachonBernhard GschloesslSvenja HeeschKamel JabbariClaire JubinHiroshi KawaiKei KimuraBernard KloaregFrithjof C. KüpperDaniel LangAude Le BailCatherine LeblancPatrice LerougeMartin LohrPascal J LopezCindy MartensFlorian MaumusGurvan MichelDiego Miranda-SaavedraJulia MoralesHervé MoreauTaizo MotomuraChikako NagasatoCarolyn A NapoliDavid R NelsonPi Nyvall-CollénAkira F PetersCyril PommierPhilippe PotinJulie PoulainHadi QuesnevilleBetsy ReadStefan RensingAndrés RitterSylvie RousvoalManoj SamantaGaelle SamsonDeclan C SchroederBéatrice SegurensMartina StrittmatterThierry TononJames W TregearValentin KlausPeter von DassowTakahiro YamagishiYves van de PeerPatrick Wincker
• Organismes : Végétaux marins et biomolécules VIB-UGent Center for Plant Systems Biology VIB-UGent Center for Plant Systems Biology Végétaux marins et biomolécules J. Craig Venter Institute VIB-UGent Center for Plant Systems Biology Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité J. Craig Venter Institute Alfred-Wegener-Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung = Alfred Wegener Institute for Polar and Marine Research = Institut Alfred-Wegener pour la recherche polaire et marine VIB-UGent Center for Plant Systems Biology VIB-UGent Center for Plant Systems Biology Marine Biological Association Institut de biologie de l'ENS Paris Végétaux marins et biomolécules Marine Biological Association San Diego State University Végétaux marins et biomolécules Végétaux marins et biomolécules Végétaux marins et biomolécules Végétaux marins et biomolécules Adaptation et diversité en milieu marin Phophorylation de protéines et Pathologies Humaines Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité Végétaux marins et biomolécules Fraunhofer Institute for Cell Therapy and Immunology Végétaux marins et biomolécules Diversité et adaptation des plantes cultivées Univerzita Karlova [Praha, Česká republika] = Charles University [Prague, Czech Republic] Marine Biological Association Scottish Association for Marine Science Végétaux marins et biomolécules Végétaux marins et biomolécules Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Institut de biologie de l'ENS Paris Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Kobe University Institute of Algological Research [Muroran] Végétaux marins et biomolécules Scottish Association for Marine Science Fakultät für Biologie = Faculty of Biology [Freiburg] Végétaux marins et biomolécules Végétaux marins et biomolécules Station biologique de Roscoff [Roscoff] Laboratoire de Glycobiologie et Matrice Extracellulaire Végétale Johannes Gutenberg - Universität Mainz = Johannes Gutenberg University École normale supérieure - Paris VIB-UGent Center for Plant Systems Biology Institut de biologie de l'Ecole Normale Supérieure Végétaux marins et biomolécules Department of Haematology Mer et santé Observatoire océanologique de Banyuls Institute of Algological Research [Muroran] Institute of Algological Research [Muroran] University of Arizona The University of Tennessee Health Science Center [Memphis] Végétaux marins et biomolécules Végétaux marins et biomolécules Unité de Recherche Génomique Info Végétaux marins et biomolécules Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Unité de Recherche Génomique Info California State University [Los Angeles] Fakultät für Biologie = Faculty of Biology [Freiburg] Végétaux marins et biomolécules Laboratoire de Biotechnologie et Chimie Marines Végétaux marins et biomolécules Systemix Institute Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Marine Biological Association Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Scottish Association for Marine Science Végétaux marins et biomolécules Diversité et adaptation des plantes cultivées Alfred-Wegener-Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung = Alfred Wegener Institute for Polar and Marine Research = Institut Alfred-Wegener pour la recherche polaire et marine Station biologique de Roscoff [Roscoff] Kobe University VIB-UGent Center for Plant Systems Biology Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
• Publié dans Nature le 29/10/2020

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Résumé : Brown algae (Phaeophyceae) are complex photosynthetic organisms with a very different evolutionary history to green plants, to which they are only distantly related(1). These seaweeds are the dominant species in rocky coastal ecosystems and they exhibit many interesting adaptations to these, often harsh, environments. Brown algae are also one of only a small number of eukaryotic lineages that have evolved complex multicellularity (Fig. 1). We report the 214 million base pair (Mbp) genome sequence of the filamentous seaweed Ectocarpus siliculosus (Dillwyn) Lyngbye, a model organism for brown algae(2-5), closely related to the kelps(6,7) (Fig. 1). Genome features such as the presence of an extended set of light-harvesting and pigment biosynthesis genes and new metabolic processes such as halide metabolism help explain the ability of this organism to cope with the highly variable tidal environment. The evolution of multicellularity in this lineage is correlated with the presence of a rich array of signal transduction genes. Of particular interest is the presence of a family of receptor kinases, as the independent evolution of related molecules has been linked with the emergence of multicellularity in both the animal and green plant lineages. The Ectocarpus genome sequence represents an important step towards developing this organism as a model species, providing the possibility to combine genomic and genetic(2) approaches to explore these and other(4,5) aspects of brown algal biology further.

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Fichiers liés : Coc.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Maryvonne Arnaud.Daniel BougnouxJean-Pierre ChambonLuc GwiazdzinskiBernard MalletPhilippe MouillonHenry Torgue. Xochipilli
• Organismes : Pacte, Laboratoire de sciences sociales
• Publié dans Local contemporain le 26/10/2020

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Résumé : Quelle est aujourd'hui la place de la foule ? Pourquoi assiste-t-on à un effondrement de la pensée de la foule après un siècle dédié aux masses ? La foule est-elle une survivance désuète, active seulement dans les mégapoles du sud ? Qu'est-ce, au fond, qu'une foule ? Qu'est-ce qui différencie les foules choisies des foules involontaires ? Pourquoi les aménageurs urbains rêvent-ils d'attirer des foules plus nombreuses grâce à de nouveaux événements ? La foule fait-elle la ville ? Ou est-ce la ville qui invente la foule ? C'est à ce type de questions que répondent les auteurs, à travers quatre parties : L'épreuve du nombre (une physique des foules) ; Le grand corps du multiple (une biologie des foules) ; Humeurs et intelligences (une grammaire émotionnelle des foules) ; Messes et masses (une économie politique des foules).

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Prince K. XavierJean-Philippe DuvelPascale BraconnotF.J. Doblas-Reyes
• Organismes : Laboratoire de Météorologie Dynamique (UMR 8539) Laboratoire de Météorologie Dynamique (UMR 8539) Modelling the Earth Response to Multiple Anthropogenic Interactions and Dynamics European Centre for Medium-Range Weather Forecasts
• Publié dans Journal of Climate le 02/11/2020

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Résumé : The intraseasonal variability (ISV) is an intermittent phenomenon with variable perturbation patterns. To assess the robustness of the simulated ISV in climate models, it is thus interesting to consider the distribution of perturbation patterns rather than only one average pattern. To inspect this distribution, the authors first introduce a distance that measures the similarity between two patterns. The reproducibility (realism) of the simulated intraseasonal patterns is then defined as the distribution of distances between each pattern and the average simulated (observed) pattern. A good reproducibility is required to analyze the physical source of the simulated disturbances. The realism distribution is required to estimate the proportion of simulated events that have a perturbation pattern similar to observed patterns. The median value of this realism distribution is introduced as an ISV metric. The reproducibility and realism distributions are used to evaluate boreal summer ISV of precipitations over the Indian Ocean for 19 phase 3 of the Coupled Model Intercomparison Project (CMIP3) models. The 19 models are classified in increasing ISV metric order. In agreement with previous studies, the four best ISV metrics are obtained for models having a convective closure totally or partly based on the moisture convergence. Models with high metric values (poorly realistic) tend to give (i) poorly reproducible intraseasonal patterns, (ii) rainfall perturbations poorly organized at large scales, (iii) small day-to-day variability with overly red temporal spectra, and (iv) less accurate summer monsoon rainfall distribution. This confirms that the ISV is an important link in the seamless system that connects weather and climate. © 2010 American Meteorological Society.

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Fichiers liés : 2010JCLI3260.pdf

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• Type de publi. : Chapître d'ouvrage
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Yonghua Li-BeissonBasil ShorroshFred BeissonMats X. AnderssonVincent ArondelPhilippe D. BatesSébastien BaudDavid BirdAllan DebonoTimithy P. DurrettRochus B. FrankeIan A. GrahamKenta KatayamaAmelie A. KellyTony LarsonJonathan E. MarkhamMartine MiquelIsabel MolinaIkuo NishidaOwen RowlandLacey SamuelsKatherine M. SchmidHajime WadaRuth WeltiChangcheng XuRémi ZallotJohn Ohlrogge
• Organismes : Environnement, Bioénergie, Microalgues et Plantes Wirestone L.L.C. Environnement, Bioénergie, Microalgues et Plantes Department of Plant and Environmental Sciences Laboratoire de biogenèse membranaire Institute of Biological Chemistry Institut Jean-Pierre Bourgin Department of Chemical and Biological Sciences Independent Michigan State University [East Lansing] Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn Centre for Novel Agricultural Products, Department of Biology Independent University of Warwick [Coventry] Centre for Novel Agricultural Products, Department of Biology Donald Danforth Plant Science Center Institut Jean-Pierre Bourgin Algoma University Saitama University Department of Biology and Institute of Biochemistry Department of Botany Butler University The University of Tokyo Kansas Lipidomics Research Center, Division of Biology Brookhaven National Laboratory [Upton, NY] Laboratoire de biogenèse membranaire Independent

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Résumé : Lipides acyle dans Arabidopsis et toutes les autres plantes ont une myriade de fonctions diverses. Il s'agit notamment de fournir la barrière de diffusion de base des membranes qui sépare les cellules et les organites subcellulaires. Cette fonction implique seuls plus de 10 classes de lipides membranaires, y compris les phospholipides, galactolipides, et sphingolipides, et au sein de chaque classe, les variations dans la composition de la chaîne acyle augmenter le nombre de structures à plusieurs centaines de possibles espèces moléculaires. Lipides acyle dans le sous forme de compte triacylglycérol de 35% du poids de graines d'Arabidopsis et représentent leur forme majeure de carbone et de stockage d'énergie. Une couche de cutine et les cires cuticulaires qui limite la perte d'eau et offre une protection contre les invasions par des agents pathogènes et autres stress recouvre toute la surface aérienne d'Arabidopsis. Des fonctions similaires sont fournis par la subérine et des cires associés qui sont localisées dans les racines, les téguments et les zones d'abscission et sont produites en réponse à une blessure. Ce chapitre se concentre sur les voies métaboliques qui sont associés à la biosynthèse et la dégradation des lipides acyle mentionnés ci-dessus. Ces voies, les enzymes et les gènes sont également présentés en détail dans un site Web associé (ARALIP: http://aralip.plantbiology.msu.edu/ ). Protocoles et méthodes utilisés pour l'analyse des lipides Arabidopsis sont fournis. Enfin, un résumé détaillé de la composition des lipides Arabidopsis est fourni en trois chiffres et 15 tables.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Philippe RicaudBenjamin GabardSolène DerrienJean-Pierre ChaboureauThomas RoseAndreas MombauerHarald Czekala
• Organismes : Laboratoire d'aérologie Laboratoire d'aérologie Centre de Recherches Atmosphériques Laboratoire d'aérologie Fraunhofer Institute for Applied Information Technology RPG Radiometer Physics GmbH
• Publié dans IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing le 31/10/2020

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Résumé : The H2O Antarctica Microwave Stratospheric and Tropospheric Radiometers (HAMSTRAD) program aims to develop two ground-based microwave radiometers to sound tropospheric and stratospheric water vapor (H2O) above Dome C (Concordia Station), Antarctica (75??06' S, 123??21'E, 3233 m asml), an extremely cold and dry environment, over decades. By using state-of-the-art technology, the HAMSTRAD-Tropo radiometer uses spectral information in the domains 51-59 GHz (oxygen line) and 169-197 GHz (water vapor line) to derive accurate tropospheric profiles of temperature (with accuracy ranging from 1 to 2 K) and low absolute humidity (with accuracy ranging from 0.02 to 0.05 g ?? m-3), together with integrated water vapor (with accuracy of about 0.008 kg ?? m-2) and liquid water path. Prior to its installation at Dome C in January 2009, the fully automated radiometer has been deployed at the Pic du Midi (PdM, 42??56'N, 0??08'E, 2877 m asml, France) in February 2008 and was in operation for five months. Preliminary comparisons with radio soundings particularly launched in the vicinity of PdM in February 2008 and the outputs from the mesoscale MESO-NH model show a great consistency to within 0.2-0.3 g ?? m-3 between all absolute humidity data sets whatever the atmosphere considered (extremely dry or wet).

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Fichiers liés : Ricaud2010.pdf

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• Type de publi. : Rapport
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Jean-Christophe PagèsJean-Jacques LeguayYves BertheauPascal BoireauDenis BourguetFlorence CoignardFrançois ColénoJean-Luc DarlixElie DassaMaryse DeguergueHubert De VerneuilRobert DrillienAnne Dubart-KupperchmittNicolas FerryPhilippe GuercheClaudine FrancheJoël GuillemainMireille JacquemondAndré JestinBernard KlonjkowskiMarc LavielleJane LecomteOlivier Le GallStéphane LemariéDidier LereclusRémy MaximilienAntoine MesséanBertrand NeyJacques PagèsDaniel ParzyCatherine Regnault-RogerPierre RougéPatrick SaindrenanPascal SimonetVirginie TournayBernard E. VaissièreJean-Luc Vilotte
• Organismes : Institut Jean-Pierre Bourgin

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Résumé : Paris, le 14 octobre 2010 A V I S en réponse à la saisine 1 091201-saisine HCB-info compl oeillets concernant notamment le dossier C/NL/97/13-01. Le Haut Conseil des biotechnologies (HCB) a été saisi le 5 décembre 2009 par les autorités compétentes françaises (le Ministère de l'alimentation, de l'agriculture et de la pêche) d'une demande d'avis relative à une évaluation du dossier C/NL/97/13-01 de demande de renouvellement d'autorisation d'importation d'oeillets sous forme de fleurs coupées à des fins ornementales. Ce dossier a été déposé par la société Florigene Pty Limited dans le cadre de la directive 2001/18/CE auprès des autorités compétentes hollandaises, sous le référence C/NL/97/13-01. La saisine du HCB correspondante est référencée 091221-saisine HCB-info compl oeillets. Le Comité scientifique (CS) 2 du HCB a procédé à l'examen du dossier le 3 septembre 2010 sous la présidence de Jean-Christophe Pagès. 1 La saisine « 091221-saisine HCB-info compl oeillets » est reproduite dans l'Annexe 1. 2 La composition du CS ainsi que le rapporteur externe ayant contribué à l'élaboration de l'avis sont indiqués dans l'Annexe 2.

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Fichiers liés : 101026oeilletc-nl-97-13-01aviscshcb.pdf

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• Type de publi. : Rapport
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Jean-Christophe PagèsJean-Jacques LeguayYves BertheauPascal BoireauDenis BourguetFlorence CoignardFrançois ColénoJean-Luc DarlixElie DassaMaryse DeguergueHubert De VerneuilRobert DrillienAnne Dubart-KupperchmittNicolas FerryClaudine FranchePhilippe GuercheJoël GuillemainMireille JacquemondAndré JestinBernard KlonjkowskiMarc LavielleJane LecomteOlivier Le GallStéphane LemariéDidier LereclusRémy MaximilienAntoine MesséanBertrand NeyJacques PagèsDaniel ParzyCatherine Regnault-RogerPierre RougéPatrick SaindrenanPascal SimonetVirginie TournayBernard E. VaissièreJean-Luc Vilotte
• Organismes : Institut Jean-Pierre Bourgin

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Résumé : Paris, le 26 octobre 2010 A V I S en réponse à la saisine 1 100605-saisine HCB-décret déclaration sur le projet de décret relatif à la mise en culture de végétaux génétiquement modifiés Le Haut Conseil des biotechnologies (HCB) a été saisi le 20 juillet 2010 par les autorités compétentes françaises (le Ministère de l'alimentation, de l'agriculture et de la pêche) d'une demande d'avis sur un projet de décret relatif à la mise en culture de végétaux génétiquement modifiés. Le Comité scientifique (CS) 2 du HCB a procédé à l'examen du projet de décret le 22 septembre 2010 sous la présidence de Jean-Christophe Pagès. 1 La saisine « 100605-saisine HCB-décret déclaration » est reproduite dans l'Annexe 1. 2 La composition du CS est indiqué dans l'Annexe 2.

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Fichiers liés : 101216decretdeclarationmiseencultureaviscshcb.pdf

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• Type de publi. : Chapître d'ouvrage
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : René QuiniouLucie CallensGuy CarraultMarie-Odile CordierElisa FromontPhilippe MaboFrançois Portet
• Organismes : Diagnosing, Recommending Actions and Modelling Diagnosing, Recommending Actions and Modelling Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image Diagnosing, Recommending Actions and Modelling Laboratoire Hubert Curien Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image Service de cardiologie et maladies vasculaires [Rennes] = Cardiac, Thoracic, and Vascular Surgery [Rennes] Laboratoire d'Informatique de Grenoble

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Résumé : Monitoring patients in intensive care units is a critical task. Simple condition detection is generally insufficient to diagnose a patient and may generate many false alarms to the clinician operator. Deeper knowledge is needed to discriminate among the flow of alarms those that necessitate urgent therapeutic action. Overall, it is important to take into account the monitoring context: sensor and signal context (are the signal data noisy or clear?), the patient condition (is the state of the patient evolving or stable? is the condition of the patient critical or safe?), the environmental context (do the external conditions influence the patient condition or not?). To achieve the best surveillance as possible, we propose an intelligent monitoring system that makes use of several artificial intelligence techniques: artificial neural networks for signal processing and temporal abstraction, temporal reasoning, model based diagnosis, decision rule based system for adaptivity and machine learning for knowledge acquisition. To tackle the difficulty of taking context change into account, we introduce a pilot aiming at adapting the system behavior by reconfiguring or tuning the parameters of the system modules. A prototype has been implemented and is currently experimented and evaluated. Some results, showing the benefits of the approach, are given.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Frédéric LévyRaymond NowakPhilippe Chemineau
• Organismes : Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly]
• Publié dans Hormones and Behavior le 26/10/2020

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Résumé : absent

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2010
• Auteurs : Romain PhilippeBrigitte CourtoisPierre MournetDenis FabreClaire BillotJean Christophe GlaszmannDominique ThisRedouane R. El-MalkiMarie-Christine Le PaslierDominique Brunel
• Organismes : Unité de Génétique Moléculaire Animale Développement et amélioration des plantes Développement et amélioration des plantes Développement et amélioration des plantes Développement et amélioration des plantes Développement et amélioration des plantes Développement et amélioration des plantes Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux
• Publié dans TAG Theoretical and Applied Genetics le 01/11/2020

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Résumé : Asr (ABA, stress, ripening) genes represent a small gene family potentially involved in drought tolerance in several plant species. To analyze their interest for rice breeding for water-limited environments, this gene family was characterized further. Genomic organization of the gene family reveals six members located on four different chromosomes and with the same exon-intron structure. The maintenance of six members of the Asr gene family, which are the result of combination between tandem duplication and whole genome duplication, and their differential regulation under water stress, involves probably some sub-functionalization. The polymorphism of four members was studied in a worldwide collection of 204 accessions of Oryza sativa L. and 14 accessions of wild relatives (O. rufipogon and O. nivara). The nucleotide diversity of the Asr genes was globally low, but contrasted for the different genes, leading to different shapes of haplotype networks. Statistical tests for neutrality were used and compared to their distribution in a set of 111 reference genes spread across the genome, derived from another published study. Asr3 diversity exhibited a pattern concordant with a balancing selection at the species level and with a directional selection in the tropical japonica sub-group. This study provides a thorough description of the organization of the Asr family, and the nucleotide and haplotype diversity of four Asr in Oryza sativa species. Asr3 stood out as the best potential candidate. The polymorphism detected here represents a first step towards an association study between genetic polymorphisms of this gene family and variation in drought tolerance traits

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