Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2008
• Auteurs : Pierre AbadJerome GouzyJean-Marc AuryPhilippe Castagnone-SerenoEtienne G.J. DanchinEmeline DeleuryLaetitia Perfus-BarbeochVéronique AnthouardFrançois ArtiguenaveVivian C. BlokMarie-Cécile CaillaudPedro M CoutinhoCorinne Da SilvaFrancesca de LucaFlorence DeauMagali EsquibetTimothée FlutreJared V. GoldstoneNoureddine HamamouchTarek HeweziOlivier JaillonClaire JubinPaola LeonettiMarc MaglianoTom R. MaierGabriel V. MarkovPaul McveighGraziano PesoleJulie PoulainMarc Robinson-RechaviErika SalletBéatrice SegurensDelphine SteinbachTom TytgatEdgardo UgarteCyril van GhelderPasqua VeronicoThomas J. BaumMark BlaxterTeresa Bleve-ZacheoEric L. DavisJ.J. EwbankBruno FaveryEric GrenierBernard HenrissatJohn T. JonesVincent LaudetAaron G. MauleHadi QuesnevilleMarie-Noëlle RossoThomas SchiexGeert SmantJean WeissenbachPatrick Wincker
• Organismes : Interactions Biotiques et Santé Végétale Laboratoire des interactions plantes micro-organismes Génomique métabolique Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité Interactions Biotiques et Santé Végétale Interactions Biotiques et Santé Végétale Interactions Biotiques et Santé Végétale Interactions plantes-microorganismes et santé végétale Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Scottish Crop Research Institute Interactions Biotiques et Santé Végétale Architecture et fonction des macromolécules biologiques Génomique métabolique Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité Istituto per la Protezione delle Piante Interactions Biotiques et Santé Végétale Biologie des organismes et des populations appliquées à la protection des plantes Unité de Recherche Génomique Info Biology Department Department of Plant Pathology Department of Plant Pathology Génomique métabolique Génomique métabolique Istituto per la Protezione delle Piante Interactions Biotiques et Santé Végétale Department of Plant Pathology School of Biological Sciences Dipartimento di Biochimica e Biologia moleculare Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Department of Ecology and Evolution Laboratoire des interactions plantes micro-organismes Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Unité de Recherche Génomique Info Laboratory of Nematology Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] Interactions Biotiques et Santé Végétale Istituto per la Protezione delle Piante Department of Plant Pathology Institute of Evolutionary Biology Istituto per la Protezione delle Piante North Carolina State University [Raleigh] Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Interactions Biotiques et Santé Végétale Biologie des organismes et des populations appliquées à la protection des plantes Centre National de la Recherche Scientifique Scottish Crop Research Institute Université Claude Bernard Lyon 1 School of Biolgical Sciences Unité de Recherche Génomique Info Interactions Biotiques et Santé Végétale Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (ancêtre de MIAT) Wageningen University and Research [Wageningen] Génomique métabolique Génomique métabolique
• Publié dans Nature Biotechnology le 29/10/2020

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Résumé : Plant-parasitic nematodes are major agricultural pests worldwide and novel approaches to control them are sorely needed. We report the draft genome sequence of the root-knot nematode Meloidogyne incognita, a biotrophic parasite of many crops, including tomato, cotton and coffee. Most of the assembled sequence of this asexually reproducing nematode, totaling 86 Mb, exists in pairs of homologous but divergent segments. This suggests that ancient allelic regions in M. incognita are evolving toward effective haploidy, permitting new mechanisms of adaptation. The number and diversity of plant cell wall-degrading enzymes in M. incognita is unprecedented in any animal for which a genome sequence is available, and may derive from multiple horizontal gene transfers from bacterial sources. Our results provide insights into the adaptations required by metazoans to successfully parasitize immunocompetent plants, and open the way for discovering new antiparasitic strategies

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• Type de publi. : Chapître d'ouvrage
• Date de publi. : 01/01/2008
• Auteurs : Philippe Martin
• Organismes : LAboratoire de Recherche Historique Rhône-Alpes - UMR5190

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2008
• Auteurs : David PechPhilippe SteyerJean-Pierre Millet
• Organismes : Matériaux, ingénierie et science [Villeurbanne] Matériaux, ingénierie et science [Villeurbanne] Matériaux, ingénierie et science [Villeurbanne]
• Publié dans Corrosion Science le 30/10/2020

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Résumé : Amorphous silica coatings have been deposited by plasma assisted chemical vapor deposition (PACVD) process on M2 steel and 304 stainless steel substrates. The chemical inertia of the coating has been established by resonant quartz crystal microbalance (RQCM), and no porosity has been observed at the AFM scale. The barrier effect has been evaluated on M2 steel by applying the concept of dipolar relaxation. The protection is very efficient, and no deleterious galvanic coupling with the uncoated metallic surface can occur. A coated stainless steel was also investigated in NaCl solution in order to understand how the passive properties are influenced by such a barrier coating. When deposited on stainless steel, coated part keeps the beneficial passive behaviour inherent to the substrate. They evidence almost no corrosion. The silica based layer behaves as a quasi perfect dielectric. The corrosion rate is then greatly reduced, and the pitting resistance is improved. The excellent localized corrosion protection has been explained by a tiny porosity rate, and a limited access of chloride ions through open pores.

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 01/01/2008
• Auteurs : Philippe LerichePierre FrèreEmilie RipaudAntonio CravinoOlivier AlévêqueJean Roncali
• Organismes : MOLTECH-Anjou MOLTECH-Anjou MOLTECH-Anjou MOLTECH-Anjou MOLTECH-Anjou

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2008
• Auteurs : Philippe DebaekeMagali WillaumePierre CasadebaigJean Marie Nolot
• Organismes : AGroécologie, Innovations, teRritoires AGroécologie, Innovations, teRritoires AGroécologie, Innovations, teRritoires Domaine expérimental d'Auzeville
• Publié dans Innovations Agronomiques le 24/10/2020

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Résumé : Pour raisonner les systèmes de culture en fonction de la disponibilité en eau, certains éléments de stratégie peuvent d’ores et déjà être mobilisés par l’agronome. Le choix de cultures (espèces, variétés) peut être réfléchi en fonction de la ressource (privilégier les cultures d’hiver, les espèces tolérantes). L’outil LORA permet d’allouer la ressource en eau de manière optimale au sein de l’assolement irrigué. La gestion de la disponibilité en eau peut également consister en une maximisation du stockage de l’eau au semis, la modification du positionnement du cycle cultural pour esquiver la sécheresse (date de semis anticipée, variétés précoces) ou la réduction des besoins en eau des cultures par une stratégie de rationnement (densité de peuplement, fertilisation). Des travaux de recherche sont menés à l’INRA Toulouse dans ce cadre. Le projet SGCI a permis d’explorer trois stratégies agronomiques contrastées par la disponibilité en eau d’irrigation, d’établir des règles de décision pour le choix de la culture, de la variété et des autres opérations culturales. Un modèle de simulation du tournesol a permis d’explorer le comportement variétal pour différents contextes hydriques. Les besoins de recherche dans le domaine sont encore importants : élaboration de nouvelles références, modélisation de la réponse à l’eau d’une gamme large de systèmes de culture pour leur évaluation virtuelle, expérimentation au champ de systèmes de culture adaptés ex ante à la raréfaction des ressources en eau.

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Fichiers liés : Debaeke2008a.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2008
• Auteurs : Pierre BuffièreSylvain FrédéricBruno MartyJean-Philippe Delgenès
• Organismes : Laboratoire de Génie Civil et d'Ingénierie Environnementale Naskeo Environnement Naskeo Environnement Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne]
• Publié dans Water Science and Technology le 26/10/2020

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Résumé : The calculation of the anaerobic biodegradability requires the knowledge of the COD of the organic waste considered. Unfortunately, standard COD measurements are not available for solid wastes. In addition, sample processing generally requires a drying step (for TS and VS assessment for instance). What is shown here is that important amounts of COD might be lost upon drying (around 30% in the case of spent apples). We propose an alternate method based on the separation of the waste in two fractions: water soluble (WS) and non water soluble (NWS, particulate). The two fractions have been characterized individually and both the COD and the biodegradability could be assessed with a greater accuracy. For spent apples, the biodegradability of the NWS fraction is much lower than that of the WS fraction (36.6% vs. 95.2%), and can be well predicted from a previously established model based on the measurement of the cellulose and lignin fractions.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2008
• Auteurs : David AntoinePierre GuevelJean-Francois DesteGuislain BecuFrancis LouisAlec J. ScottPhilippe Bardey
• Organismes : Laboratoire d'océanographie de Villefranche Principia Marine Laboratoire d’Optique Atmosphérique - UMR 8518 Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer Laboratoire d'océanographie de Villefranche ACRI
• Publié dans Journal of Atmospheric and Oceanic Technology le 02/11/2020

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Résumé : A new concept of oceanographic data buoy is described, which couples a taut mooring and a ``transparent-to-swell'' superstructure, and is specifically designed for the collection of radiometric quantities in offshore environments. The design of the thin superstructure addresses two major requirements: stabilizing the instruments in the water column and avoiding shading them. The development of the buoy is described, starting with the theoretical assessment and then describing the various stages of development leading to the latest version of the mooring and buoy. Its performance at sea is also analyzed. This new platform has been deployed in the deep waters (>2400 m) of the northwestern Mediterranean Sea for about 4 yr (since September 2003) and provides a quasi-continuous record of optical properties at this site. The data are used for bio-optics research and for calibration and validation operations of several European and U. S. ocean color satellite missions. The plan is to continue the deployment to build a decadal time series of optical properties. The instrument suite that is installed on this buoy is also briefly described, and sample results are shown to demonstrate the ability of this new system to collect the data at the desired frequency and quality.

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Fichiers liés : [15200426 - Journal of Atmospheric and Oceanic Technology] The “BOUSSOLE” Buoy—A New Transparent-to-Swell Taut Mooring Dedicated to Marine Optics Design, Tests, and Performance at Sea.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2008
• Auteurs : Sébastien LyonnaisLaurence Goux-CapesChristophe EscudeDenis CôteArianna FiloramoJean-Philippe Bourgoin
• Organismes : Laboratoire d'Electronique Moléculaire Laboratoire d'Electronique Moléculaire Acides nucléiques : dynamique, ciblage, et fonctions biologiques - Régulation et dynamique des génomes Laboratoire Pierre Aigrain Laboratoire d'Electronique Moléculaire Laboratoire d'Electronique Moléculaire
• Publié dans Small le 30/10/2020

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2008
• Auteurs : Pierre RousseauJean-Philippe SteyerEveline VolckeNicolas BernetFabrice Beline
• Organismes : Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture
• Publié dans e-STA Sciences et Technologies de l’Automatique le 31/10/2020

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Résumé : Dans le cadre de l’industrialisation de l’élevage porcin en Bretagne et face à l’augmentation des couts énergétiques, un procédé de traitement du lisier de porcs associant la digestion anaérobie et le traitement de l’azote par boues activées a été développé. Cependant, face à la complexité du système et des processus mis en jeu, l’optimisation expérimentale du procédé s’avère difficile. Une approche numérique a donc été développée afin d’optimiser cette filière de traitement. Une version modifiée du modèle ASM prenant en compte les spécificités du substrat a été utilisée. Le modèle ADM pour la digestion anaérobie a été modifié pour prendre en compte la possibilité de dénitrifier dans le digesteur. Les processus physico-chimiques liés à la dénitrification (pH, transfert liquide-gaz) ont également été pris en compte. Enfin, une interface permettant de faire communiquer les deux modèles a été mise en place Celle-ci optimise la répartition de la DCO et de l’azote entre les deux modèles. Cependant, afin de garantir les bilans matières à l’interface, certaines hypothèses ont dues être avancées et nécessiteront d’être vérifiées.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2008
• Auteurs : Serge LekounougouJean-Pierre JacquotPhilippe GerardinÉric Gelhaye
• Organismes : Interactions Arbres-Microorganismes Laboratoire d’Etude et de Recherche sur le Matériau Bois Interactions Arbres-Microorganismes Laboratoire d’Etude et de Recherche sur le Matériau Bois Interactions Arbres-Microorganismes
• Publié dans Wood Science and Technology le 27/10/2020

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Résumé : The effects of propiconazole on extra-cellular enzyme levels in Trametes versicolor have been investigated during wood colonization and degradation. The working hypothesis was that the biocide could alter metabolic pathways, which could lead to an alteration of extra-cellular enzyme production. In the presence of a propiconazole sub-lethal concentration, the wood degradation rate decrease concomitantly with the lag phase of fungal development observed during wood colonisation. The pattern of production of enzymes involved in polysaccharide degradation (b-glucosidases, glucuronidases, cellobiohydrolases), nitrogen (leucine aminopeptidase) and phosphorus (acid phosphatase) mobilization was only slightly altered in the presence of the biocide. In experiments performed in the presence of propiconazole, there was a strong induction of chitinases at the beginning of the colonization process. Addition of caffeine, a pleiotropic drug, which is also a chitinase inhibitor, together with propiconazole resulted in synergistic inhibition of the fungal growth. The implication of these results in the development of a new wood preservation strategy is discussed.

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