Philippe JEAN-PIERRE

---

• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2006
• Auteurs : Roland Ivanyi-NagyIgor KanevskyCaroline GabusJean-Pierre LavergneDamien FicheuxFrancois PeninPhilippe FosséJean-Luc Darlix
• Organismes : Virologie humaine Laboratoire de Biologie et de Pharmacologie Appliquée Virologie humaine Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] Laboratoire de Biologie et de Pharmacologie Appliquée Virologie humaine
• Publié dans Nucleic Acids Research le 26/10/2020

---

Résumé : The core protein of hepatitis C virus (HCV) has been shown previously to act as a potent nucleic acid chaperone in vitro, promoting the dimerization of the 3'-untranslated region (3'-UTR) of the HCV genomic RNA, a process probably mediated by a small, highly conserved palindromic RNA motif, named DLS (dimer linkage sequence) [G. Cristofari, R. Ivanyi-Nagy, C. Gabus, S. Boulant, J. P. Lavergne, F. Penin and J. L. Darlix (2004) Nucleic Acids Res., 32, 2623-2631]. To investigate in depth HCV RNA dimerization, we generated a series of point mutations in the DLS region. We find that both the plus-strand 3'-UTR and the complementary minus-strand RNA can dimerize in the presence of core protein, while mutations in the DLS (among them a single point mutation that abolished RNA replication in a HCV subgenomic replicon system) completely abrogate dimerization. Structural probing of plus- and minus-strand RNAs, in their monomeric and dimeric forms, indicate that the DLS is the major if not the sole determinant of UTR RNA dimerization. Furthermore, the N-terminal basic amino acid clusters of core protein were found to be sufficient to induce dimerization, suggesting that they retain full RNA chaperone activity. These findings may have important consequences for understanding the HCV replicative cycle and the genetic variability of the virus.

---

Source

---

• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2006
• Auteurs : Valérie DescampsSébastien ColinMarc LahayeMurielle JamChristophe RichardPhilippe PotinTristan BarbeyronJean-Claude YvinBernard Kloareg
• Organismes : Signaux oligosaccharidiques et lipidiques Signaux oligosaccharidiques et lipidiques Laboratoire de biochimie et technologie des glucides Signaux oligosaccharidiques et lipidiques Signaux oligosaccharidiques et lipidiques Signaux oligosaccharidiques et lipidiques Signaux oligosaccharidiques et lipidiques Signaux oligosaccharidiques et lipidiques Signaux oligosaccharidiques et lipidiques
• Publié dans Marine Biotechnology le 28/10/2020

---

Résumé : Fucoidans are matrix polysaccharides from marine brown algae, consisting of an alpha-L-fucose backbone substituted by sulfate- ester groups and masked with ramifications containing other monosaccharide residues. In spite of their interest as biologically active compounds in a number of homologous and heterologous systems, no convenient sources with fucanase activity are available yet for the degradation of the fucalean algae. We here report on the isolation, characterization, and culture conditions of a bacterial strain capable of degrading various brown algal fucoidans. This bacterium, a member of the family Flavobacteriaceae, was shown to secrete fucoidan endo-hydrolase activity. An extracellular enzyme preparation was used to degrade the fucoidan from the brown alga Pelvetia canaliculata. End products included a tetrasaccharide and a hexasaccharide made of the repetition of disaccharidic units consisting of alpha- 1 --> 3- L-fucopyranose-2-sulfate-alpha-1-->4- L-fucopyranose- 2,3- disulfate, with the 3- linked residues at the nonreducing end.

---

Source

---

• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 01/01/2006
• Auteurs : François BaudinPhilippe BertrandLaetitia PichevinRaphaël BlankeJulie TranierJean-Robert DisnarElisabeth Lallier-VergèsFrans van BuchemMohammed BoussafirPhilippe MartinezFrançois Fröhlich
• Organismes : Paléobiodiversité et paléoenvironnements Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques Institut des Sciences de la Terre d'Orléans Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques Institut des Sciences de la Terre d'Orléans Institut des Sciences de la Terre d'Orléans IFP Energies nouvelles Institut des Sciences de la Terre d'Orléans Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques Histoire naturelle de l'Homme préhistorique

---

Résumé : La marge Sud-Est Atlantique est le siège d'une accumulation très importante de carbone organique durant les derniers cycles climatiques ; les teneurs y étant parmi les plus élevées du monde pour des sédiments océaniques profonds. Trois thèses ont été menées dans le cadre du GDR Marges Continentales pour tenter de mieux comprendre la dynamique de la sédimentation organique profonde dans cette partie de l'Océan Atlantique –qui est aussi la plus oxygénée du monde– afin de raffiner les modèles de dépôt des roches mères pétrolières dans l'offshore profond. La première thèse s'est intéressée à l'enregistrement temporel (400 000 ans) de la sédimentation organique le long de la pente au dessus de la cellule d'upwelling la plus active (Pichevin, 2004). La seconde s'est attachée à comprendre la répartition spatiale de la sédimentation organique à l'échelle de toute la marge Sud-Est Atlantique depuis le dernier maximum glaciaire jusqu'à l'Optimum climatique Holocène (Blanke, 2004). Enfin, la troisième thèse a intégré les données issues des deux premières dans une approche modélisatrice de la sédimentation organique en contexte d'upwelling (Tranier, 2006). Il ressort de ces études que l'enfouissement de carbone organique sur la pente continentale était plus efficace pendant les périodes glaciaires du fait d'un accroissement des flux de matière organique exportée. Cette augmentation des flux agit positivement sur l'initiation de mécanismes de fossilisation tels que la sulfuration naturelle. Les variations eustatiques ont partiellement gouverné l'exportation de carbone organique vers la pente continentale supérieure en déplaçant vers le large la zone de productivité maximum pendant les bas niveaux marins. L'approche modélisatrice permet de quantifier les stocks de carbone ainsi fossilisés, ce qui présente un intérêt tant du point de vue académique –impact sur le cycle du carbone– qu'industriel –nature et distribution des roches-mères pétrolières du deep offshore–.

---

Source

---

• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 01/01/2006
• Auteurs : Philippe LasayguesEric DebieuJean-Pierre Lefebvre
• Organismes : Laboratoire de Mécanique et d'Acoustique [Marseille] Laboratoire de Mécanique et d'Acoustique [Marseille] Laboratoire de Mécanique et d'Acoustique [Marseille]

---

Résumé : L'échographie s'est imposée depuis longtemps comme l'examen de première intention pour le diagnostic des maladies ostéoarticulaires chez l'enfant (par ex. pour la dysplasie de hanche). En effet, les autres modalités (tomodensitométrie, IRM, ...) sont associées à des inconvénients variables, coût, irradiation, sédation, accessibilité,..souvent contraignants pour les applications pédiatriques. L'échographie est non-invasive, non-irradiante, indolore, peu onéreuse et réalisable au lit du patient. Toutefois, son utilisation en pédiatrie repose sur un matériel standard mal adapté aux zones explorées (hanche, fontanelle, vertèbres, os longs) et les échographes cliniques ne présentent pas de performances particulières (gain, amplification, dimension des sondes, résolutions des images,...). Plusieurs facteurs en limitent principalement l'extension : les fréquences d'examen utilisées en pratique médicale courante (les mêmes que pour les adultes), les phénomènes de propagation liés aux variations parfois importantes des paramètres acoustiques entre les tissus. Depuis plusieurs années, nous nous intéressons à la tomographie ultrasonore, qui apparaît comme une alternative possible aux limites de l'échographie clinique. La méthode mise au point, in vitro, pour des fémurs et des vertèbres adultes, a donné des résultats pertinents. Nous orientons nos travaux vers l'imagerie pédiatrique et dans cet article, nous présenterons les premiers tomogrammes obtenus sur des péronés et sur des fémurs d'enfants.

---

Fichiers liés : TomoOsEnfant.pdf

---

Source

---

• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 01/01/2006
• Auteurs : Benoit ThuilotEric RoyerFrançois MarmoitonPhilippe MartinetMichel DhomeMaxime LhuillierJean-Marc LavestLaurent MalaterreSerge AlizonLaurent TrassoudaineJean-Pierre Derutin
• Organismes : Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique

---

Source

---

• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 01/01/2006
• Auteurs : Philippe BesnardFabienne LaugeretteJean-Pierre MontmayeurBruno Patris
• Organismes : Centre des Sciences du Goût Centre des Sciences du Goût Centre des Sciences du Goût Centre des Sciences du Goût

---

Source

---

• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2006
• Auteurs : Jean-Pierre J.-P. ButaultNathalie DelamePhilippe Lerouvillois
• Organismes : Economie Publique Economie Publique Ecole Nationale Supérieure d'Agronomie et des Industries Alimentaires
• Publié dans Économie rurale le 28/10/2020

---

Résumé : Dans cet article, les auteurs s’appuient sur le modèle du ménage producteur pour analyser la formation et les inégalités du revenu des ménages d’agriculteurs en utilisant un raccordement réalisé par l'Insee entre le Réseau d'information comptable agricole (Rica) et des données fiscales (1991 et 1997). Les disparités du revenu global des ménages sont moins importantes que les disparités de revenus agricoles : l’activité extérieure compense ainsi un handicap structurel de l’exploitation. Ce facteur n’est toutefois plus déterminant sur la formation des revenus globaux : les différences de structures agricoles entre les ménages avec ou sans activité extérieure sont faibles et le revenu des ménages pluri-actifs est donc plus important ; il est également plus stable. La situation locale du marché du travail ou la préférence du conjoint pour un travail extérieur deviennent des éléments déterminants de la formation des revenus des agriculteurs.

---

Source

---

• Type de publi. : Rapport
• Date de publi. : 01/01/2006
• Auteurs : Lynne BouchyJean-Pierre CanlerAnne CauchiPhilippe GinestetLaure GraveleauNathalie HyvrardAndré LarigaudrieJens MeinholdRoger Pujol
• Organismes : SUEZ ENVIRONNEMENT (FRANCE) Qualité des eaux et prévention des pollutions Veolia Environnement (FRANCE) SUEZ ENVIRONNEMENT (FRANCE) Hydrosystèmes et Bioprocédés SAUR SAUR Anjou Recherche Lyonnaise des Eaux

---

Résumé : Le Gis Biostep dont l'objectif est la compréhension des dysfonctionnements d'ordre biologique sur les stations de traitement des eaux usées s'est intéressé au problème de l'excès de sulfures à l'entrée des stations d'épuration, élément favorable au développement de certaines bactéries filamenteuses. Ce document présente les méthodes de diagnostic et de réduction de la concentration en sulfures dans les réseaux pour limiter leur concentration en entrée de station d'épuration. Ce n'est pourtant pas le premier objectif de l'exploitant, bien souvent son intervention sur les sulfures est due à des problèmes d'odeurs et/ou de corrosion. Quel que soit l'objectif poursuivi, les traitements mis en ½uvre seront les mêmes. Ce document réactualise les connaissances de nature essentiellement bibliographique, sur la thématique des sulfures en réseau d'assainissement. Elle sera enrichie ultérieurement par des fiches pratiques de mise en ½uvre des traitements.

---

Source

---

• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2006
• Auteurs : Giuliano E. PereiraJean-Pierre J.-P. GaudillerePhilippe PieriGhislaine HilbertMickael M. MaucourtCatherine DebordeAnnick MoingDominique D. Rolin
• Organismes : Oenologie Oenologie Oenologie Oenologie Station de physiologie végétale Station de physiologie végétale Station de physiologie végétale Station de physiologie végétale
• Publié dans Journal of Agricultural and Food Chemistry le 02/11/2020

---

Résumé : The grape berry microclimate is known to influence berry quality. The effects of the light exposure of grape berry clusters on the composition of berry tissues were studied on the "Merlot" variety grown in a vineyard in Bordeaux, France. The light exposure of the fruiting zone was modified using different intensities of leaf removal, cluster position relative to azimuth, and berry position in the cluster. Light exposures were identified and classified by in situ measurements of berry temperatures. Berries were sampled at maturity (> 19 Brix) for determination of skin and/or pulp chemical and metabolic profiles based on (1) chemical and physicochemical measurement of minerals (N, P, K, Ca, Mg), (2) untargeted H-1 NMR metabolic fingerprints, and HPLC targeted analyses of (3) amino acids and (4) phenolics. Each profile defined by partial least-square discriminant analysis allowed us to discriminate berries from different light exposure. Discriminant compounds between shaded and light-exposed berries were quercetin-3-glucoside, kaempferol-3-glucoside, myricetin-3-glucoside, and isorhamnetin-3-glucoside for the phenolics, histidine, valine, GABA, alanine, and arginine for the amino acids, and malate for the organic acids. Capacities of the different profiling techniques to discriminate berries were compared. Although the proportion of explained variance from the H-1 NMR fingerprint was lower compared to that of chemical measurements, NMR spectroscopy allowed us to identify lit and shaded berries. Light exposure of berries increased the skin and pulp flavonols, histidine and valine contents, and reduced the organic acids, GABA, and alanine contents. All the targeted and nontargeted analytical data sets used made it possible to discriminate sun-exposed and shaded berries. The skin phenolics pattern was the most discriminating and allowed us to sort sun from shade berries. These metabolite classes can be used to qualify berries collected in an undetermined environment. The physiological significance of light and temperature effects on berry composition is discussed.

---

Source

---

• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2006
• Auteurs : Kouassi AllouJean-Paul MorinPhilippe KouassiFrançois Hala N'KloDidier D. Rochat
• Organismes : Centre National de Recherche Agronomique de Côte d'Ivoire Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement Université Félix Houphouët-Boigny [Abidjan, Côte d'Ivoire] CNRA Physiologie de l'Insecte : Signalisation et Communication
• Publié dans Journal of Chemical Ecology le 01/11/2020

---

Résumé : Oryctes monoceros is the most serious pest in coconut plantations, causing up to 40% damage in tropical Africa, especially in Ivory Coast. With a view to reducing pest populations by olfactory trapping, field trials were carried out to assess the efficiency of a synthetic aggregation pheromone: ethyl 4-methyloctanoate (1), 4-methyloctanoic acid (2), a related volatile produced by males, and decaying palm material, either oil palm empty fruit bunches (EFB) or pieces of coconut wood (CW) of various ages. Vertical polyvinyl chloride tube traps (2 x 0.16 m with two openings in the upper half), embedded in the soil, were more efficient than 30-L pail traps 1.5 m above ground. EFB, which were inactive alone, synergized captures with synthetic pheromone. CW was more effective than EFB in comparative trials. Compound 2 did not catch any beetles when assessed with EFB, and reduced catches by 1 + EFB when tested at > 10% with the pheromone. Trapping over 6 mo in 2002 and 2003 in a 19-ha coconut plot inside a 4,000-ha oil palm estate reduced damage from 3.8% in 2001 to 0.5% in 2002, then to 0.2% in 2003. Damage was 0.0% in 2004 with routine trapping using 32 traps, which caught 3369 beetles in 9 mo. The results are discussed in relation to other Dynastid palm pests and coconut protection in Ivory Coast.

---

Source