Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 12/12/2023
• Auteurs : Michel AractingiPierre-Alexandre LeziartThomas FlayolsJulien PerezTomi SilanderPhilippe Souères
• Organismes : Naver Labs Europe [Meylan] Équipe Mouvement des Systèmes Anthropomorphes Équipe Mouvement des Systèmes Anthropomorphes Équipe Mouvement des Systèmes Anthropomorphes Naver Labs Europe [Meylan] Naver Labs Europe [Meylan] Équipe Mouvement des Systèmes Anthropomorphes

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Résumé : The quadruped locomotion task is generally con- ditioned on a velocity command that is user-defined. However, certain features of the locomotion are not represented in this high-level definition of the task, e.g., swing feet height, step length and expended energy. Using reinforcement learning, many of these features can be determined by the reward function terms and scales that are often fixed. In this work, we propose a deep reinforcement learning (DRL) approach to learn control policies augmented with parameters that modify different aspects of the reward function and control setup which, in turn, result in variations of the locomotion. We can then define a hierarchical architecture where a high level policy infers the suitable parameters to complete a given task. We show that this setup makes it possible to learn more complex behaviours that can be adapted for different terrains and environments to ensure successful and efficient locomotion. We display our results by deploying the low-level parameterized policy on the MIT Mini-Cheetah quadruped.

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Fichiers liés : HRL_Loco-2.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 11/12/2023
• Auteurs : Marc BelissaYannick BoscPhilippe BourdinJean-Luc ChappeyLoris ChavanetteAntonino de FrancescoBernard GainotPierre Serna
• Organismes : Groupe de Recherche d'Histoire Institut d'histoire moderne et contemporaine Institut d'histoire moderne et contemporaine Institut d'histoire moderne et contemporaine
• Publié dans Annales historiques de la Révolution française le 01/11/2020

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 11/12/2023
• Auteurs : Carine CalastrencFrançois BaleuxNicolas PoirierChristine RenduPierre CampmajoNicolas DobigeonMuriel LlubesMagalie PhillippeMarie-Claude BalNicolas MelladoClaire Marais-Sicre
• Organismes : Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés France, Amériques, Espagne, Sociétés, Pouvoirs, Acteurs Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Signal et Communications Institut National Polytechnique (Toulouse) Géosciences Environnement Toulouse Géographie de l'environnement Géographie de l'environnement Centre National de la Recherche Scientifique Structural Models and Tools in Computer Graphics Centre d'études spatiales de la biosphère
• Publié dans Treballs d'Arqueologia le 21/10/2020

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Résumé : Hicieron falta varias décadas de interacción y diálogo entre las ciencias humanas y las ciencias medioambientales, además de una serie de avances metodológicos, para que los espacios de altura fueran considerados algo más que inmutables y átonos. Sometidos a un cuestionamiento interdisciplinario integrado, revelan no una, sino muchas historias y dinámicas complejas. Historizar las zonas de montaña permite invertir el punto de vista global sobre las sociedades pirenaicas y reconsiderar los sistemas de valles. Es evidente que los equipos que participan en esta línea de investigación se enfrentan al problema de adquirir información primaria. Siendo requisito indispensable de toda investigación arqueológica, la prospección en alta montaña presenta especificidades propias y desafíos metodológicos particulares. Ahora es posible pensar en nuevos procedimientos de adquisición de información arqueológica basados en cinco grandes avances: la diversificación y miniaturización de los sensores, que permiten transportarlos en drones; la reducción significativa de los costes de adquisición de los vehículos aéreos; un entorno de vuelo cada vez más seguro; las herramientas de tratamiento de datos y el trabajo sobre la ergonomía informática, y la apertura de posibilidades que ofrece la inteligencia artificial, que permite prever posibilidades futuras para optimizar la detección de restos arqueológicos en entornos de gran altitud.

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Fichiers liés : 153-Calastrenc-et-al_revista_Treballs_12-2023.pdf

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 11/12/2023
• Auteurs : Jérémy MayenPierre PolsenaereAurore Regaudie de GiouxJonathan DebordeKarine CollinYoann Le MerrerÉlodie FoucaultVincent OuisseLaurent AndréMarie ArnaudPierre KostryrkaJean-Christophe LemesleVincent LelongMarie VagnerPhilippe Souchu
• Organismes : Laboratoire Environnement Ressources Morbihan Pays de Loire Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais Unité Dynamiques des Écosystèmes Côtiers Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais Laboratoire Environnement Ressources Morbihan Pays de Loire Laboratoire Environnement Ressources Morbihan Pays de Loire MARine Biodiversity Exploitation and Conservation - MARBEC MARine Biodiversity Exploitation and Conservation - MARBEC Institut des Sciences de la Terre d'Orléans - UMR7327 Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais Ligue pour la Protection des Oiseaux Ligue pour la Protection des Oiseaux Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) Laboratoire Environnement Ressources Morbihan Pays de Loire

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 11/12/2023
• Auteurs : Anthony LegobienHubert MartinVéronique BontempsJean-Pierre MaroniChristian ThomasClaudine CanaleJean-Philippe UrsuletGérard AbrahamClaire MarchandCyril Crozet
• Organismes : Centres Municipaux de Santé Pluridisciplinaires, Le Blanc-Mesnil Centres Municipaux de Santé Pluridisciplinaires, Le Blanc-Mesnil Centres Municipaux de Santé Pluridisciplinaires, Le Blanc-Mesnil Centres Municipaux de Santé Pluridisciplinaires, Le Blanc-Mesnil Association des diabétiques d'Ile-de-France Les Poids Plumes Ligue Nationale contre l’Obésité Alliance du cœur, Lens, Laboratoire éducations et promotion de la santé Laboratoire éducations et promotion de la santé
• Publié dans Santé Publique le 02/04/2020

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Résumé : Introduction : L’accessibilité de l’Education Thérapeutique du Patient (ETP) est essentielle pour contribuer à une réduction des inégalités sociales et répondre aux défis posés par l’accroissement des maladies chroniques. En France, la répartition de l’offre d’ETP sur le territoire est inhomogène et les patients y occupent une place encore trop modeste. Dans ces perspectives, un centre municipal de santé a élaboré un dispositif innovant d’ETP en impliquant dès le début des patients concernés. Les objectifs de cet article sont de présenter la méthodologie mise en œuvre pour co-construire un dispositif d’ETP pour des patients porteurs d’une ou plusieurs maladies prévalentes sur le territoire, ainsi que les résultats de la co-construction. Méthodes : Constitution d’une équipe projet avec divers acteurs : patients, professionnels de santé, administratifs, chercheurs. Organisation de temps synchrones et asynchrones. Résultats : Quatre réunions et de nombreux échanges ont permis de : définir les valeurs communes et les règles de fonctionnement de l’équipe projet, réfléchir sur la coordination du parcours de soins, identifier des besoins propres et partagés des patients touchés par le diabète de type 2, l’hypertension artérielle et/ou l’obésité, se mettre d’accord sur les principes du dispositif. Conclusions : les avantages que présente ce dispositif sont discutés : organisation souple avec de nombreux liens avec les acteurs locaux, développement du partenariat, élargissement de la population concernée. Des questionnements et des difficultés ont été rencontrés comme la coordination des acteurs et la représentation des patients partenaires pour les maladies ciblées. Ce dispositif sera expérimenté et évalué principalement en vue de son amélioration.

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 09/12/2023
• Auteurs : Sabrina BaakliniAlexandre SarrabayCamille BarthelemyLaila DahbiLaurine GilNoushin Mossadegh-KellerJean-Marc NavarroCaroline HuberRomain FenouilBertrand EscaliereRomane TrombettaMarine PujolPhilippe GaulardBenjamin RivierePeggy DartiguesFrancesco Llamas GutierrezCeline PangaultFabrice JardinFrancois LemonnierGabriel BrisouCorinne HaiounPauline GravelleCamille LaurentLionel SpinelliC Chris HuangMatthew StokesSahil SethMaria OrtizAnita GandhiBertrand NadelPierre MilpiedSandrine Roulland
• Organismes : Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse] Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse]

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Résumé : Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) is the most common aggressive B-cell lymphoma with high clinical and biological heterogeneity. Despite current effective immunochemotherapy, up to 40% of patients do not respond or develop refractory disease. DLBCL is characterized by two major cell-of-origin (COO) subtypes, germinal center B cell-like (GCB) and activated B cell-like (ABC), with recent research uncovering additional molecular subgroups based on genomic alterations or tumor microenvironment (TME) features. However, current classifiers use bulk or deconvolution profiling which blurs intra-tumor heterogeneity, hindering the discovery of true functional cell states underlying clinical diversity. Here, we constructed a multimodal single-cell atlas of 62 DLBCL cases, integrating single-cell transcriptomes, immune repertoire and genetic features, to decrypt recurrent B cell states and TME ecosystems while identifying clinically relevant prognostic biomarkers (Fig.1). We performed simultaneous 5'-end single-cell RNA, B-cell receptor (BCR) and T-cell receptor sequencing on 63 DLBCL lymph node biopsies, recovering 109,294 cells after stringent quality controls. These biopsies were obtained from the real-world, clinically-annotated, multicentric CeVi collection and included 43 patient samples at diagnosis (ABC = 17, GCB = 11, Unclassified = 6, Not Evaluated = 9; 21 of which did not achieve event-free survival at 24 months (EFS24) after R-chemotherapy regimens), 11 relapsed/refractory DLBCL and 8 DLBCL transformed from indolent lymphoma. We distinguished malignant B-cells from TME using canonical markers and BCR sequence, exploring heterogeneity in both components. We developed an original bioinformatic approach to define malignant B cell transcriptional archetypes shared across patients. To assess whether subclonal genetics are associated with transcriptional states, we inferred copy number variations (CNV) and studied BCR intraclonal variations of malignant cells. We also integrated TME data (39,674 cells) to quantify subpopulations and clonally expanded T-cell subsets, and performed robust statistical analyses to identify clinically relevant features linked to patient outcomes. To circumvent interpatient heterogeneity in malignant B cells, we defined transcriptional cellular archetypes conserved across patients by combining 3 unsupervised methods: rank-biased overlap meta-clustering, variational autoencoder and canonical correlation analysis integration. We identified 5 cellular archetypes (Arch.1-5): Arch.1 was characterized by plasma cell identity, Arch.2 by MYC and NFKB pathways, Arch.3 by MYC pathway only, Arch.4 by quiescence markers, and Arch.5 by GC markers. Several archetypes co-existed in each tumor sample, and archetype identity was superimposed to the transcriptional profile conferred by COO molecular class as an additional layer of transcriptional heterogeneity. Cell state-specific CNV and BCR subclones were very rare, suggesting that subclonal genetic changes were not the main drivers of malignant B cell plasticity and archetypes. Kaplan-Meier analysis showed a significant negative association between proportion of Arch.4 cells and continuous EFS in our diagnosis cohort. Unsupervised analysis of archetype composition further distinguished ABC patients who achieved EFS24 (enriched in Arch.3 cells) from those with a particularly poor prognosis (enriched in Arch.4 cells). Integrated analysis of the TME revealed three major ecosystems, including one enriched for effector and cytotoxic T cells. In diagnosis samples, pseudo-temporal trajectory analysis revealed the enrichment of clonally-expanded hyperactivated CD8+ T cells expressing canonical exhaustion markers in patients achieving EFS24, suggesting a positive link between the extent of CD8+ T cell differentiation and response to R-CHOP based regimens. Shedding new light on DLBCL biological and clinical heterogeneity, our comprehensive single-cell atlas of DLBCL uncovered recurrent tumor cell states and TME features crucial for stratifying non-responsive ABC patients and guiding treatment decisions. Ongoing single-cell spatial transcriptomics analyses will be used to further validate our findings and elucidate archetype-TME interactions that may drive malignant B cell plasticity, with the potential to uncover novel therapeutic targets.

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 09/12/2023
• Auteurs : Sabrina BaakliniAlexandre SarrabayCamille BarthelemyLaila DahbiLaurine GilNoushin Mossadegh-KellerJean-Marc NavarroCaroline HuberRomain FenouilBertrand EscaliereRomane TrombettaMarine PujolPhilippe GaulardBenjamin RivierePeggy DartiguesFrancesco Llamas GutierrezCeline PangaultFabrice JardinFrancois LemonnierGabriel BrisouCorinne HaiounPauline GravelleCamille LaurentLionel SpinelliChris Chris HuangMatthew E StokesSahil SethMaria OrtizAnita K GandhiBertrand NadelPierre MilpiedSandrine Roulland
• Organismes : Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Institut Carnot Lymphome Theories and Approaches of Genomic Complexity Transcriptomics and Genomics of Marseille-Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy CHU Henri Mondor [Créteil] Hôpital Gui de Chauliac [CHU Montpellier] Département de biologie et pathologie médicales [Gustave Roussy] Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Pontchaillou] Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Pontchaillou] Microenvironment and B-cells: Immunopathology, Cell Differentiation, and Cancer Établissement Français du Sang Bretagne [Rennes] Cancer and Brain Genomics Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen Institut Mondor de Recherche Biomédicale Institut Paoli-Calmettes Hôpital Henri Mondor Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse] Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse] Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Bristol-Myers Squibb Company Bristol-Myers Squibb Company Bristol-Myers Squibb Company Bristol-Myers Squibb Company Bristol-Myers Squibb Company Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy

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Fichiers liés : Abstract_ASH_2023_Baaklini_&_al.pdf

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• Type de publi. :
• Date de publi. : 08/12/2023
• Auteurs : Ewald AlcindorPierre Garry AugustinFractyl MertilusDaniel Jean-PierreLincoln DuguéMikerson DorismondPhilippe MonneveuxEwald AlcindorPierre Garry AugustinFractyl MertilusDaniel Jean-PierreLincoln DuguéMikerson DorismondPhilippe Monneveux
• Organismes : Ministère de l'Agriculture, Ressources Naturelles et Développement Rural d'Haïti

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Résumé : Le Programme d’Innovation Technologique en Agriculture et Agroforesterie (PITAG), initié et mis en œuvre par le MARNDR avec l’appui financier de la Banque Interaméricaine de Développement (BID) et du Fonds International pour le Développement Agricole (FIDA), a pour objectif principal l’accroissement de la productivité des petits agriculteurs dans certaines zones des départements du Nord, du Nord-est, de l'Artibonite, du Sud et de la Grande Anse. Sa durée était prévue initialement pour cinq ans allant d’avril 2018 à mars 2023. Le programme a bénéficié d`une extension de 15 mois. Le PITAG est organisé autour de deux composantes techniques majeures, une composante de recherche appliquée et formation pour le développement (composante 1) et une composante visant la promotion de technologies agricoles durables (composante 2). La composante 1 finance, à partir des fonds de la BID dans le cadre des Accords de Don 3622/GR-HA et GRT/SX-15417-HA : i)Des activités de recherche agricole appliquée, conduites conjointement par des entités publiques, privées ou de la société civile, nationales et internationales, en vue de mettre à la disposition des agriculteurs des technologies agricoles innovatrices, rentables et durables ii)Le renforcement de la formation supérieure, technique et professionnelle en agriculture et développement rural iii) Le renforcement institutionnel de la Direction de l’Innovation du MARNDR. Dans le cadre de cette composante, sont mis en œuvre : -Cinq (5) sous-programmes de recherche-développement agricole destinés à affronter les problèmes majeurs se posant au sein des principaux systèmes de culture (agroforesterie à dominante caféier, agroforesterie à dominante cacaoyer, systèmes légumineuses-céréales, racines et tubercules, et systèmes rizicoles) -Trois (3) projets complémentaires dits « projets spéciaux » axés sur des thématiques spécifiques (petite mécanisation agricole, fertilité des sols, maladies et ravageurs des denrées agricoles), communes à plusieurs sous-programmes et qui devraient de ce fait contribuer à leur coordination. Les paquets techniques qui seront mis au point au terme de ces recherches seront vulgarisés auprès des producteurs à partir d’incitations fournies par la composante 2, « Promotion de technologies agricoles durables ». Or l’expérience prouve que, pour avoir plus de chance d’être adoptés par les agriculteurs, les résultats de la recherche doivent avoir été générés avec la participation des agriculteurs à toutes les étapes du processus, de la phase de diagnostic à la phase de validation en passant par la mise en place et le suivi des expérimentations. Une appropriation par les producteurs est aussi souhaitable dans une perspective de durabilité des actions mises en œuvre. A la suite de près de 4 ans de mise en œuvre des sous-programmes et des projets spéciaux financés par le Programme, l`heure a sonné pour les chercheurs impliqués de présenter les premiers résultats de leurs travaux de recherche ainsi que les produits et paquets techniques à l`occasion de journées scientifiques qui seront tenues en Haïti du 4 au 8 décembre 2023. Conçu pour être un cadre de formation et de partage d`expériences et de connaissances, cet événement, qui réunira les acteurs de terrain et des experts de renommée internationale, sera un rendez-vous important qui permettra un regard critique sur les activités de recherche appliquée menées dans le cadre du PITAG. La réalisation en Haïti de cette manifestation scientifique a été possible grâce au support financier de la Banque Interaméricaine de Développement. Nous tenons également à exprimer notre profonde gratitude aux membres du comité scientifique (CS) pour les conseils techniques et scientifiques qu’ils nous ont prodigués, et pour la confiance qu’ils nous ont accordée. Un remerciement spécial à Ing.-agr Rachelle CHERY et Ing.-agr Sardou JEAN-DENIS qui ont accompagné le CS du début à la fin. Comité scientifique du colloque Dr Wesly JEUNE Dr Gaël PRESSOIR Dr Bénédique PAUL Dr Predner DUVIVIER Ing.-agr Lincoln DUGUÉ Comité d’organisation du colloque Ing.-agr Fractyl MERTILUS Ing.-agr Daniel JEAN-PIERRE Ing.-agr Mikerson DORISMOND Ing.-agr Ewald ALCINDOR Mme Emmanuella REVILIEN

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Fichiers liés : Actes 2ème Journées Scientifiques PITAG 5-8 décembre 2023.pdf

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 07/12/2023
• Auteurs : Anca-Georgina CaranfilSandrine LefrancLaurence CromerMathilde GrelonPhilippe Andrey
• Organismes : Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal

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Résumé : During meiotic prophase I, while homologous pairing, synapsis, and recombination take place, chromosomes undergo spectacular movements. Studies in mammals and fungi (including mouse, C.elegans and budding yeast) showed that these rapid prophase movements play a crucial role in achieving non-erroneous meiosis. In plants, however, little is known about them. Based on advanced imaging techniques, our consortium has recently performed a fine cytological and quantitative description of chromosome movements during prophase I in Arabidopsis thaliana. One question is now to decipher the underlying mechanisms and functional implications of these movements. One promising approach to tackle this challenge is through the modeling of chromosome dynamics using polymer physics and molecular dynamics. Here, we will describe the model we are currently developing for meiotic prophase I chromosome dynamics in Arabidopsis thaliana. Ultimately, we will combine this model with experimental data to address a number of questions, including the influence of geometrical and topological constraints (nucleus confinement, telomere attachment to the nuclear envelope, nucleus crowdedness) on global and local chromosome dynamics and the role of the cytoskeleton in these movements.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 04/12/2023
• Auteurs : Huanjie YangXeniya KimJan SkłenarSébastien AubourgGloria Sancho-AndrésElia StahlMarie-Charlotte GuillouNora Gigli-BiscegliaLoup Tran van CanhKyle W BenderAnnick StintziPhilippe ReymondClara Sánchez-RodríguezChrista TesterinkJean-Pierre RenouFrank L.H. MenkeAndreas SchallerJack RhodesCyril Zipfel
• Organismes : Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
• Publié dans Nature Plants le 21/10/2020

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Résumé : Plant signalling peptides are typically released from larger precursors by proteolytic cleavage to regulate plant growth, development and stress responses. Recent studies reported the characterization of a divergent family of Brassicaceae-specific peptides, SERINE RICH ENDOGENOUS PEPTIDES (SCOOPs), and their perception by the leucine-rich repeat receptor kinase MALE DISCOVERER 1-INTERACTING RECEPTOR-LIKE KINASE 2 (MIK2). Here, we reveal that the SCOOP family is highly expanded, containing at least 50 members in the Columbia-0 reference Arabidopsis thaliana genome. Notably, perception of these peptides is strictly MIK2-dependent. How bioactive SCOOP peptides are produced, and to what extent their perception is responsible for the multiple physiological roles associated with MIK2 are currently unclear. Using N-terminomics, we validate the N-terminal cleavage site of representative PROSCOOPs. The cleavage sites are determined by conserved motifs upstream of the minimal SCOOP bioactive epitope. We identified subtilases necessary and sufficient to process PROSCOOP peptides at conserved cleavage motifs. Mutation of these subtilases, or their recognition motifs, suppressed PROSCOOP cleavage and associated overexpression phenotypes. Furthermore, we show that higher-order mutants of these subtilases show phenotypes reminiscent of mik2 null mutant plants, consistent with impaired PROSCOOP biogenesis, and demonstrating biological relevance of SCOOP perception by MIK2. Together, this work provides insights into the molecular mechanisms underlying the functions of the recently identified SCOOP peptides and their receptor MIK2.

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Fichiers liés : NaturePlants_subtilase_scoop_2023_revised.pdf

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