Philippe JEAN-PIERRE

---

• Type de publi. : Ouvrage (y compris édition critique et traduction)
• Date de publi. : 18/10/2022
• Auteurs : Marina EudesEmmanuel GuematchaJean-Pierre MassiasXavier PhilippePascal Plas
• Organismes : Centre de droit international de Nanterre Institut des sciences juridique et philosophique de la Sorbonne - UMR 8103

---

Résumé : L’Annuaire de Justice transitionnelle entend contribuer à susciter et à diffuser une pensée francophone sur la justice transitionnelle, comprise comme incluant divers thèmes allant de la justice pénale (nationale ou internationale) aux commissions vérité et réconciliation, en passant par toute une série de mesures pouvant être adoptées à l’issue d’un conflit armé ou après la chute d’un régime autoritaire. Dans ces hypothèses de retour à la paix ou de transition démocratique (qui ne sont, du reste, pas toujours pérennes), il s’agit d’analyser les réponses offertes par le droit et par d’autres sciences humaines pour que des sociétés meurtries affrontent leur passé et préparent leur avenir dans les meilleures conditions. Outre une ouverture internationale et pluridisciplinaire assumée, la nouvelle mouture de l’Annuaire vise à publier des contributions écrites par des universitaires mais aussi des praticiens, jeunes ou confirmés, qu’il s’agisse de mémoires de recherche réalisés par des étudiants en master 2, d’actes de colloques académiques, de témoignages de praticiens de la justice pénale ou transitionnelle ou encore d’études sur des expériences passées ou à venir, avec une perspective comparatiste dans le temps et dans l’espace. Ces articles sont utilement complétés d’une bibliographie francophone de l’année en cours, comprenant, outre la doctrine pertinente, les références des principales jurisprudences internationales et nationales et une liste des événements marquants de la justice pénale internationale et transitionnelle. L’Annuaire 2021 comprend notamment les actes de deux colloques universitaires, le rapport de synthèse du Séminaire annuel de l’IFJD, le dossier spécial « Processus de paix », des contributions variées, ainsi que la chronique de l’année.

---

Source

---

• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 16/10/2022
• Auteurs : Christophe LucchesiJulien LegendreDilek CakirogluJean-Philippe PerezThierry TaliercioEric TourniéRodolphe VaillonPierre-Olivier Chapuis
• Organismes : Centre d'Energétique et de Thermique de Lyon Centre d'Energétique et de Thermique de Lyon Institut d’Electronique et des Systèmes Composants à Nanostructure pour le moyen infrarouge Institut d’Electronique et des Systèmes Composants à Nanostructure pour le moyen infrarouge Institut d’Electronique et des Systèmes Composants à Nanostructure pour le moyen infrarouge Institut d’Electronique et des Systèmes Composants à Nanostructure pour le moyen infrarouge Photonique et Ondes Institut d’Electronique et des Systèmes Micro électronique, Composants, Systèmes, Efficacité Energétique Énergie Centre d'Energétique et de Thermique de Lyon

---

Source

---

• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 14/10/2022
• Auteurs : Jade RoyoAissata CamaraBenedicte BertrandPhilippe BatigneAgnès CosteBernard PipyAgnes AubouyJean-François FaucherPierre-Marie Preux
• Organismes : Pharmacochimie et Biologie pour le Développement Institut de Recherche et de Développement des Plantes Médicinales et alimentaires de Guinée Pharmacochimie et Biologie pour le Développement Pharmacochimie et Biologie pour le Développement Pharmacochimie et Biologie pour le Développement Pharmacochimie et Biologie pour le Développement Pharmacochimie et Biologie pour le Développement Pharmacochimie et Biologie pour le Développement Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale
• Publié dans Frontiers in Cellular and Infection Microbiology le 29/10/2020

---

Résumé : Cerebral malaria (CM) is one of the most severe forms of malaria and is a neuropathology that can lead to death. Monocytes have been shown to accumulate in the brain microvasculature at the onset of neurological symptoms during CM. Monocytes have a remarkable ability to adapt their function to their microenvironment from pro-inflammatory to resolving activities. This study aimed to describe the behavior of monocyte subpopulations during infection and its resolution. C57BL/6 mice were infected with the Plasmodium berghei ANKA strain and treated or not with chloroquine (CQ) on the first day of the onset of neurological symptoms (day 6) for 4 days and followed until day 12 to mimic neuroinflammation and its resolution during experimental CM. Ly6C monocyte subpopulations were identified by flow cytometry of cells from the spleen, peripheral blood, and brain and then quantified and characterized at different time points. In the brain, the Ly6C int and Ly6C low monocytes were associated with neuroinflammation, while Ly6C hi and Ly6C int were mobilized from the peripheral blood to the brain for resolution. During neuroinflammation, CD36 and CD163 were both involved via splenic monocytes, whereas our results suggest that the low CD36 expression in the brain during the neuroinflammation phase was due to degradation. The resolution phase was characterized by increased expressions of CD36 and CD163 in blood Ly6C low monocytes, a higher expression of CD36 in the microglia, and restored high expression levels of CD163 in Ly6C hi monocytes localized in the brain. Thus, our results suggest that increasing the expressions of CD36 and CD163 specifically in the brain during the neuroinflammatory phase contributes to its resolution.

---

Fichiers liés : Royo_2022.pdf

---

Source

---

• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 14/10/2022
• Auteurs : Tatiana LupascoZhiguo HeMyriam CassagneTomy SagnialLise BrionPierre FourniéPhilippe GainGilles ThuretMichèle AlloucheFrançois MalecazeMichel SimonStéphane D. Galiacy
• Organismes : Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires Biologie, Ingénierie et Imagerie pour l'Ophtalmologie Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires Service d'Ophtalmologie [CHU Toulouse] Biologie, Ingénierie et Imagerie pour l'Ophtalmologie Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires Service d'Ophtalmologie [CHU Toulouse] Service d’Ophtalmologie [CHU Saint-Etienne] Service d’Ophtalmologie [CHU Saint-Etienne] Biologie, Ingénierie et Imagerie pour l'Ophtalmologie Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires Service d'Ophtalmologie [CHU Toulouse] Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires Service d'Ophtalmologie [CHU Toulouse]
• Publié dans PLoS ONE le 25/10/2020

---

Résumé : Keratoconus (KC) is a multifactorial progressive ectatic disorder characterized by local thinning of the cornea, leading to decreased visual acuity due to irregular astigmatism and opacities. Despite the evolution of advanced imaging methods, the exact etiology of KC remains unknown. Our aim was to investigate the involvement of corneal epithelium in the pathophysiology of the disease. Corneal epithelial samples were collected from 23 controls and from 2 cohorts of patients with KC: 22 undergoing corneal crosslinking (early KC) and 6 patients before penetrating keratoplasty (advanced KC). The expression of genes involved in the epidermal terminal differentiation program and of the oxidative stress pathway was assessed by real time PCR analysis. Presence of some of the differentially expressed transcripts was confirmed at protein level using immunofluorescence on controls and advanced KC additional corneal samples. We found statistically significant under-expression in early KC samples of some genes known to be involved in the mechanical resistance of the epidermis ( KRT 16, KRT14 , SPRR1A , SPRR2A , SPRR3 , TGM1 and TGM5 ) and in oxidative stress pathways ( NRF2 , HMOX1 and HMOX2 ), as compared to controls. In advanced KC samples, expression of SPRR2A and HMOX1 was reduced. Decreased expression of keratin (KRT)16 and KRT14 proteins was observed. Moreover, differential localization was noted for involucrin, another protein involved in the epidermis mechanical properties. Finally, we observed an immunofluorescence staining for the active form of NRF2 in control epithelia that was reduced in KC epithelia. These results suggest a defect in the mechanical resistance and the oxidative stress defense possibly mediated via the NRF2 pathway in the corneal keratoconic epithelium.

---

Fichiers liés : Lupasco_2022.pdf

---

Source

---

• Type de publi. :
• Date de publi. : 13/10/2022
• Auteurs : Olivier PayrastreFrançois BouttierOlivier CaumontVéronique DucrocqBruno JanetPierre JavelleDimitri LagueJean-Philippe NaulinDavid MoncoulonPierre NicolleFrédéric PonsMaria-Helena RamosIsabelle Ruin
• Organismes : Eau et Environnement Centre national de recherches météorologiques Groupe de Météorologie à Moyenne Échelle Centre national de recherches météorologiques Service Central d'Hydrométéorologie et d'Appui à la Prévision des Inondations Risques, Ecosystèmes, Vulnérabilité, Environnement, Résilience Géosciences Rennes Caisse Centrale de Réassurance Caisse Centrale de Réassurance Eau et Environnement Centre d'Etudes et d'Expertise sur les Risques, l'Environnement, la Mobilité et l'Aménagement - Direction Méditerranée Hydrosystèmes continentaux anthropisés : ressources, risques, restauration Institut des Géosciences de l’Environnement

---

Source

---

• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 13/10/2022
• Auteurs : Fabrice AndréThomas FilleronMaud KamalFernanda MoseleMonica ArnedosFlorence DalencMarie-Paule SablinMario CamponeHervé BonnefoiClaudia Lefeuvre-PlesseWilliam JacotFlorence CoussyJean-Marc FerreroGeorge EmileMarie-Ange Mouret-ReynierJean-Christophe TheryNicolas IsambertAlice MegePhilippe BarthelemyBenoit YouNawale HajjajiLudovic LacroixEtienne RouleauAlicia Tran-DienSandrine BoyaultValery AttignonPierre GestraudNicolas ServantChristophe Le TourneauLinda Larbi CherifIsabelle SoubeyranFilippo MontemurroAlain MorelAmelie LusqueMarta JimenezAlexandra JacquetAnthony GonçalvesThomas BachelotIvan Bièche
• Organismes : Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie Département de médecine oncologique [Gustave Roussy] Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques Institut Gustave Roussy Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse Institut Cochin
• Publié dans Nature le 29/10/2020

---

Source

---

• Type de publi. : Pré-publication, Document de travail
• Date de publi. : 12/10/2022
• Auteurs : Cyril LibourelJean KellerLukas BrichetAnne-Claire Cazale-NoelSébastien CarrereTatiana VerniéJean-Malo CouzigouCaroline CallotIsabelle DufauStephane CauetWilliam MarandeTabatha BulachAmandine SuinCatherine MassonPhilippe RemigiPierre-Marc DelauxDelphine Capela
• Organismes : Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales LRSV-Interactions Microbiennes dans la Rhizosphère et les Racines Centre National de Ressources Génomiques Végétales Centre National de Ressources Génomiques Végétales Centre National de Ressources Génomiques Végétales Centre National de Ressources Génomiques Végétales Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement LRSV-Evolution des Interactions Plantes-Microorganismes Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement

---

Résumé : Symbiotic interactions have structured past and present ecosystems and shaped the evolution of life. As any trait, the symbiotic state observed in extant species builds on ancestral and conserved features, and lineage-specific innovations. From these mixed origins, defining the ancestral state of symbiotic associations is challenging although it is instrumental for understanding how symbiotic abilities emerge from non-symbiotic states. Here we aimed at reconstructing the intermediate steps leading to the root-nodule nitrogen-fixing symbiosis (RNS) observed in some extant flowering plants. For this, we compared the transcriptomic responses of nine host plants in response to symbiotic bacteria. We included the mimosoid legume Mimosa pudica for which we assembled a chromosome-level genome and generated the transcriptomic response to experimentally evolved bacterial symbionts. With this dataset, we reconstructed the ancestral RNS transcriptome, composed of most already described symbiotic genes together with hundreds of novel candidates. We found that the response to the chemical signals produced by the symbiont, nodule organogenesis and nitrogen-fixation are predominantly linked to ancestral responses, although these traits have diversified in the different nitrogen-fixing lineages. We detected a clear signature of recent and convergent evolution for the ability to release intracellular symbiosomes in two legume lineages, exemplified by the expression of different classes of small proteins in each group, potentially leading to the convergent gain of symbiotic evolutionary stability. Our findings demonstrate that most of the novelties for RNS were mostly in place in the most recent common ancestor of the RNS-forming species that lived on Earth 110 million years ago. Graphical abstract A little graphical/nice phylogeny with nodes of interest Highlights We sequenced a high-quality genome of the Mimosoideae Mimosa pudica The nitrogen-fixing root-nodule symbiosis relies on an ancestral transcriptomic response All symbiotic traits involve genes of the ancestral symbiotic program Symbiont perception, nodule organogenesis and nitrogen-fixation are essentially ancestral processes Convergent evolution of intracellular accommodation of symbionts additionally involves lineage-specific genes

---

Source

---

• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 12/10/2022
• Auteurs : Marion Le BideauGabriel Augusto Pires de SouzaCeline BoschiJean-Pierre BaudoinGwilherm PenantPriscilla JardotFlorence FenollarPhilippe ColsonMatthias LenkBernard La Scola
• Organismes : Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes
• Publié dans Frontiers in Microbiology le 31/10/2020

---

Résumé : The SARS-CoV-2 pandemic started in the end of 2019 in Wuhan, China, which highlighted the scenario of frequent cross-species transmission events. From the outbreak possibly initiated by viral spill-over into humans from an animal reservoir, now we face the human host moving globally while interacting with domesticated and peridomestic animals. The emergence of a new virus into the ecosystem leads to selecting forces and species-specific adaptations. The adaptation of SARS-CoV-2 to other animals represents a risk to controlling the dissemination of this coronavirus and the emergence of new variants. Since 2020, several mink farms in Europe and the United States have had SARS-CoV-2 outbreaks with human–mink and mink–human transmission, where the mink-selected variants possibly hold evolutionary concerning advantages. Here we investigated the permissibility of mink lung-derived cells using two cell lines, Mv-1-Lu and ENL-R, against several lineages of SARS-CoV-2, including some classified as variants of concern. The viral release rate and the infectious titers indicate that these cells support infections by different SARS-CoV-2 lineages. The viral production occurs in the first few days after infection with the low viral release by these mink cells, which is often absent for the omicron variant for lung cells. The electron microscopy reveals that during the viral replication cycle, the endomembrane system of the mink-host cell undergoes typical changes while the viral particles are produced, especially in the first days of infection. Therefore, even if limited, mink lung cells may represent a selecting source for SARS-CoV-2 variants, impacting their transmissibility and pathogenicity and making it difficult to control this new coronavirus.

---

Fichiers liés : fmicb-13-1003824.pdf

---

Source

---

• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 12/10/2022
• Auteurs : Mélusine DurandNicolas NagotQuynh Bach Thi NhuAmélie VizeneuxLinh Le Thi ThuyHuong Thi DuongBinh NguyenDelphine RapoudR. ValloCatherine QuilletHong Thi TranLaurent MichelThanh Nham Thi TuyetOanh Khuat Thi HaiVinh Vu HaiJonathan FeelemyerPhilippe van de PerreDon Des JarlaisKhue Pham MinhDidier LaureillardJean-Pierre Moles
• Organismes : Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Hai Phong University of Medicine and Pharmacy [Hai Phong, Vietnam] Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Hai Phong University of Medicine and Pharmacy [Hai Phong, Vietnam] Hai Phong University of Medicine and Pharmacy [Hai Phong, Vietnam] Hai Phong University of Medicine and Pharmacy [Hai Phong, Vietnam] Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Hai Phong University of Medicine and Pharmacy [Hai Phong, Vietnam] Centre de Soins, d’Accompagnement et de Prévention en Addictologie Pierre Nicole [Paris] Supporting Community Development Initiatives [Hanoï, Vietnam] Supporting Community Development Initiatives [Hanoï, Vietnam] Viet Tiep Hospital [Hai Phong, Vietnam] New York University [New York] Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections New York University [New York] Hai Phong University of Medicine and Pharmacy [Hai Phong, Vietnam] Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections
• Publié dans Biomedicines le 28/10/2020

---

Résumé : People who inject drugs (PWID) are a population exposed to many genotoxicants and with a high prevalence of HCV infection. Direct-acting antiviral (DAA) regimens are now widely used to treat chronic HCV infection. Although side effects to treatment are currently rare, the longterm effects such as suspicions of de novo hepatocellular carcinoma (HCC) occurrence or HCC recurrence and cardiac defects are still up for debate. Given the structure of DAAs, the molecules have a potential mitochondrial DNA (mtDNA) genotoxicity. We have previously reported acute mtDNA toxicity of three DAA regimens among PWID with a strong impact on the rate of mtDNA deletion, less on the quantity of mtDNA copy per cell at sustained viral response at 12 weeks (SVR12). Herein, we report the mtDNA parameters nine months after drug discontinuation. We observed that the percentage of the deleted mtDNA genome increased over time. No exposure to any other genotoxicants during this period was associated with a high deletion percentage, suggesting that the replicative advantage of the deleted molecules outweighed their elimination processes. Such observation calls for longer-term follow-up and may contribute to the molecular basis of subclinical side effects of DAA treatments.

---

Fichiers liés : 2022_Oct_Mitochondrial_instability_MDurand_FREE.pdf

---

Source

---

• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 11/10/2022
• Auteurs : Philippe CarerJules DruetAnthony LegendreJean-Charles JoutyPierre MoulinTu Duong Le DuyMarc BouissouPascal ObryMarouane El MernissiKamal ZaghoulBogdan DzonlagaCatherine VernhesMaxime LaineMoussa Fadili
• Organismes : EDF R&D EDF R&D EDF R&D EDF R&D EDF R&D EDF R&D EDF R&D EDF R&D EDF R&D Polytech' Angers, Université d'Angers EDF R&D Polytech' Angers, Université d'Angers EDF R&D EDF R&D Ecole Supérieure d'Electricité - SUPELEC (FRANCE) EDF R&D Ecole Supérieure d'Electricité - SUPELEC (FRANCE) EDF R&D

---

Résumé : Les méthodes déterministes et probabilistes pour construire la sûreté des réseaux électriques des centrales nucléaires existantes (paliers 900 MW, 1300 MW, et EPR) sont présentées dans cet article. Des travaux internationaux ont amené à modifier la structure du réseau électrique de l'EPR2, qui de plus présente les aspects nouveaux suivants : diesels multi-groupes et électronique de puissance pour la partie BT du réseau. On présente ensuite les méthodes de sûreté de fonctionnement probabilistes appliquées à la conception du réseau électrique de l'EPR2 : allocation d'objectif de fiabilité, outils KB3-BDMP, KB3-K6 et Risk-Spectrum pour les calculs de fiabilité et de DCC (défaillance de causes communes) ; base AIDEN pour classer les pannes électriques. On décrit en perspective, les possibilités de calculs de fiabilité « hybride » avec Modelica ou Python; et l'utilisation de SPARK pour réaliser les codes d'onduleur DC/AC ou de protection numérique HTA.

---

Fichiers liés : 3C - Etat de l’art des méthodes de sûreté de fonctionnement probabilistes pour les réseaux électriques des centrales nucléaires.pdf

---

Source