Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 28/09/2022
• Auteurs : Valentin Le GoffAnne MuratYann MéarGwendoline GregoireJean-Philippe PezyEmmanuel PoizotClément FrigolaPierre WeillSandric LesourdChristoph MensensMagalie LegrainLéo Pancrazzi
• Organismes : Laboratoire Universitaire des Sciences Appliquées de Cherbourg Laboratoire Universitaire des Sciences Appliquées de Cherbourg Institut national des sciences et techniques de la mer Laboratoire Universitaire des Sciences Appliquées de Cherbourg Institut national des sciences et techniques de la mer Laboratoire Universitaire des Sciences Appliquées de Cherbourg Institut national des sciences et techniques de la mer Morphodynamique Continentale et Côtière Institut national des sciences et techniques de la mer Laboratoire Universitaire des Sciences Appliquées de Cherbourg Laboratoire Universitaire des Sciences Appliquées de Cherbourg Morphodynamique Continentale et Côtière Morphodynamique Continentale et Côtière Morphodynamique Continentale et Côtière Morphodynamique Continentale et Côtière Morphodynamique Continentale et Côtière

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Résumé : L’évaluation de l’impact des effets cumulés des activités anthropiques est un enjeu essentiel pour la protection et la gestion des écosystèmes marins. La Manche et en particulier la baie de Seine, sont parmi les zones présentant la plus forte concentration d’activités anthropiques en Europe. Parmi ces activités, l’extraction de granulats marins et les dépôts de dragages portuaires se sont fortement développés ces dernières années. Les impacts de chacune de ces activités sur l’état physique et écologique des fonds sédimentaires et de la colonne d’eau commencent aujourd’hui à être relativement bien quantifiés à l’échelle d’un site. Cependant, le défi actuel est de comprendre leurs interactions potentielles afin de répondre aux législations européenne (EU directive 85/337/CEE, amendement 11/97/CE) et française (article R122-5 du code français de l’environnement, modifié par le décret n°2017-626 du 25 Avril 2017 – article 3). Les impacts cumulés sur les fonds sédimentaires demeurent mal connus en particulier parce que nous manquons de méthodologies de traçage du transport sédimentaire adaptées. Le projet ECUSED concerne les effets cumulés des activités humaines en mer sur l’état physique des fonds sédimentaires. Il est financé par la région Normandie (RIN Recherche Emergent 2021-2023) et soutenu par le GIS ECUME (Groupement d’Intérêt Scientifique Effets CUmulés en MEr) créé en novembre 2020. Plus particulièrement, nous considérons l’impact cumulatif des activités d’extraction de granulats marins (concession GMH, Granulats Marins du Havre), et d’immersion de sédiments dragués par les Grands Ports Maritimes pour l’entretien des chenaux de navigation (site du MACHU), localisés dans la partie orientale de la baie de Seine. Les fonds sédimentaires de la baie de Seine orientale représentent des habitats diversifiés pour les organismes benthiques et constituent un stock sédimentaire étroitement lié à la stabilité du trait de côte. Afin de définir les zones d’influence de chaque activité sur l’environnement naturel, et les éventuelles connexions entre sites, il est nécessaire de caractériser les sources (naturelles et anthropiques) de sédiments et leurs directions de transport à une échelle de plusieurs dizaines de km2 . Pour cela, une méthodologie innovante, basée sur l’analyse de l’évolution spatialisée de paramètres géochimiques et granulométriques des sédiments, est développée et éprouvée sur le terrain. Une mission de prélèvement sédimentaire s’est déroulée du 21 au 29 avril sur le N/ O Côtes de la Manche. Elle a permis d’obtenir des échantillons sur 115 stations de prélèvement régulièrement répartis sur une grille qui couvre une zone de 43 km2. Cette zone s’étend du site du MACHU au sud (dépôts de dragage) au site d’exploitation de granulats du GMH au nord. Le travail en mer a mis en évidence un transport vers le nord des dépôts fins issus du dragage sous la forme de petits galets mous de " vase indurée " . L’acquisition en laboratoire de données granulométriques (granulomètre Laser (Horiba)) et géochimiques (spectrométrie de fluorescence X (xSORT de Spectro-Ametek) et spectrométrie infrarouge (LECO CS 744)) sur le sédiment total permet de compléter et d’affiner cette interprétation en appliquant deux méthodologies : (1) GSTA (Grain Size Trend Analysis) classique de transport sédimentaire basé sur la granulométrie des dépôts et (2) MSTA (Multiproxies Sediment Trend Analysis) sur les paramètres géochimiques pour mettre en évidence les sources et les gradients de concentration. Sur la base de ces premières données, une série d’échantillons sera sélectionnée pour être tamisée en 16 à 27 fractions qui seront analysées individuellement en géochimie, ce qui nous permettra d’obtenir plus de précision sur les sources des particules et donnera accès à une étude du transport sédimentaire par type de grain.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 28/09/2022
• Auteurs : Rosa Maria BrunoJean Louis PépinJean Philippe EmpanaRui Yi YangVincent VercamerPaul JouhaudPierre EscourrouPierre Boutouyrie
• Organismes : Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] Hypoxie et PhysioPathologie Laboratoire d’EFCR [Grenoble] Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire Withings [Issy-les-Moulineaux] Withings [Issy-les-Moulineaux] Withings [Issy-les-Moulineaux] Centre du Sommeil et de la Vigilance [Paris] Université Paris-Saclay Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP]
• Publié dans European Heart Journal - Digital Health le 17/02/2023

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Résumé : Aims To investigate the impact of coronavirus disease 2019 lockdown on trajectories of arterial pulse-wave velocity in a large population of users of connected smart scales that provide reliable measurements of pulse-wave velocity. Methods and results Pulse-wave velocity recordings obtained by Withings Heart Health & Body Composition Wi-Fi Smart Scale users before and during lockdown were analysed. We compared two demonstrative countries: France, where strict lockdown rules were enforced (n = 26 196) and Germany, where lockdown was partial (n = 26 847). Subgroup analysis was conducted in users of activity trackers and home blood pressure monitors. Linear growth curve modelling and trajectory clustering analyses were performed. During lockdown, a significant reduction in vascular stiffness, weight, blood pressure, and physical activity was observed in the overall population. Pulse-wave velocity reduction was greater in France than in Germany, corresponding to 5.2 month reduction in vascular age. In the French population, three clusters of stiffness trajectories were identified: decreasing (21.1%), stable (60.6%), and increasing pulse-wave velocity clusters (18.2%). Decreasing and increasing clusters both had higher pulse-wave velocity and vascular age before lockdown compared with the stable cluster. Only the decreasing cluster showed a significant weight reduction (−400 g), whereas living alone was associated with increasing pulse-wave velocity cluster. No clusters were identified in the German population. Conclusions During total lockdown in France, a reduction in pulse-wave velocity in a significant proportion of French users of connected smart bathroom scales occurred. The impact on long-term cardiovascular health remains to be established.

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Fichiers liés : ztac027.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 27/09/2022
• Auteurs : Elise BonnetVéronique HaddadStanislas QuesadaKim-Arthur BaffertAudrey Lardy-CléaudIsabelle TreilleuxDaniel PissalouxValéry AttignonQing WangAdrien BuissonPierre-Etienne HeudelThomas BachelotArmelle DufresneLauriane EberstPhilippe ToussaintValérie BonadonaChristine LassetAlain ViariEmilie SohierSandrine PaindavoineValérie CombaretDavid PérolIsabelle Ray-CoquardJean-Yves BlayOlivier Tredan
• Organismes : Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] UNICANCER - Institut régional du Cancer Montpellier Val d'Aurelle Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Hospitalo-Universitaire Dupuytren Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Institut de Cancérologie de Strasbourg Europe Centre Léon Bérard [Lyon] Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 Centre Léon Bérard [Lyon] Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 Centre Léon Bérard [Lyon] Synergie Lyon Cancer-Platform of Bioinformatics-Gilles Thomas Equipe de recherche européenne en algorithmique et biologie formelle et expérimentale Synergie Lyon Cancer-Platform of Bioinformatics-Gilles Thomas Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Université Claude Bernard Lyon 1 UNICANCER Centre Léon Bérard [Lyon] Université Claude Bernard Lyon 1 UNICANCER Centre Léon Bérard [Lyon]
• Publié dans Journal of Personalized Medicine le 26/10/2020

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Résumé : Background: a specific subset of metastatic triple-negative breast cancers (mTNBC) is characterized by homologous recombination deficiency (HRD), leading to enhanced sensitivity to platinum-based chemotherapy. Apart from mutations in BRCA1/2 genes, the evaluation of other HRD related alterations has been limited to date. As such, we analyzed data from mTNBC patients enrolled in the ProfiLER-01 study to determine the prevalence of alterations in homologous recombination related (HRR) genes and their association with platinum sensitivity. Methods: next-generation sequencing and promoter methylation of BRCA1 and RAD51C were performed on tumors from patients with mTNBC, using a panel of 19 HRR genes. Tumors were separated into three groups based on their molecular status: mutations in BRCA1/2, mutations in other HRR genes (BRCA1/2 excluded) or BRCA1/RAD51C promoter methylation and the absence of molecular alterations in HRR genes (groups A, B and C, respectively). Sensitivity to platinum-based chemotherapy was evaluated through the radiological response. Results: mutations in BRCA1/2 were detected in seven (13.5%) patients, while alterations in other HRR genes or hypermethylation in BRCA1 or RAD51C were reported in 16 (30.7%) patients; furthermore, no alteration was found in the majority of patients (n = 29; 55.8%). Among 27 patients who received platinum-based chemotherapy, the disease control rate was 80%, 55% and 18% (groups A, B and C, respectively; p = 0.049). Regarding group B, patients with disease control exhibited mutations in FANCL, FANCA and the RAD51D genes or RAD51C methylation; Conclusion: mutations in HRR genes and epimutations in RAD51C were associated with disease control through platinum-based chemotherapy. As such, apart from well-characterized alterations in BRCA1/2, a more comprehensive evaluation of HRD should be considered in order to enlarge the selection of patients with mTNBC that could benefit from platinum-based chemotherapy.

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Fichiers liés : jpm-12-01595-v2.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 27/09/2022
• Auteurs : Jean-Pierre FratJean-Pierre QuenotJulio BadieRémi CoudroyChristophe GuittonStephan EhrmannArnaud GacouinHamid MerdjiJohann AuchabieCédric DaubinAnne-Florence DureauLaure ThibaultNicholas SedillotJean-Philippe RigaudAlexandre DemouleAbdelhamid FatahNicolas TerziMarine SimoninWilliam DanjouGuillaume CarteauxCharlotte GuesdonGaël PradelMarie-Catherine BesseJean ReignierFrançois BeloncleBéatrice La CombeGwénaël PratMai-Anh NayJoe de KeizerStéphanie RagotArnaud W. ThilleMaeva RodriguezFrançois ArriveAnne VeinsteinDelphine ChatellierSylvain Le PapeFlorence BoissierMarine JacquierMarie LabruyereFernando BerdaguerSylvain MalfroyChaouki MezherNicolas ChudeauMickaël LandaisCédric DarreauLaetitia Bodet ContentinSophie JacquierDenis GarotFlora DelamaireAdel MaamarBenoit PainvinJulie HelmsJulien DemiselleFabien JarousseauAnthony Le MeurAurélie JoretDamien Du CheyronPierre OudevilleValentin PointurierEmmanuel AntokGil MouremblesCécile SaladinChristelle BigotCôme BureauRobin DelerisNga PhanStanislas LedochowskiLouis Marie GalerneauAnaïs DartevelGaël BourdinEmmanuel VivierFrançois DhelftArmand Mekontso-DessapAudrey DestizonsMarion TheillaudGauthier BlonzPierre AsfarPauline CailliezPierre BaillyAnne BretagnolDamien ContouAgathe DelboveAlexandre LautretteOlivier NigeonJean Paul MiraGhada SbouiClément Saccheri
• Organismes : Neurophysiologie Respiratoire Expérimentale et Clinique CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques [U 1082] Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital CIC de Poitiers – Centre d'investigation clinique de Poitiers (CIC 1402)
• Publié dans JAMA Cardiology le 25/10/2020

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Résumé : Importance The benefit of high-flow nasal cannula oxygen (high-flow oxygen) in terms of intubation and mortality in patients with respiratory failure due to COVID-19 is controversial. Objective To determine whether the use of high-flow oxygen, compared with standard oxygen, could reduce the rate of mortality at day 28 in patients with respiratory failure due to COVID-19 admitted in intensive care units (ICUs). Design, Setting, and Participants The SOHO-COVID randomized clinical trial was conducted in 34 ICUs in France and included 711 patients with respiratory failure due to COVID-19 and a ratio of partial pressure of arterial oxygen to fraction of inspired oxygen equal to or below 200 mm Hg. It was an ancillary trial of the ongoing original SOHO randomized clinical trial, which was designed to include patients with acute hypoxemic respiratory failure from all causes. Patients were enrolled from January to December 2021; final follow-up occurred on March 5, 2022. Interventions Patients were randomly assigned to receive high-flow oxygen (n = 357) or standard oxygen delivered through a nonrebreathing mask initially set at a 10-L/min minimum (n = 354). Main Outcomes and Measures The primary outcome was mortality at day 28. There were 13 secondary outcomes, including the proportion of patients requiring intubation, number of ventilator-free days at day 28, mortality at day 90, mortality and length of stay in the ICU, and adverse events. Results Among the 782 randomized patients, 711 patients with respiratory failure due to COVID-19 were included in the analysis (mean [SD] age, 61 [12] years; 214 women [30%]). The mortality rate at day 28 was 10% (36/357) with high-flow oxygen and 11% (40/354) with standard oxygen (absolute difference, –1.2% [95% CI, –5.8% to 3.4%]; P = .60). Of 13 prespecified secondary outcomes, 12 showed no significant difference including in length of stay and mortality in the ICU and in mortality up until day 90. The intubation rate was significantly lower with high-flow oxygen than with standard oxygen (45% [160/357] vs 53% [186/354]; absolute difference, –7.7% [95% CI, –14.9% to –0.4%]; P = .04). The number of ventilator-free days at day 28 was not significantly different between groups (median, 28 [IQR, 11-28] vs 23 [IQR, 10-28] days; absolute difference, 0.5 days [95% CI, –7.7 to 9.1]; P = .07). The most common adverse events were ventilator-associated pneumonia, occurring in 58% (93/160) in the high-flow oxygen group and 53% (99/186) in the standard oxygen group. Conclusions and Relevance Among patients with respiratory failure due to COVID-19, high-flow nasal cannula oxygen, compared with standard oxygen therapy, did not significantly reduce 28-day mortality. Trial Registration ClinicalTrials.gov Identifier: NCT04468126

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 26/09/2022
• Auteurs : Raphaël GarinPierre-Jean BouvetPhilippe ForjonelBeatrice Tomasi
• Organismes : Systèmes Embarqués, Acoustique et Télécommunications Systèmes Embarqués, Acoustique et Télécommunications Systèmes Embarqués, Acoustique et Télécommunications Systèmes Embarqués, Acoustique et Télécommunications

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 26/09/2022
• Auteurs : Florian ThibordDerek KlarinJennifer A. BrodyMing-Huei ChenMichael G. LevinDaniel I. ChasmanEllen L. GoodeKristian HveemMaris Teder-LavingAngel Martinez-PerezDylan AissiDelphine Daian-BacqKaoru ItoPradeep NatarajanPamela L. LutseyGirish N. NadkarniPaul S. de VriesGabriel Cuellar-PartidaBrooke N. WolfordJack W. PatteeCharles KooperbergSigrid K. BraekkanRuifang Li-GaoNoemie SautCorriene SeptMarine GermainRenae L. JudyKerri L. WigginsDarae KoChristopher J. O'DonnellKent D. TaylorFranco GiulianiniMariza de AndradeTherese H. NostAnne BolandJean-Philippe EmpanaSatoshi KoyamaThomas GillilandRon DoJennifer E. HuffmanXin WangWei ZhouJose Manuel SoriaJuan Carlos SoutoNathan PankratzJeffery HaesslerKristian HindbergFrits R. RosendaalConstance TurmanRobert OlasoRachel L. KemberTraci M. BartzJulie A. LynchSusan R. HeckbertSebastian M. ArmasuBen BrumptonDavid M. SmadjaXavier JouvenIssei KomuroKatharine R. ClaphamRuth J. F. LoosCristen J. WillerMaria Sabater-LlealJames S. PankowAlexander P. ReinerVania M. MorelliPaul M. RidkerAstrid van Hylckama VliegJean-Francois DeleuzePeter KraftDaniel J. RaderKyung Min LeeBruce M. PsatyAnne Heidi SkogholtJoseph EmmerichPierre SuchonStephen S. RichHa My T VyWeihong TangRebecca D. JacksonJohn-Bjarne HansenPierre-Emmanuel MorangeChristopher KabrhelDavid-Alexandre TregouetScott M. DamrauerAndrew D. JohnsonNicholas L. Smith
• Organismes : Bordeaux population health Centre National de Recherche en Génomique Humaine Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research Bordeaux population health Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire Centre National de Recherche en Génomique Humaine Innovations thérapeutiques en hémostase = Innovative Therapies in Haemostasis Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire Centre National de Recherche en Génomique Humaine Centre for Research in Epidemiology and Statistics | Centre de Recherche Épidémiologie et Statistiques Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research Bordeaux population health
• Publié dans Circulation le 29/10/2020

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Résumé : BACKGROUND: Venous thromboembolism (VTE) is a life-threatening vascular event with environmental and genetic determinants. Recent VTE genome-wide association studies (GWAS) meta-analyses involved nearly 30 000 VTE cases and identified up to 40 genetic loci associated with VTE risk, including loci not previously suspected to play a role in hemostasis. The aim of our research was to expand discovery of new genetic loci associated with VTE by using cross-ancestry genomic resources. METHODS: We present new cross-ancestry meta-analyzed GWAS results involving up to 81 669 VTE cases from 30 studies, with replication of novel loci in independent populations and loci characterization through in silico genomic interrogations. RESULTS: In our genetic discovery effort that included 55 330 participants with VTE (47 822 European, 6320 African, and 1188 Hispanic ancestry), we identified 48 novel associations, of which 34 replicated after correction for multiple testing. In our combined discovery-replication analysis (81 669 VTE participants) and ancestry-stratified meta-analyses (European, African, and Hispanic), we identified another 44 novel associations, which are new candidate VTE-associated loci requiring replication. In total, across all GWAS meta-analyses, we identified 135 independent genomic loci significantly associated with VTE risk. A genetic risk score of the significantly associated loci in Europeans identified a 6-fold increase in risk for those in the top 1% of scores compared with those with average scores. We also identified 31 novel transcript associations in transcriptome-wide association studies and 8 novel candidate genes with protein quantitative-trait locus Mendelian randomization analyses. In silico interrogations of hemostasis and hematology traits and a large phenome-wide association analysis of the 135 GWAS loci provided insights to biological pathways contributing to VTE, with some loci contributing to VTE through well-characterized coagulation pathways and others providing new data on the role of hematology traits, particularly platelet function. Many of the replicated loci are outside of known or currently hypothesized pathways to thrombosis. CONCLUSIONS: Our cross-ancestry GWAS meta-analyses identified new loci associated with VTE. These findings highlight new pathways to thrombosis and provide novel molecules that may be useful in the development of improved antithrombosis treatments.

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Fichiers liés : article.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 24/09/2022
• Auteurs : Paul PetitgasPierre TattevinAlexandra MaillesPierre FillâtreJean-Paul StahlSophie AbgrallLaurent ArgaudXavier ArgemiNathalie AsserayGuillaume BailleAurélie BaldolliJulien BiberonCharlotte BironGeneviève Blanchet-FourcadeMathieu BlotAnne BonnetainElisabeth Botelho-NeversFrédéric BourdainDavid BoutoilleHélène BrasmeCédric BruelFabrice BruneelRodolphe BuzeleEtienne CanouïPhilippe CasenaveBernard CastanCharles CazanaveCéline CazorlaThibault Challan-BelvalPascal ChavanetCatherine ChirouzeTomasz ChroboczekJohan CourjonThomas BrouckerArnaud BlanchardièreEtienne MontmollinThècle DegrooteMarine DelarocheEric DenesColin DeschanvresCapucine Diard-DetoeufAurélien DinhOlivier EpaulardPierre FillatreEmmanuel ForestierThibault FraisseMarie FroidureBenjamin GaboritAmandine Gagneux-BrunonNicolas GaillardArnaud GalboisMathieu GodementFrançois GoehringerSimon GravierValentin GreigertIsabelle GueitThomas GuimardCarole HenryMaxime HentzienJean-Etienne HerbrechtPierre JaquetFanny JommierLydie KatchatourianSolene KerneisJessica KrauseManuela CamMarion MaréchalGwenael MoalPaul TurnierRaphael LecomteAnne-Sophie LecompteRomain LefaucheurStéphanie LejeuneXavier LescureOlivier LesieurPhilippe LespritGuillaume LouisChristelle LucasRafaël MahieuAlain MakinsonGuillaune MarcAlexandre MariaNathalie MarinAurélie MartinGuillaume Martin-BlondelMartin MartinotAlexandre MasPhilippe MateuMorgan MattLaurence MaulinFrédéric MechaiJean-Paul MiraEugénie MutezJérémie OrainAnne Schieber-PachartNathalie PansuSolene Patrat-DelonPatricia PaveseHélène PelerinVéronique Pelonde-EriméeIsabelle PierreDiane PonscarmeDimitri PsimarasMathilde PugesMathilde Reveillon-IstinSylvain RheimsAurélie Richard-MornasAgnès RichéVincent RoubeauYvon RuchIsabelle RungeHélène SaviniRomain SonnevilleJean-Paul StahlPierre TattevinKelly TierceletSaber TouatiJean-Marie TurmelIsabelle TyvaertMarc-Olivier VareilMagalie Vidal-RouxVirginie VitratHeidi WilleMathieu ZuberLaurent Almoyna-MartinezOlivier BouchaudThomas BrouckerFabrice BruneelBernard CastanEric DenesOlivier EpaulardNadine GirardJean-Louis HerrmannJérôme HonnoratAlexandra MaillesPatrice MorandFrançois RaffiFrance RoblotJean-Paul StahlRomain SonnevillePierre Tattevin
• Organismes : Lille Neurosciences & Cognition - U 1172
• Publié dans Infection le 27/10/2020

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 23/09/2022
• Auteurs : Leresche Even Doneilly Oyaba YindaRichard OnangaPierre Philippe Mbehang NguemaEtienne François Akomo-OkoueGontran Nsi AkoueNeil Michel Longo PendyDesire Otsaghe EkoreRoméo Wenceslas LendambaArsène Mabika-MabikaJean Constant Obague MbeangNatacha PoungouJacques François MavoungouSylvain Godreuil
• Organismes : Centre International de Recherches Médicales de Franceville Institut de Recherche en Ecologie Tropicale Libreville Institut de Recherche en Ecologie Tropicale Libreville Institut de Recherche en Ecologie Tropicale Libreville École normale supérieure - Libreville Centre International de Recherches Médicales de Franceville Centre International de Recherches Médicales de Franceville Centre International de Recherches Médicales de Franceville Unité de Rétrovirologie [Franceville] Institut de Recherche en Ecologie Tropicale Libreville Institut de Recherche en Ecologie Tropicale Libreville Institut de Recherche en Ecologie Tropicale Libreville Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle
• Publié dans Pathogens le 26/10/2020

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Résumé : Background: Terrestrial mammals in protected areas have been identified as a potential source of antimicrobial-resistant bacteria. Studies on antimicrobial resistance in gorillas have already been conducted. Thus, this study aimed to describe the phylogroups, pathotypes and prevalence of antimicrobial resistance of Escherichia coli isolated from western lowland gorilla's faeces living in MDNP. (2) Materials and Methods: Ninety-six faecal samples were collected from western lowland gorillas (Gorilla gorilla gorilla) during daily monitoring in the MDNP. Sixty-four E. coli isolates were obtained and screened for phylogenetic and pathotype group genes by polymerase chain reaction (PCR) after DNA extraction. In addition, antimicrobial susceptibility was determined by the disk diffusion method on Mueller Hinton agar. (3) Results: Sixty-four (64%) isolates of E. coli were obtained from samples. A high level of resistance to the beta-lactam family, a moderate rate for fluoroquinolone and a low rate for aminoglycoside was obtained. All E. coli isolates were positive in phylogroup PCR with a predominance of A (69% ± 11.36%), followed by B2 (20% ± 19.89%) and B1 (10% ± 8.90%) and low prevalence for D (1% ± 3.04%). In addition, twenty E. coli isolates (31%) were positive for pathotype PCR, such as EPEC (85% ± 10.82%) and EPEC/EHEC (15% ± 5.18%) that were obtained in this study. The majority of these MDR E. coli (DECs) belonged to phylogenetic group A, followed by MDR E. coli (DECs) belonging to group B2. (4) Conclusion: This study is the first description of MDR E. coli (DECs) assigned to phylogroup A in western lowland gorillas from the MDNP in Gabon. Thus, wild gorillas in MDNP could be considered as asymptomatic carriers of potential pathogenic MDR E. coli (DECs) that may present a potential risk to human health

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Fichiers liés : pathogens-11-01082.pdf

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 22/09/2022
• Auteurs : Pierre DériozPhilippe Béringuier
• Organismes : UMR 228 Espace-Dev, Espace pour le développement Géographie de l'environnement

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Résumé : La communication examine d'abord les différentes problématiques paysagères du territoire (déprise et remontée forestière, arrêt de l'activité industrielle), et présente les politiques publiques mise en oeuvre pour les prendre en charge, à différentes échelles et par différents acteurs. Elle se focalise ensuite sur l'analyse de la démarche de Plan de Paysage (2019-22), lancée à l'instigation du PNR des Pyrénées Ariégeoises, et qui paraît encore souffrir d’un défaut de mobilisation et d’appropriation sociales.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 21/09/2022
• Auteurs : Adeline PaumierAntoine Asquier-KhatiSonia ThibautThomas CoefficOlivier LemenandStéphanie LarramendyBrice LeclèreJocelyne CaillonDavid BoutoilleGabriel BirgandSophie PoyetGuillaume DelégliseLydie LibierSimon BenzimraDenis LaforestLaurent ClotteauKarine MichezMarie-Jeanne Blanc-GalibyFranck KerdavidBrigitte Coude Du ForestoFrançois MailletHubert BanctelJean LacrozeMarie-Pierre ThibaultEric GrandsirePierre-Yves LéonardJean-Francois CulardAnne HolsteinBeatrice DubetSebastien FougnotBruno GuesnonAnne-Sophie ReinhardJean Philippe RaultBrieuc GestinJerome FleuranceAlisson VrainPhilippe AndorinGéoffroy de GastinesChristine FantinatoVidal PlongNicolas Le MoingEmilie PradierRegis GouarinDidier GrisardStéphanie ArseneElodie JobertCharles VeronGérard PayroAnnie AlleryHelene ValadeDelphine BoraudRemi GebeileElisabeth ParisiFrancoise AlluinCaroline CoulonGuillaume TeissierArnaud FrançoisGilles DefranceGisele GayOlivier DuquesnoyFabienne ArturSylvain MilletPierre MarchenayNorbert DesbiollesMarie Carole PaoliniEugénie MbengaArel DesjardinsChristian Ehret
• Organismes : Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes] Département de médecine générale [Nantes Université - UFR de Médecine et des Techniques Médicales] MedQual network MedQual network Centre hospitalier de Saint-Nazaire Département de médecine générale [Nantes Université - UFR de Médecine et des Techniques Médicales] Pôle de santé Publique - PIMESP [CHU Nantes] Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital Centre d’Investigation Clinique de Nantes Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital Laboratoire Biolab 33 Floirac UNIROUEN - UFR Santé Laboratoire ATOUTBIO, unité de microbiologie, Nancy F-54000, France
• Publié dans JAMA Network Open le 29/10/2020

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Résumé : IMPORTANCE Extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli is considered a leading pathogen contributing to the global burden of antimicrobial resistance. OBJECTIVE To better understand factors associated with the heterogeneity of community-acquired ESBL-producing E coli urinary tract infections (UTIs) in France. DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS This cross-sectional study performed from January 1 to December 31, 2021, was based on data collected via PRIMO (Surveillance and Prevention of Antimicrobial Resistance in Primary Care and Nursing Homes), a nationwide clinical laboratory surveillance system in France. Strains of E coli isolated from community urine samples from January 1 to December 31, 2019, from 59 administrative departments of metropolitan France were included. MAIN OUTCOMES AND MEASURES Quasi-Poisson regression models were used to assess the associations between several ecological factors available on government and administration websites between 2010 and 2020 (demographic population structure, living conditions, baseline health care services, antibiotic consumptions, economic indicators, animal farming density, and environmental characteristics) and the number of ESBL-producing E coli strains isolated from urine samples of individuals with community-acquired UTI in 2019.

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Fichiers liés : paumier_2022_oi_220931_1663173096.81259.pdf

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