Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2023
• Auteurs : Vincent CottinPhilippe BonniaudJacques CadranelBruno CrestaniStéphane JouneauSylvain Marchand-AdamHilario NunesLidwine Wémeau-StervinouEmmanuel BergotElodie BlanchardRaphaël BorieArnaud BourdinCécile ChenivesseAnnick ClémentEmmanuel GomezAnne GondouinSandrine HirschiFrançois LebargyCharles-Hugo MarquetteDavid MontaniGrégoire PrévotSébastien QuetantMartine Reynaud-GaubertMathieu SalaunOlivier SanchezBruno TrumbicKarim BerkaniPierre Yves BrilletMarion CampanaLara ChalabreysseGérard ChattéDidier DebieuvreGilbert FerrettiJean-Michel FourrierNicolas JustMarianne KambouchnerBertrand LegrandFrédéric Le GuillouJean-Pierre LhuillierAnas MehdaouiJean-Marc NaccacheCatherine PaganonMartine Rémy-JardinSalim Si-MohamedPhilippe Terrioux
• Organismes : Infections Virales et Pathologie Comparée - UMR 754 Centre national de référence des maladies pulmonaires rares [Lyon] Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand Service de Pneumologie Soins Intensifs, Appareillage Respiratoire [CHU de Dijon] AP-HP - Hôpital Tenon AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris] Institut de recherche en santé, environnement et travail École des Hautes Études en Santé Publique Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours AP-HP - Hôpital Avicenne Institut Coeur Poumon [CHU Lille] CHU Caen Normandie – Centre Hospitalier Universitaire de Caen Normandie CHU Pessac AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris] Physiologie & médecine expérimentale du Cœur et des Muscles [U 1046] Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 Maladies génétiques d'expression pédiatrique Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg Hôpital universitaire Robert Debré [Reims] Hôpital Pasteur [Nice] Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse CHU de Grenoble-Alpes - Centre Hospitalier Universitaire CHU Grenoble CHU Marseille Microbes Evolution Phylogénie et Infections Centre d'Investigation Clinique [CHU Rouen] Laboratoire d'Informatique, du Traitement de l'Information et des Systèmes AP-HP - Hôpital Européen Georges Pompidou Hypoxie et Poumon : pneumopathologies fibrosantes, modulations ventilatoires et circulatoires Centre Hospitalier Régional d'Orléans Hospices Civils de Lyon Centre Hospitalier Emile Muller [Mulhouse] CHU de Grenoble-Alpes - Centre Hospitalier Universitaire CHU Grenoble AP-HP - Hôpital Avicenne Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694 Centre Hospitalier Eure-Seine - Hôpital d'Evreux et de Vernon Groupe Hospitalier Paris Saint-Joseph Services de Pneumologie, Exploration Fonctionnelle Respiratoire et Cardiologie Institut Coeur Poumon [CHU Lille] Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé
• Publié dans Respiratory Medicine and Research le 28/10/2020

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Résumé : BACKGROUND: Since the previous French guidelines were published in 2017, substantial additional knowledge about idiopathic pulmonary fibrosis has accumulated. METHODS: Under the auspices of the French-speaking Learned Society of Pulmonology and at the initiative of the coordinating reference center, practical guidelines for treatment of rare pulmonary diseases have been established. They were elaborated by groups of writers, reviewers and coordinators with the help of the OrphaLung network, as well as pulmonologists with varying practice modalities, radiologists, pathologists, a general practitioner, a head nurse, and a patients’ association. The method was developed according to rules entitled "Good clinical practice" in the overall framework of the "Guidelines for clinical practice" of the official French health authority (HAS), taking into account the results of an online vote using a Likert scale. RESULTS: After analysis of the literature, 54 recommendations were formulated, improved, and validated by the working groups. The recommendations covered a wide-ranging aspects of the disease and its treatment: epidemiology, diagnostic modalities, quality criteria and interpretation of chest CT, indication and modalities of lung biopsy, etiologic workup, approach to familial disease entailing indications and modalities of genetic testing, evaluation of possible functional impairments and prognosis, indications for and use of antifibrotic therapy, lung transplantation, symptom management, comorbidities and complications, treatment of chronic respiratory failure, diagnosis and management of acute exacerbations of fibrosis. CONCLUSION: These evidence-based guidelines are aimed at guiding the diagnosis and the management in clinical practice of idiopathic pulmonary fibrosis.

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Fichiers liés : 2023 Cottin et al.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2023
• Auteurs : Victor MercierValérie BruMarie-Elisabeth BougnouxLaurence DelhaesFrançoise BotterelDanièle MaubonFrédéric DalleAlexandre AlanioSandrine HouzéEric DannaouiCarole CassagneSophie CassaingMarie-Fleur DurieuxArnaud FekkarJean-Philippe BoucharaJean-Pierre GangneuxJulie BonhommeDamien DupontDamien CostaBoualem SendidTaieb ChouakiNathalie BourgeoisAntoine HugueninSophie BrunCaroline MahincLilia HasseineSolène Le GalAnne‐Pauline BellangerEric BaillyFlorent MorioCéline NourrissonNicole Desbois-NogardEstelle CateauAnne DebourgogneHélène YeraLaurence LachaudMilène Sasso
• Organismes : Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes Dynamique des interactions hôte pathogène AP-HP - Hôpital Necker - Enfants Malades Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux] Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] Dynamic Microbiology - EA 7380 Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon) Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] Vin Aliment Microbiologie et Stress AP-HP - Hôpital Saint-Louis [Paris] Mycologie moléculaire - Molecular Mycology Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris] Université Paris Cité Unité de Parasitologie-Mycologie [CHU HEGP] Université Paris Cité Dynamic Microbiology - EA 7380 Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse CHU Limoges AP-HP - Hôpital de la Pitié Salpêtrière Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses Infections Respiratoires Fongiques SFR UA 4208 Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques Centre Hospitalier Universitaire d'Angers Institut de recherche en santé, environnement et travail École des Hautes Études en Santé Publique Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Pontchaillou] CHU Caen Normandie – Centre Hospitalier Universitaire de Caen Normandie Aliments Bioprocédés Toxicologie Environnements Hospices Civils de Lyon Université de Rouen Normandie Département de Microbiologie [CHU Rouen] UNIROUEN - UFR Santé Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale CHU Amiens-Picardie Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle Epidémiosurveillance de protozooses à transmission alimentaire et vectorielle AP-HP - Hôpital Avicenne Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] Centre Hospitalier Universitaire de Nice Infections Respiratoires Fongiques SFR UA 4208 Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques Laboratoire de Parasitologie et Mycologie [CHRU Brest] Service de parasitologie et mycologie [CHRU de Besançon] Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité - UR 1155 Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte Infection Inflammation et Interaction Hôtes Pathogènes [CHU Clermont-Ferrand] Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique] Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital Écologie et biologie des interactions [UMR 7267] Stress, Immunité, Pathogènes Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy Service de parasitologie-mycologie [CHU Cochin] Institut Cochin Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes
• Publié dans Clinical Microbiology and Infection le 30/10/2020

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Résumé : Objectives: To determine the epidemiological cut-off values (ECVs) of ten antifungal agents in a wide range of yeasts and Aspergillus spp. using gradient concentration strips.Methods: The minimum inhibitory concentrations for amphotericin B, anidulafungin, caspofungin, micafungin, flucytosine, fluconazole, itraconazole, isavuconazole, posaconazole, and voriconazole, determined with gradient concentration strips at 35 French microbiology laboratories between 2002 and 2020, were retrospectively collected. Then, the ECVs were calculated using the iterative method and a cut-off value of 97.5%.Results: Minimum inhibitory concentrations were available for 17 653 clinical isolates. In total, 48 ECVs (including 32 new ECVs) were determined: 29 ECVs for frequent yeast species (e.g. Candida albicans and itraconazole/flucytosine, and Candida glabrata species complex [SC] and flucytosine) and rare yeast species (e.g. Candida dubliniensis, Candida inconspicua, Saccharomyces cerevisiae, and Cryptococcus neoformans) and 19 ECVs for Aspergillusflavus SC, Aspergillusfumigatus SC, Aspergillusnidulans SC, Aspergillusniger SC, and Aspergillusterreus SC.Conclusions: These ECVs can be added to the already available gradient concentration strip-specific ECVs to facilitate minimum inhibitory concentration interpretation and streamline the identification of nonwild type isolates.

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Fichiers liés : S1198743X22006036.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2023
• Auteurs : Philippe MerleJean-Frédéric BlancJulien EdelineKarine Le MalicotManon AllaireEric AssenatMeriem GuarssifiMohamed BouattourJean-Marie PéronPierre Laurent-PuigMassimo LevreroCharlotte CostentinBoris GuiuHarry SokolDavid TougeronThomas AparicioJean-Charles NaultJean-Marc Phélip
• Organismes : Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Oncogenesis, Stress, Signaling Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] AP-HP - Hôpital de la Pitié Salpêtrière Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] UFR Sciences Fondamentales et Biomédicales [Sciences] - Université Paris Cité Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) CHU Montpellier = Montpellier University Hospital Institut Desbrest d'Epidémiologie et de Santé Publique Centre de Recherche Saint-Antoine FHU Paris Center for Microbiome Medicine Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital GHU AP-HP. Université Paris Saclay Centre de Recherche des Cordeliers Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne]
• Publié dans Digestive and Liver Disease le 01/11/2020

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Résumé : A substantial proportion of patients with hepatocellular carcinoma have to face up, sooner or later, to systemic therapy. The current standards as first line systemic therapies are either atezolizumab (anti-PD-L1) plus bevacizumab (anti-VEGF), or durvalumab (anti-PD-L1) plus tremelimumab (anti-CTLA-4). However, the median overall survival remains below 20 months, and a minority of patients become long-term survivors. Of interest in immune-oncology strategies for hepatocellular carcinoma, the objective response seems to be the most reliable surrogate marker of better overall survival. TRIPLET-HCC (NCT05665348) is a multicentre, randomised, open-label phase II-III trial designed to evaluate efficacy and safety of the triple combination by the addition of ipilimumab (anti-CTLA-4) to atezolizumab/bevacizumab, versus the double atezolizumab/bevacizumab combination. The main inclusion criteria are histologically proven BCLC-B/C HCC without previous systemic therapy. The primary objective of the phase II is the objective response rate in the triple arm, and OS in the triple versus double arms in the phase III. Secondary endpoints common to the phases II and III are the comparisons of progression-free survival, objective response rates, tolerance and quality of life. In addition, genetic and epigenetic studies from tissue and circulating DNA/RNA will be conducted to assess their prognostic or predictive value.

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Fichiers liés : S1590865823001913.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2023
• Auteurs : Sean BagshawAry Serpa NetoOrla SmithMatthew WeirHaibo QiuBin DuAmanda WangMartin GallagherRinaldo BellomoRon WaldSean BagshawNeill AdhikariDidier DreyfussDu BinMartin GallagherStéphane GaudryFrançois LamontagneMichael JoannidisKathleen LiuDaniel McauleyShay McguinnessAlistair NicholMarlies OstermannPaul PalevskyVille PettiläAntoine SchneiderOrla SmithSuvi VaaraGlenn EastwoodLeah PeckHelen YoungPeter KrugerGordon LaurieEmma SaylorJason MeyerEllen VenzKrista WetzigCraig FrenchForbes McgainJohn MulderGerard FennessySathyajith KoottayiSamantha BatesMiriam TownsRebecca MorganAnna TippettAndrew UdyChris MasonElisa LicariDashiell GantnerJason McclureAlistair NicholPhoebe MccrackenJasmin BoardEmma MartinShirley VallanceMeredith YoungChelsey VladicSteve McgloughlinDavid GattasHeidi BuhrJennifer ColesDebra HutchJames WunLouise ColeChristina WhiteheadJulie LowreyKristy MastersRebecca GreshamVictoria CampbellDavid GutierrezJane BrailsfordLoretta ForbesLauren MurrayTeena MaguireMartina NichonghaileNeil OrfordAllison BoneTania ElderkinTania SalernoTim ChimundaJason FletcherEmma BroadfieldSanjay PorwalCameron KnottCatherine BoschertJulie SmithAngus RichardsonDianne HillGraeme DukePeter OziemskiSantiago CegarraPeter ChanDeborah WelshStephanie HunterOwen RoodenburgJohn DyettNicos KokotsisMax MoserYang YangLaven PadayacheeJoseph VetroHimangsu GangopadhyayMelissa KaufmanAngaj GhoshSimone SaidAlpesh PatelShailesh BihariElisha MathesonXia JinTapaswi ShresthaKate SchwartzMartin GallagherRosalba CrossWinston CheungHelen WongMark KolAsim ShahAmanda WangZoltan EndreCelia BradfordPierre JaninSimon FinferNaomi DielJonathan GatwardNaomi HammondAnthony DelaneyFrances BassElizabeth YaradHergen BuscherClaire ReynoldsNerilee BakerMichael JoannidisRomuald BellmannAndreas PeerJulia HasslacherPaul KoglbergerSebastian KleinKlemens ZotterAnna BrandtnerArmin FinkenstedtAdelheid DitlbacherFrank HartigDietmar FriesMirjam BachlerBettina SchenkMartin WagnerPhilipp EllerThomas StaudingerEsther TillerPeter SchellongowskiAndja BojicEric HosteStephanie BrackeLuc de CropDaisy VermeirenFernando ThomeBianca ChiellaLucia FendtVeronica AntunesJean-Philippe LafranceFrançois LamontagneFrédérick D’aragonCharles St-ArnaudMichael MayetteÉlaine CarbonnaeuJoannie MarchandMarie-Hélène MasseMarilène LadouceurAlexis TurgeonFrançois LauzierDavid BellemareCharles Langis FrancoeurGuillaume LeblancGabrielle GuilbaultStéphanie GrenierEve CloutierAnnick BoivinCharles Delisle-ThibaultPanagiota GiannakourosOlivier CosterousseJean-François CailhierFrançois-Martin CarrierAli GhamraouiMartine LebrasseurFatna BenettaibMaya SalaméDounia BoumahniYing Tung SiaJean-François NaudIsabelle RoyHenry StelfoxStacey RuddellBraden MannsShelley DugganDominic CarneyJennifer BarchardRichard WhitlockEmilie Belley-CoteNevena SavijaAlexandra SabevTroy CampbellThais CrearyKelson DevereauxShira BrodutchClaudio RigattoBojan PaunovicOwen MooneyAnna GlybinaOksana HarasemiwMichelle Di NellaJohn HarmonNavdeep MehtaLouis LakatosNicole HaslamFrancois LelloucheMathieu SimonYing TungPatricia LizottePierre-Alexandre BourchardBram RochwergTim KarachiTina MillenJohn MuscedereDavid MasloveJ. Gordon BoydStephanie SibleyJohn DroverMiranda HuntIlinca GeorgescuRandy WaxIlan LengaKavita SridharAndrew SteeleKelly FuscoTaneera GhateMichael TolibasHolly RobinsonMatthew WeirRavi TanejaIan BallAmit GargEileen CampbellAthena OvsenekSean BagshawSean van DiepenNadia BaigSheldon MagderHan YaoAhsan AlamJosie CampisiErika MacintyreElla RokoshKimberly ScherrStephen LapinskySangeeta MehtaSumesh ShahDaniel NivenHenry StelfoxStacey RuddellMichael RussellKym JimGillian BrownKerry OxtobyAdam HallLuc BenoitColleen SokolowskiBhanu PrasadJag RaoShelley GiebelDemetrios KutsogiannisPatricia ThompsonTayne ThompsonRobert CironeKanthi KavikondalaMark SothFrance ClarkeAlyson TakaokaDavid MazerKaren BurnsJan FriedrichDavid KleinGyan SandhuMarlene SantosImrana KhalidJennifer HodderPeter DodekNajib AyasVictoria AlcuazGabriel SuenOleksa RewaGurmeet SinghSean NorrisNeil GibsonCastro AriasAysha ShamiCeline PelletierNeill AdhikariAlireza ZahiriehAndre AmaralNicole MarinoffNavjot KaurAdic PerezJane WangGregory HaljanChristopher CondinLauralyn McintyreBrigette GomesRebecca PorteousIrene WatpoolSwapnil HiremathEdward ClarkMargaret HerridgeFelicity BackhouseM. Elizabeth WilcoxKarolina WalczakVincent KiAsheer SharmanMartin RomanoSean BagshawR. GibneyAdam RomanovskyOleksa RewaLorena MccoshenNadia BaigGordon WoodDaniel OvakimFiona AuldGayle CarneyMeili DuanXiaojun JiDongchen GuoZhili QiJin LinMeng ZhangLei DongJingfeng LiuPei LiuDeyuan ZhiGuoqiang BaiYu QiuZiqi YangJing BaiZhuang LiuHaizhou ZhuangHaiman WangJian LiMengya ZhaoXiao ZhouXianqing ShiBaning YeManli LiuJing WuYongjian FuDali LongYu PanJinlong WangHuaxian MeiSongsong ZhangMingxiang WenEnyu YangSijie MuJianquan LiTingting HuBingyu QinMin LiCunzhen WangXin DongKaiwu WangHaibo WangJianxu YangDu BinChuanyao WangDongxin WangNan LiZhui YuSong XuLan YaoGuo HouZhou LiuLiping LuYingtao LianChunting WangJichen ZhangRuiqi DingGuoqing QiQizhi WangPeng WangZhaoli MengMan ChenXiaobo HuXiandi HeShibing ZhaoLele HangRui LiSuhui QinKun LuShijuan DunCheng LiuQi ZhouZhenzhen ChenJing MeiMinwei ZhangHao XuJincan LinQindong ShiLijuan FuQinjing ZengHongye MaJinqi YanLan GaoHongjuan LiuLei ZhangHao LiXiaona HeJingqun FanLitao GuoYu LiuXue WangJingjing SunZhongmin LiuJuan YangLili DingLulu ShengXingang LiuJie YanQuihui WangYifeng WangDan ZhaoShuangping ZhaoChenghuan HuJing LiFuxing DengHaibo QuiYi YangMin MoChun PanChangde WuYingzi HuangLili HuangAiran LiuVille PettiläSuvi VaaraAnna-Maija KorhonenSanna TörnblomSari SutinenLeena PettiläJonna HeinonenEliria LappiTaria SuhonenSari KarlssonSanna HoppuVille JalkanenAnne KuitunenMarkus LevorantaJaakko LångsjöSanna RistimäkiKaisa MalilaAnna WoottenSimo VarilaMikko JärvisaloOuti InkinenSatu KentalaKeijo LeivoPaivi HaltiaDidier DreyfussJean-Damien RicardJonathan MessikaAbirami TiagarajahMalo EmeryAline DechanetCoralie GernezDamien RouxLaurent Martin-LefevreMaud FiancetteIsabelle VinatierJean Claude LacheradeGwenhaël ColinChristine LebertMarie-Ange AzaisAihem YehiaCaroline PoupletMatthieu Henry-LagarrigueAmélie SeguinLaura CrosbyJulien MaizelDimitri Titeca-BeauportAlain CombesAnia NieszkowskaPaul MasiAlexandre DemouleJulien MayauxMartin DresElise MorawiecMaxens DecalveleSuela DemiriMorgane FaureClémence MariosMaxime MalletMarie Amélie OrdonLaura MorizotMarie CantienFrançois PoussetStéphane GaudryFlorent PoirsonYves CohenLaurent ArgaudMartin CourLaurent BitkerMarie SimonRomain HernuThomas BaudrySylvie de la SalleAdrien RobineNicholas SedillotXavier TchenioCamille BouisseSylvie RouchSaber Davide BarbarRémi TrussonFabienne TamionSteven GrangéDorothée CarpentierGuillaume ChevrelLuis Ensenyat-MartinSophie MarqueJean-Pierre QuenotPascal AndreuAuguste DargentAudrey LargeNicolas ChudeauMickael LandaisBenoit DerrienJean Christophe CallahanChristophe GuittonCharlène Le MoalAlain RobertKarim AsehnouneRaphael CinottiNicolas GrillotDominique DemeureChristophe VinsonneauImen RahmaniMehdi MarzoukThibault DekeyserCaroline SejourneMélanie VerlayFabienne TheveninLucie DelecolleDidier TheveninBertrand SouweineElisabeth CoupezMireille AddaJean-Pierre EraldiAntoine MarchalotNicolas de ProstArmand Mekontso DessapKeyvan RazaziFerhat MezianiJulie Boisrame-HelmsRaphaël Clere-JehlXavier DelabrancheChristine KummerlenHamid MerdjiAlexandra MonnierYannick RabouelHassene RahmaniHayat AllamSamir ChenafVincenta FranjaBertrand PonsMichel CarlesFrédéric MartinoRégine RichardBenjamin ZuberGuillaume LacaveKarim LakhalBertrand RozecHoa Dang VanÉric BouletFouad FadelCedric CleophaxNicolas DufourCaroline GrantMarie ThuongJean ReignierEmmanuel CanetLaurent NicoletThierry BoulainMai-Anh NayDalila BenzekriFrançois BarbierAnne BretagnolToufik KamelArmelle MathonnetGrégoire MullerMarie SkarzynskiJulie RossiAmandine PradetSandra dos SantosAurore GueryLucie MullerLuis FelixJulien BohéGuillaume ThiéryNadia AissaouiDamien VimpereMorgane CommeureucJean-Luc DiehlEmmanuel GuerotOrfeas LiangosMonika WittigAlexander ZarbockMira KüllmarThomas van WaegeninghNadine RosenowAlistair NicholKathy BrickellPeter DoranPatrick MurrayGiovanni LandoniRosalba LemboAlberto ZangrilloGiacomo MontiMargherita TozziMatteo MarzaroliGaetano LombardiGianluca PaternosterMichelangelo VitielloShay McguinnessRachael ParkeMagdalena ButlerEileen GilderKeri-Anne CowdreySamantha WallaceJane HallionMelissa WoolettPhilippa NealKarina DuffyStephanie LongColin McarthurCatherine SimmondsYan ChenRachael McconnochieLynette NewbyDavid KnightSeton HendersonJan MehrtensStacey MorganAnna MorrisKymbalee Vander HaydenTara BurkeMatthew BaileyRoss FreebairnLesley ChadwickPenelope ParkChristine RollsLiz ThomasUlrike BuehnerErin WilliamsJonathan AlbrettSimon KirkhamCarolyn JacksonTroy BrowneJennifer GoodsonDavid JacksonJames HoughtonOwen CallenderVicki HigsonOwen KeetClive DominyPaul YoungAnna HuntHarriet JuddCassie LawrenceShaanti OlatunjiYvonne RobertsonCharlotte Latimer-BellDeborah HendryAgnes Mckay-VucagoNina BeehreEden LesonaLeanlove NavarraChelsea RobinsonRyan JangAndrea JungeBridget LambertAntoine SchneiderMichel ThibaultPhilippe EckertSébastien KisslingErietta PolychronopoulosElettra PoliMarco AltarelliMadeleine SchnorfSamia Abed MallairdClaudia HeideggerAurelie PerretPhilippe MontillierFrederic SanglaSeigenthaller NeilsAude de WattevilleMandeep-Kaur PhullAparna GeorgeNauman HussainTatiana PogrebanSteve LobazAlison DanielsMishell CunninghamDeborah KerrAlice NicholsonPradeep ShanmugasundaramJudith AbramsKatarina MansoGeraldine HambrookElizabeth MckerrowJuvy SalvaStephen FoulkesMatthew WiseMatt MorganJenny BrooksJade ColeTracy Michelle DaviesHelen HillEmma ThomasMarcela VizcaychipiBehrad BaharloJaime CarungcongPatricia CostaLaura MartinsRitoo KapoorTracy HazeltonAngela MoonJanine MusselwhiteBen ShelleyPhilip MccallMarlies OstermannGill ArbaneAneta BociekMartina MarottiRosario LimSara CamposNeus Grau NovellasArmando CennamoAndrew SlackDuncan WyncollLuigi CamporotaSimon SparkesRosalinde TilleyAustin RattrayGayle MorelandJane DuffyElizabeth McgonigalPhilip HopkinsClare FinneyJohn SmithHarriet NobleHayley WatsonClaire-Louise HarrisEmma ClareyEleanor CorcoranJames BeckClare HowcroftNora YoungsElizabeth WilbyBethan OggAdam WolversonSandra LeeSusie ButlerMaryanne OkubanjoJulia HindleIngeborg WeltersKaren WilliamsEmily JohnsonJulie Patrick-HeseltonDavid ShawVictoria WaughRichard StewartEsther MwauraLynn WrenLouise MewSara-Beth SutherlandJane AdderleyJim RuddyMargaret HarkinsCallum KayeTeresa ScottWendy MitchellFelicity AndersonFiona WilloxVijay JagannathanMichele ClarkSarah PurvAndrew SharmanMegan MeredithLucy RyanLouise ConnerCecilia PetersDan HarveyAshraf RoshdyAmy CollinsMalcolm SimSteven HendersonNigel CheeSally PittsKatie BowmanMaria DilawershahLuke VamplewElizabeth HowePaula RogersClara HernandezClara PrendergastJane BentonAlex RosenbergLui ForniAlice GrantPaula CarvelliAjay RaithathaSarah BirdMax RichardsonMatthew NeedhamClaire HirstJonathan BallSusannah LeaverLuisa HowlettCarlos Castro DelgadoSarah Farnell-WardHelen FarrahGeraldine GrayGipsy JosephFrancesca RobinsonAscanio TridenteClare HarropKaren ShukerDerek MclaughlanJudith RamseySharon MeehanBernd Oliver RoseRosie Reece-AnthonyBabita GurungTony WhitehouseCatherine SnelsonTonny VeenithAndy JohnstonLauren CooperRon CarreraKaren EllisEmma FellowsSamanth HarkettColin BerginElaine SpruceLiesl DespyStephanie GoundryNatalie DooleyTracy MasonAmy ClarkGemma DignamGeraldine WardBen AttwoodPenny ParsonsSophie MasonMichael MargarsonJenny LordPhilip McgloneLuke HodgsonIndra ChadbournRaquel GomezJordi MargalefRinus PretoriusAlexandra HamshereJoseph CarterHazel CahillLia GraingerKate HowardGreg ForshawZoe GuyKianoush KashaniRobert AlbrightAmy AmsbaughAnita StoltenbergAlexander NivenMatthew LynchAnnmarie O’maraSyed NaeemSairah SharifJoyce Mckenney GoulartMatthew LynchAnnmarie O’maraSyed NaeemSairah SharifJoyce Mckenney GoulartAshita TolwaniClaretha LyasLaura LattaAzra BihoracHaleh HashemighouchaniPhilip EfronMatthew RuppertJulie CupkaSean KileyJoshua CarsonPeggy WhiteGeorge OmalaySherry BrownLaura VelezAlina MarceronJavier NeyraJuan Carlos AycinenaMadona EliasVictor Ortiz-SorianoCaroline HauschildRobert DorfmanThomas Baudry
• Organismes : Alberta Health Services [Calgary] University of Alberta Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases
• Publié dans Intensive Care Medicine le 27/10/2020

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2023
• Auteurs : Elodie DarboGaëlle PérotLucie DarmuseySophie Le GuellecLaura LeroyLaëtitia GastonNelly DesplatNoémie ThébaultCandice MerlePhilippe RochaixThibaud ValentinGwenaël FerronChristine ChevreauBinh BuiEberhard StoeckleDominique Ranchere-VincePierre MéeusPhilippe TerrierSophie Piperno-NeumannFrançoise CollinGonzague de PinieuxFlorence DuffaudJean-Michel CoindreJean-Yves BlayFrédéric Chibon
• Organismes : Actions for OnCogenesis understanding and Target Identification in ONcology Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Oncopole Claudius Regaud Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Oncopole Claudius Regaud Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Oncopole Claudius Regaud CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux] Actions for OnCogenesis understanding and Target Identification in ONcology Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Oncopole Claudius Regaud Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Oncopole Claudius Regaud Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Oncopole Claudius Regaud Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Oncopole Claudius Regaud Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Oncopole Claudius Regaud Oncopole Claudius Regaud Institut Bergonié [Bordeaux] Institut Bergonié [Bordeaux] Centre Léon Bérard [Lyon] Centre Léon Bérard [Lyon] Institut Gustave Roussy Institut Curie [Paris] Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] CHU Trousseau [APHP] Hôpital de la Timone [CHU - APHM] Actions for OnCogenesis understanding and Target Identification in ONcology Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Oncopole Claudius Regaud
• Publié dans Cancers le 21/10/2020

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Résumé : In leiomyosarcoma (LMS), a very aggressive disease, a relatively transcriptionally uniform subgroup of well-differentiated tumors has been described and is associated with poor survival. The question raised how differentiation and tumor progression, two apparently antagonist processes, coexist and allow tumor malignancy. We first identified the most transcriptionally homogeneous LMS subgroup in three independent cohorts, which we named ‘hLMS’. The integration of multi-omics data and functional analysis suggests that hLMS originate from vascular smooth muscle cells and show that hLMS transcriptional program reflects both modulations of smooth muscle contraction activity controlled by MYOCD/SRF regulatory network and activation of the cell cycle activity controlled by E2F/RB1 pathway. We propose that the phenotypic plasticity of vascular smooth muscle cells coupled with MYOCD/SRF pathway amplification, essential for hLMS survival, concomitant with PTEN absence and RB1 alteration, could explain how hLMS balance this uncommon interplay between differentiation and aggressiveness.

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Fichiers liés : main.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2023
• Auteurs : Jérémy MayenPierre PolsenaereAurore Regaudie de GiouxChristine DupuyMarie VagnerJean-Christophe LemesleBenoit PoitevinPhilippe Souchu
• Organismes : Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais Laboratoire Environnement Ressources Morbihan Pays de Loire Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais Unité Dynamiques des Écosystèmes Côtiers LIttoral ENvironnement et Sociétés Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) Ligue pour la Protection des Oiseaux Laboratoire Environnement Ressources Morbihan Pays de Loire
• Publié dans Regional Studies in Marine Science le 28/10/2020

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Résumé : Within the coastal zone, salt marshes often behave as atmospheric CO2 sinks, allowing for blue carbon (C) sequestration associated with intense autotrophic metabolism. However, C dynamics over salt marshes are complex since various biogeochemical processes and fluxes occur at different terrestrial–aquatic–atmospheric exchange interfaces and spatiotemporal scales. This study focuses on seasonal, tidal and diurnal variations of water pCO2, estimated water–air CO2 fluxes and controlling factors along two temperate shelf–estuary–marsh continuums. The latter include typical coastal systems with artificial salt marshes that have contrasting water management practices and primary producer types. Our high-frequency biogeochemical measurements (seasonal 24-hour cycles) highlighted a strong control of ecosystem typology on inorganic C dynamics with lower water pCO2 values in the artificial salt marshes, due to stronger biological activity and longer water residence times, than in the tidal estuary. In the marine-dominated estuary, water pCO2 variations (267 - 569 ppmv) were strongly controlled by tidal effects and phytoplankton activity particularly in spring/summer. On the contrary, the greatest amplitudes in water pCO2 were recorded in the artificial salt marshes (6 - 721 ppmv) due to intense macrophyte activity. In the rewilded marsh, eutrophication favoured spring/summer fast-growing macroalgae produced, in turn, strong fall atmospheric CO2 outgassing from degraded algae waters and thus a net annual source of CO2 to the atmosphere (17.5 g C m−2 yr−1). Conversely, specific management practices at the working marsh for salt-farming activity favoured rather slow-growing macrophytes (i.e. seagrasses) which greatly contribute to the yearly observed atmospheric CO2 sink (-97.7 g C m−2 yr−1). In this work, we suggest that salt marsh management can be used to control the contribution of primary producers to marsh C budget as atmospheric CO2 (sink and/or source).

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Fichiers liés : 3_Article Mayen et al_water pCO2 and FCO2_Fier d'Ars_Manuscrit.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2023
• Auteurs : Yavuz DegerliFabrice GuillouxTomasz HemperekJean-Pierre MeyerPhilippe Schwemling
• Organismes : Institut de Recherches sur les lois Fondamentales de l'Univers Institut de Recherches sur les lois Fondamentales de l'Univers Institut de Recherches sur les lois Fondamentales de l'Univers Institut de Recherches sur les lois Fondamentales de l'Univers
• Publié dans IEEE Transactions on Nuclear Science le 31/10/2020

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Résumé : MiniCACTUS is a monolithic sensor prototype optimized for timing measurement of charged particles. It has been designed in a standard 150 nm CMOS process without dedicated amplification layer. It is intended as a demonstrator chip for future large-scale timing detectors, like upgrades of timing detectors at LHC, or future high-energy physics detector projects. The sensor features an active array of $2\times4$ diodes, analog and digital front-ends (FEs), a slow control interface, and bias circuitry programmable through internal DACs. The sensing element is a deep n-well/p-substrate diode. Thanks to the optimized guard-rings surrounding the whole chip, it is possible to apply safely more than −450 V on the high-resistivity substrate allowing fast charge collection. The baseline pixel dimensions are $1.0\times1.0$ mm and $0.5\times1.0$ mm. The analog FEs and the discriminators for each pixel are implemented outside the pixel, at the column level. The power consumption is approximately 300 mW/cm2, which is compatible with cooling infrastructure available at LHC experiments, and making integration of this concept viable in future high-energy physics experiments. After fabrication, the sensors have been thinned to 100, 200, and $300~\mu \text{m}$ total thickness and then postprocessed for backside biasing. The time resolution of several sensors with different thicknesses has been measured in three testbeam campaigns using high-energy muons minimum ionizing particles (MIPs) at CERN SPS in 2021 and 2022. A resolution of 65.3 ps has been measured with ON-chip FE and discriminator. This article will focus on the results of these testbeam campaigns.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2023
• Auteurs : Jean-Philippe DeguineJean-Noël AubertotStéphane BellonFrançois-Xavier CôtePierre-Éric LauriFrançoise LescourretAlain RatnadassEric ScopelNadine AndrieuPaolo BàrberiNathalie BeckerJérémy BouyerThierry BrévaultClaire CerdanAnne-Marie CorteseroOlivier DanglesHélène DelattePhuong Thi Yen DinhHans DreyerMichel DuruRica Joy FlorAntoine GardarinOlivier HussonMaxime JacquotAurelie JavelleEric JustesMai Thi Xuan LamMarie LaunayVang Van LeSandrine LongisJosé MartinNicolas Munier-JolainNga Thi Thu NguyenTruc Thi Ngoc NguyenServane PenvernAnne-Sophie PoisotMarie-Hélène RobinBernard RollandAdrien RuschEric SabourinHervé SanguinJean-Pierre SarthouMathilde SesterSimon SylvaineJean-Michel SourisseauChristian SteinbergMarc TchamitchianAlexis ThoumazeauAnaïs TibiFlorent TivetPhilippe TixierXuan Thi TrinhAude VialatteKris A. G. WyckhuysJay Ram LamichhaneSandrine Petit
• Organismes : Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical Département Systèmes Biologiques AGroécologie, Innovations, teRritoires Ecodéveloppement Direction du département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux Direction Générale Déléguée à la Recherche et à la Stratégie Agrosystèmes Biodiversifiés Plantes et systèmes de culture horticoles Agroécologie et intensification durables des cultures annuelles Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux Agroécologie et intensification durables des cultures annuelles Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Alimentation Département Environnements et Sociétés Scuola Universitaria Superiore Sant'Anna = Sant'Anna School of Advanced Studies [Pisa] Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité Animal, Santé, Territoires, Risques et Ecosystèmes Département Systèmes Biologiques Agroécologie et intensification durables des cultures annuelles Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Alimentation Département Environnements et Sociétés Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical Département Systèmes Biologiques Tan Tao University Office Fédéral de l'Agriculture - Federal Office for Agriculture - Bundesamtes für Landwirtschaft [Berne] AGroécologie, Innovations, teRritoires International Rice Research Institute [Philippines] Agronomie Agroécologie et intensification durables des cultures annuelles Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux Groupe de Recherche en Agriculture Biologique Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Alimentation Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux Can Tho University [Vietnam] Agroclim Can Tho University [Vietnam] AGroécologie, Innovations, teRritoires Agroécologie et intensification durables des cultures annuelles Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux Agroécologie [Dijon] Can Tho University [Vietnam] Southern Horticultural Research Institute Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Alimentation FAO Plant Production and Protection Division AGroécologie, Innovations, teRritoires Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes Santé et agroécologie du vignoble Acteurs, Ressources et Territoires dans le Développement Département Environnements et Sociétés Ecodéveloppement Plant Health Institute of Montpellier Département Systèmes Biologiques AGroécologie, Innovations, teRritoires École nationale supérieure agronomique de Toulouse Centre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement Agroécologie et intensification durables des cultures annuelles Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux Unité Expérimentale de Recherches Intégrées en Production Fruitière Acteurs, Ressources et Territoires dans le Développement Département Environnements et Sociétés Agroécologie [Dijon] Ecodéveloppement Département sciences pour l'action, les transitions, les territoires Agrosystèmes Biodiversifiés Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux Direction de l'Expertise scientifique collective, de la Prospective et des Etudes Agroécologie et intensification durables des cultures annuelles Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux General Directorate of Agriculture - Cambodia JEAI HealthyRice Fonctionnement écologique et gestion durable des agrosystèmes bananiers et ananas Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux Can Tho University [Vietnam] Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers Chrysalis Consulting AGroécologie, Innovations, teRritoires Agroécologie [Dijon]
• Publié dans Advances in Agronomy le 25/10/2020

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Résumé : Crop losses from pests threaten global food security and safety. In the last six decades, pest control using chemical pesticides has resulted in important yield gains per unit area, worldwide. However, the long-term sustainability of chemical pest control has been increasingly thrown into doubt due to the negative impact on human health, biodiversity, and the environment. Consequently, there is an urgent need to improve the science of crop protection in order to tackle the five key challenges of 21st century agriculture holistically: (i) maintaining or improving agricultural productivity, (ii) producing healthy food, (iii) reducing the negative impacts of agriculture on ecosystem and human health, (iv) ensuring the economic viability of farms, and (v) adapting agriculture to climate change. Agroecological Crop Protection (ACP) can be a powerful approach to address these challenges, as we demonstrate in this paper. ACP is the application of the principles of agroecology to crop protection in order to promote virtuous and sustainable changes in agriculture and food systems. ACP combines multiple approaches and disciplines including ecology, agroecology, and Integrated Pest Management. It promotes a crop protection system compatible with healthy agricultural and food systems, agroecological principles and the “one health” approach. We predict that ACP will meet the challenge of pesticide-free agriculture in the future. In this paper, we will first present the scientific, agricultural and social components of ACP. We will then analyze the research approaches, questions, methods and tools needed to adopt ACP. Finally, we suggest key mechanisms to facilitate the transition to ACP, which will ultimately provide sustainable food, feed, and fuel in a context of major global change.

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 01/01/2023
• Auteurs : Jérémy MayenPierre PolsenaereAurore Regaudie de GiouxJonathan DebordeMarie ArnaudPierre KostyrkaVincent OuisseJean-Christophe LemesleVincent LelongMarie VagnerPhilippe Souchu
• Organismes : Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais Unité Dynamiques des Écosystèmes Côtiers Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais University of Birmingham [Birmingham] MARine Biodiversity Exploitation and Conservation Réserve Naturelle Nationale Lilleau des Niges Réserve Naturelle Nationale de Moëze-Oléron Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) Laboratoire Environnement Ressources Morbihan Pays de Loire

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Résumé : Au sein de la zone côtière, les marais captent et séquestrent du carbone atmosphérique associés à un métabolisme autotrophe intense du compartiment terrestre. Ces systèmes côtiers exportent également de grandes quantités de carbone inorganique vers les systèmes aquatiques adjacents rendant les eaux côtières sources de CO2 pour l’atmosphère. Les marais sont donc le siège de nombreux processus et flux biogéochimiques aux différentes interfaces d'échange terrestre - aquatique - atmosphérique et aux différentes échelles temporelles (saisonnière, diurne, tidale). Différentes typologies (tidale ou retro-littorale) et modes de gestion (naturel ou anthropique) existent au sein de ces systèmes côtiers où la dynamique du carbone et les facteurs de contrôle mis en jeu sont complexes et spécifiques à chaque système. L’objectif était d’étudier le rôle du métabolisme planctonique sur la dynamique du carbone, et sur les flux de CO2 atmosphérique associés au sein de deux marais des Pertuis Charentais gérés naturellement mais contrastés (saumâtre et salé) . Nous avons donc mesuré simultanément les échanges de CO2 à l’interface eau-atmosphère, les pressions partielles de CO2 de l'eau ainsi que les autres formes du carbone (organique et inorganique) associées au métabolisme planctonique (production/respiration) sur des cycles saisonniers de 24 heures en 2021. Les résultats de cette étude apporteront des informations essentielles sur le rôle joué par les communautés planctoniques dans le cycle du carbone. Elles permettront notamment d’identifier le rôle de puits ou de source de CO2 joué par les marais aux différentes échelles temporelles

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Fichiers liés : 15. Mayen et al_ANR PAMPAS.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/01/2023
• Auteurs : Boris GuyotFlora ClémentYouenn DrouetXenia SchmidtSylvain LefortEmmanuel DelayIsabelle TreilleuxJean-Philippe FoySandrine JeanpierreEmilie ThomasJanice KielbassaLaurie TononHelen He ZhuPierre SaintignyWei-Qiang GaoArnaud de la FouchardièreFranck TirodeAlain ViariJean-Yves BlayVeronique Maguer-Satta
• Organismes : Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre Léon Bérard [Lyon] Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre Léon Bérard [Lyon] Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre Léon Bérard [Lyon] Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Synergie Lyon Cancer-Platform of Bioinformatics-Gilles Thomas Synergie Lyon Cancer-Platform of Bioinformatics-Gilles Thomas Synergie Lyon Cancer-Platform of Bioinformatics-Gilles Thomas Shanghai Jiao Tong University [Shanghai] Université Claude Bernard Lyon 1 Centre Léon Bérard [Lyon] Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Shanghai Jiao Tong University [Shanghai] Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre Léon Bérard [Lyon] Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Synergie Lyon Cancer-Platform of Bioinformatics-Gilles Thomas Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon Centre Léon Bérard [Lyon] Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
• Publié dans Cancer Research Communications le 17/05/2023

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Résumé : An accurate estimate of patient survival at diagnosis is critical to plan efficient therapeutic options. A simple and multiapplication tool is needed to move forward the precision medicine era. Taking advantage of the broad and high CD10 expression in stem and cancers cells, we evaluated the molecular identity of aggressive cancer cells. We used epithelial primary cells and developed a breast cancer stem cell–based progressive model. The superiority of the early-transformed isolated molecular index was evaluated by large-scale analysis in solid cancers. BMP2-driven cell transformation increases CD10 expression which preserves stemness properties. Our model identified a unique set of 159 genes enriched in G2–M cell-cycle phases and spindle assembly complex. Using samples predisposed to transformation, we confirmed the value of an early neoplasia index associated to CD10 (ENI10) to discriminate premalignant status of a human tissue. Using a stratified Cox model, a large-scale analysis (>10,000 samples, The Cancer Genome Atlas Pan-Cancer) validated a strong risk gradient (HRs reaching HR = 5.15; 95% confidence interval: 4.00–6.64) for high ENI10 levels. Through different databases, Cox regression model analyses highlighted an association between ENI10 and poor progression-free intervals for more than 50% of cancer subtypes tested, and the potential of ENI10 to predict drug efficacy. The ENI10 index constitutes a robust tool to detect pretransformed tissues and identify high-risk patients at diagnosis. Owing to its biological link with refractory cancer stem cells, the ENI10 index constitutes a unique way of identifying effective treatments to improve clinical care. Significance: We identified a molecular signature called ENI10 which, owing to its biological link with stem cell properties, predicts patient outcome and drugs efficiency in breast and several other cancers. ENI10 should allow early and optimized clinical management of a broad number of cancers, regardless of the stage of tumor progression.

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Fichiers liés : crc-23-0196.pdf

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