Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/03/2022
• Auteurs : Alexandre DuvignaudEdouard LhommeRacha OnaisiRémi SittaAmbre GelleyJulie ChastangLionel PirothChristine BinquetJulie DupouyAlain MakinsonBenjamin LefèvreJean-Marc NaccacheCaroline RoussillonRoland LandmanCédrick WalletSophie KarcherValérie JournotDuc NguyenThierry PistoneStéphane BouchetMarie-Edith LafonMathieu MolimardRodolphe ThiébautXavier de LamballerieJean-Philippe JosephLaura RichertOlivier Saint-LarySarah DjabaroutiLinda WittkopXavier AnglaretDenis Malvy
• Organismes : Bordeaux population health Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Statistics In System biology and Translational Medicine Bordeaux population health CIC Bordeaux Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Université de Bordeaux Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux CIC Bordeaux CIC Bordeaux Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique Sorbonne Université - Département de médecine générale Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques Equipe EQUITY (CERPOP) Université Toulouse III - Paul Sabatier CIC Montpellier Département Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Montpellier] Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes Adaptation, mesure et évaluation en santé. Approches interdisciplinaires Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy] Groupe Hospitalier Paris Saint-Joseph Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution Institut de médecine et d'épidémiologie appliquée [AP-HP Hôpital Bichat-Claude Bernard] AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris] CIC Bordeaux Bordeaux population health Bordeaux population health Bordeaux population health Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Bordeaux population health Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Statistics In System biology and Translational Medicine Bordeaux population health Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux CIC Bordeaux Unité des Virus Emergents Université de Bordeaux Statistics In System biology and Translational Medicine Bordeaux population health Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux CIC Bordeaux Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations UFR Sciences de la santé Simone Veil Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Biologie des maladies cardiovasculaires = Biology of Cardiovascular Diseases Statistics In System biology and Translational Medicine Bordeaux population health Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux CIC Bordeaux Bordeaux population health Bordeaux population health Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
• Publié dans Clinical Microbiology and Infection le 30/10/2020

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Résumé : Objectives: To assess the efficacy of inhaled ciclesonide in reducing the risk of adverse outcomes in COVID-19 outpatients at risk of developing severe illness.Methods: COVERAGE is an open-label, randomized controlled trial. Outpatients with documented COVID-19, risk factors for aggravation, symptoms for ≤7 days, and absence of criteria for hospitalization are randomly allocated to either a control arm or one of several experimental arms, including inhaled ciclesonide. The primary efficacy endpoint is COVID-19 worsening (hospitalization, oxygen therapy at home, or death) by Day 14. Other endpoints are adverse events, maximal follow-up score on the WHO Ordinal Scale for Clinical Improvement, sustained alleviation of symptoms, cure, and RT-PCR and blood parameter evolution at Day 7. The trial's Safety Monitoring Board reviewed the first interim analysis of the ciclesonide arm and recommended halting it for futility. The results of this analysis are reported here.Results: The analysis involved 217 participants (control 107, ciclesonide 110), including 111 women and 106 men. Their median age was 63 years (interquartile range 59-68), and 157 of 217 (72.4%) had at least one comorbidity. The median time since first symptom was 4 days (interquartile range 3-5). During the 28-day follow-up, 2 participants died (control 2/107 [1.9%], ciclesonide 0), 4 received oxygen therapy at home and were not hospitalized (control 2/107 [1.9%], ciclesonide 2/110 [1.8%]), and 24 were hospitalized (control 10/107 [9.3%], ciclesonide 14/110 [12.7%]). In intent-to-treat analysis of observed data, 26 participants reached the composite primary endpoint by Day 14, including 12 of 106 (11.3%, 95% CI: 6.0%-18.9%) in the control arm and 14 of 106 (13.2%; 95% CI: 7.4-21.2%) in the ciclesonide arm. Secondary outcomes were similar for both arms.Discussion: Our findings are consistent with the European Medicines Agency's COVID-19 task force statement that there is currently insufficient evidence that inhaled corticosteroids are beneficial for patients with COVID-19.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/03/2022
• Auteurs : Théo KorchiaMélanie FaugereNicolas SucAlexandra GarosiChristelle Andrieu-HallerMartin BreytonOphélia GodinBruno AouizerateChristophe ArbusDjamila BennabiFrank BellivierThierry BougerolVincent CamusPhilippe CourtetOlivier DoumyWissam El-HageJean-Baptiste GentyEmmanuel HaffenJérome HoltzmannMathilde HornMarion LeboyerPierre-Michel LlorcaJulia MaruaniRémi MoirandFanny MoliereJean PetrucciRomain ReyLudovic SamalinFlorian StephanGuillaume VaivaMichel WalterAntoine YrondiLaurent BoyerChristophe LançonRaphaelle RichieriGuillaume Fond
• Organismes : Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie Aix-Marseille Université - École de médecine Aix-Marseille Université - École de médecine Fondation FondaMental [Créteil] Fondation FondaMental [Créteil] Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse Toulouse NeuroImaging Center Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] Neurobiologie et Psychiatrie Fondation FondaMental [Créteil] Imaging, Brain & Neuropsychiatry Neuropsychiatrie : recherche épidémiologique et clinique Fondation FondaMental [Créteil] Imaging, Brain & Neuropsychiatry Fondation FondaMental [Créteil] Fondation FondaMental [Créteil] Fondation FondaMental [Créteil] Laboratoire Sciences Cognitives et Sciences Affectives - UMR 9193 Lille Neurosciences & Cognition - U 1172 Lille Neurosciences & Cognition - U 1172
• Publié dans Progress in Neuro-Psychopharmacology and Biological Psychiatry le 25/10/2020

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Résumé : Tobacco smoking has been associated with suicide, impulsivity and depression in non-clinical populations with differences across sexes.

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Fichiers liés : S0278584621002384.pdf

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• Type de publi. : Rapport
• Date de publi. : 01/03/2022
• Auteurs : Christophe ParisSéverine KirchnerGille AymozArmelle BaezaClaude BeaubestreOlivier BlanchardNathalie BonvallotPatrick BrochardDenis CharpinJean-Dominique DewitteEmilie FreallePhilippe GlorennecEddy LangloisDanièle LuceChristelle MonteilAnne OppligerLoïc PaillatMathilde PascalEmmanuel RiviereSandrine RousselRémy SlamaMichel GuerbetDominique LafonMarc BarilSylvain BilletMichèle BissonAnne ChevalierFrançois ClinardFatiha El-GhissassiMounia El-YamaniClaude EmondGuillaume GarconLudovic Le HegaratKarim MaghniVéronique MalardFabrice MichielsJean-Paul PayanHenri SchroederAlain SimonnardOlivier SorgLydie SparfelJérôme ThireauRaymond VincentStéphane BinetPerrine HoetYuriko IwatsuboCécile KairoLaila LakhalFrédéric LirussiAnne MaitreFlorence PilliereAnne PlatelClaude ViauRachel NadifDenis BemerValérie BexDenis CaillaudMarc DurifGhislaine GoupilMarianne GuillemotBénédicte JacqueminOlivier JoubertCorinne MandinFabien MercierPierre PernotChantal RaherisonLuc BelzuncesCéline BotineauKevin HogeveenLuc MultignerNadia Nikolova-PavageauBenoît OuryMaeva WendremaireHervé Laborde-CastérotSophie AchardFabrice AlliotMichel AndréFleur DelvaFrançois Gaie-LevrelMarion HulinJuliette LarbreBarbara Le BotJohanna LepeuleNhan Pham ThiJean-Marc ThibaudierMorgane BachelotThomas CartierAmélie CrepetClémence FourneauJulien JeanMarion KeirsbulckFrançois Pouzaud
• Organismes : Interactions Gènes-Risques environnementaux et Effets sur la Santé Centre Hospitalier Universitaire de Nancy Centre Scientifique et Technique du Bâtiment Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Énergie Unité de Biologie Fonctionnelle et Adaptative Laboratoire d'Hygiène de la Ville de Paris Institut de recherche en santé, environnement et travail École des Hautes Études en Santé Publique Département des sciences en santé environnementale Institut de recherche en santé, environnement et travail École des Hautes Études en Santé Publique Département des sciences en santé environnementale Bordeaux population health Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Aix Marseille Université Optimisation des régulations physiologiques Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] Institut de recherche en santé, environnement et travail École des Hautes Études en Santé Publique Département Méthodes quantitatives en santé publique Institut national de recherche et de sécurité (Vandoeuvre lès Nancy) Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Aliments Bioprocédés Toxicologie Environnements Université de Lausanne = University of Lausanne Laboratoire Central de la Préfecture de Police Institut de Veille Sanitaire Agence de surveillance de la qualité de l’air Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) UFR de Médecine-Pharmacie de Rouen Université de Montréal Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques Institut de Veille Sanitaire Centre international de Recherche sur le Cancer Institut de Veille Sanitaire Université de Montréal Impact de l'environnement chimique sur la santé humaine - ULR 4483 Laboratoire de Fougères - ANSES Université de Montréal Interactions Protéine Métal Association des Centres Interentreprises pour la Santé au Travail Institut national de recherche et de sécurité (Paris) Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux Institut national de recherche et de sécurité (Paris) Université de Genève = University of Geneva Institut de recherche en santé, environnement et travail Physiologie & médecine expérimentale du Cœur et des Muscles [U 1046] Institut national de recherche et de sécurité (Paris) Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France] Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France] ToxAlim Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand Environnement et Prévention en Santé des Populations Institut national de recherche et de sécurité (Paris) Institut Pasteur de Lille Université de Montréal Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations Institut national de recherche et de sécurité (Vandoeuvre lès Nancy) Département des sciences en santé environnementale Service Pneumologie / Allergologie [CHU Clermont-Ferrand] Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques Laboratoire Central de la Préfecture de Police Département Métrologie des Polluants Institut de recherche en santé, environnement et travail Institut Jean Lamour Centre Scientifique et Technique du Bâtiment Institut de recherche en santé, environnement et travail École des Hautes Études en Santé Publique Laboratoire d'étude et de recherche en environnement et santé AIRPARIF - Surveillance de la qualité de l'air en Île-de-France Bordeaux population health Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives Laboratoire de Fougères - ANSES Institut de recherche en santé, environnement et travail Institut national de recherche et de sécurité (Paris) Institut national de recherche et de sécurité (Paris) Université de Bourgogne Centre antipoison et de toxicovigilance (Paris) Université Paris Descartes - Paris 5 Milieux Environnementaux, Transferts et Interactions dans les hydrosystèmes et les Sols Département Composants et Systèmes Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Laboratoire National de Métrologie et d’Essais Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France] Service parisien de santé environnementale [Paris] Institut de recherche en santé, environnement et travail École des Hautes Études en Santé Publique Laboratoire d'étude et de recherche en environnement et santé Épidémiologie environnementale appliquée au développement et à la santé respiratoire/Environmental Epidemiology applied to Development and Respiratory Health Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques

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Résumé : La question de l’exposition de l’Homme à des mélanges ainsi que le risque potentiel sur la santé associé se pose depuis de nombreuses années. Des documents et recommandations institutionnels sont notamment publiés depuis les années 2000 pour la prise en compte des mélanges principalement dans le cadre d’évaluation des risques sur la santé humaine (US EPA, 2000 ; 2002 ; 2006a ; ILSI, 1999 ; ATSDR, 2001 ; 2004 ; Health Council of the Netherlands, 2002 ; IGHRC, 2008 ; EFSA, 2008 ; 2009 ; 2013a,b ; 2019a ; IPCS/WHO, 2009 ; Kortenkamp et al., 2009 ; SCHER, 2011). Dans le domaine des substances chimiques, le nombre de composés enregistrés par le Chemical Abstract Service (CAS) était de 34 millions en 2008 (Stewart & Carter, 2009). En 2018, plus de 17 000 substances individuelles étaient d’ores et déjà enregistrées dans le cadre de la réglementation européenne REACH (règlement n°1907/2006). Le nombre exact de substances chimiques sur le marché de l’Union européenne n’est pas connu mais l’agence européenne des substances chimiques (ECHA) l’estimait en 2017 à près de 140 000 substances (https://echa.europa.eu/fr/ ). Les substances chimiques sont utilisées dans de nombreux secteurs économiques : production alimentaire, fabrication de médicaments, industrie textile, industrie automobile, etc. Les contaminations environnementales (air, eau, sols, etc.) peuvent résulter notamment : - des procédés de fabrication et/ou de conditionnement et d’emballage; - de l’utilisation de produits de consommation contenant des substances chimiques dans la vie quotidienne ; - des émissions issues non intentionnellement de la combustion ; - de la persistance dans l’environnement de substances qui peuvent être interdites à présent dans la réglementation, etc. La gestion des risques liés aux substances chimiques est encadrée d’une part par le règlement REACh, et d’autre part par des réglementations par milieux (eaux, air, etc.) et sectorielles (médicaments, cosmétiques, biocides, etc.) d’où découlent des analyses de risques séparées (Evans et al., 2016). Concernant les mélanges de substances chimiques, il existe des référentiels de gestion des risques dans certaines de ces réglementations, notamment dans le domaine de l’alimentation où une approche progressive par étape est proposée pour l’évaluation du risque cumulé. La question des mélanges, si elle reste complexe, peut aujourd’hui être traitée dans les démarches d’expertise compte tenu de l’existence de savoir-faire et le développement de modèles simplifiés faisant consensus. En évaluation des risques sanitaires et environnementaux, quelques exemples de dispositions réglementaires ont émergé, notamment pour l’exposition via l’alimentation (résidus de pesticides et eaux destinées à la consommation humaine) et l’étude de l’impact d’installations industrielles sur l’environnement et le voisinage. Des recommandations d’organismes institutionnels (US EPA, ATSDR, EFSA, SCHER) formalisent des approches méthodologiques considérant les connaissances sur l’interaction des contaminants et soulignent l’importance de leur mise en application. L’hypothèse la plus recommandée repose sur le concept d’additivité des doses ou des réponses. De nombreuses études ont testé le modèle d’additivité des doses (ou concentrations) pour différents mélanges de contaminants ayant des propriétés toxicologiques semblables sur un organe ou système cible et ont montré que globalement, ce modèle prédit raisonnablement la toxicité des mélanges aux faibles doses/concentrations. Les modèles intégrant les notions d’antagonisme et de synergie sont nécessaires pour mieux comprendre et prendre en compte les bases mécanistiques des interactions, ainsi que les expositions à des doses/concentrations relativement élevées. Cependant, il est à noter qu’aux faibles doses, les interactions restent peu susceptibles de générer un risque très différent de celui évalué avec l’hypothèse d’additivité au regard des incertitudes inhérentes à la démarche même d’évaluation des risques. L’évaluation des risques sanitaires vise à guider les décisions publiques en situation d’incertitudes. Certains dispositifs réglementaires recommandent certaines méthodes référencées dans des guides méthodologiques qui ne sont pas toutes adaptées à l’évaluation de mélanges. Il apparaît impossible de documenter, dans un cadre réglementaire, les dangers et les interactions entre les substances pour des expositions réelles, tant il existe de combinaisons de substances possibles auxquelles la population peut être exposée. L’étude de mélanges peut correspondre à des combinaisons de contaminants différents : substances chimiques, facteurs physiques (bruit, température), et/ou agents biologiques (bactéries, moisissures, allergènes, toxines...). Le périmètre du présent travail est limité aux seules substances chimiques.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/03/2022
• Auteurs : Benjamin PlanquetteLaurent BertolettiAnais Charles‐nelsonSilvy LaporteClaire GrangeIsabelle MahéGilles PernodAntoine EliasFrancis CouturaudNicolas FalvoMarie-Antoinette Pietri-SevestreValérie RayAlexis BurnodNicolas BrebionPierre-Marie RoyMiruna Timar-DavidSandro AquilantiJoel ConstansAlessandra Bura-RivièreDominique BrisotGilles ChatellierOlivier SanchezGuy MeyerPhilippe GirardPatrick MismettiHervé DecoususAurélien DellucChristine LaneauAurelia DinutPhilippe AegerterJoseph EmmerichHervé DecoususEmmanuel MessasMarie-Pierre RevelSandrine AcassatLudovic PlaisanceGéraldine PoenouBernard ImbertNora ZenatiEmmanuelle Le MoigneRaphael Le MaoClément HoffmannMarie EliasRomaric LoffroyMaud JandotSanthi Samy Modéliar RémondThomas MoumnehSamir HenniMiruna Timor-DavidCarine Boulon
• Organismes : Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) Innovations thérapeutiques en hémostase = Innovative Therapies in Haemostasis F-Crin INvestigation Network On Venous Thrombo-Embolism [CHU Saint-Etienne] Centre d'Investigation Clinique - Epidémiologie Clinique [CHU Saint-Etienne] Santé Ingénierie Biologie Saint-Etienne Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] Santé Ingénierie Biologie Saint-Etienne F-Crin INvestigation Network On Venous Thrombo-Embolism [CHU Saint-Etienne] Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] Université Paris Cité Innovations thérapeutiques en hémostase = Innovative Therapies in Haemostasis F-Crin INvestigation Network On Venous Thrombo-Embolism [CHU Saint-Etienne] F-Crin INvestigation Network On Venous Thrombo-Embolism [CHU Saint-Etienne] Centre Hospitalier Universitaire [CHU Grenoble] Université Grenoble Alpes Centre Hospitalier Intercommunal Toulon-La Seyne sur Mer - Hôpital Sainte-Musse Département de Médecine Interne et Pneumologie [Brest] Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale Service de médecine interne et immunologie clinique (SOC 1) [CHU de Dijon] CHirurgie, IMagerie et REgénération tissulaire de l’extrémité céphalique - Caractérisation morphologique et fonctionnelle - UR UPJV 7516 Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes Institut Curie [Paris] Université d'Angers Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Service de Médecine Vasculaire [CHU Toulouse] CRP Clinique du Parc, Castelnau-Le-Lez CIC - HEGP Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) F-Crin INvestigation Network On Venous Thrombo-Embolism [CHU Saint-Etienne] Innovations thérapeutiques en hémostase = Innovative Therapies in Haemostasis Santé Ingénierie Biologie Saint-Etienne Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] Equipe IFTIM [ImViA - EA7535]
• Publié dans Chest le 29/10/2020

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Résumé : Background: Direct oral anticoagulants (DOACs) are an alternative to low-molecular-weight heparin for treating cancer-associated VTE. Research question: Is rivaroxaban as efficient and safe as dalteparin to treat patients with cancer-associated VTE? Study design and methods: In a randomized open-label noninferiority trial, patients with active cancer who had proximal DVT, pulmonary embolism (PE), or both were assigned randomly to therapeutic doses of rivaroxaban or dalteparin for 3 months. The primary outcome was the cumulative incidence of recurrent VTE, a composite of symptomatic or incidental DVT or PE, and worsening of pulmonary vascular or venous obstruction at 3 months. Results: Of 158 randomized patients, 74 and 84 patients were assigned to receive rivaroxaban and dalteparin, respectively. Mean age was 69.4 years, and 115 patients (76.2%) had metastatic disease. The primary outcome occurred in 4 and 6 patients in the rivaroxaban and dalteparin groups, respectively (both the intention-to-treat and per-protocol populations: cumulative incidence, 6.4% vs 10.1%; subdistribution hazard ratio [SHR], 0.75; 95% CI, 0.21-2.66). Major bleeding occurred in 1 and 3 patients in the rivaroxaban and dalteparin groups, respectively (cumulative incidence, 1.4% vs 3.7%; SHR, 0.36; 95% CI, 0.04-3.43). Major or clinically relevant nonmajor bleeding occurred in 9 and 8 patients in the rivaroxaban and dalteparin groups, respectively (cumulative incidence, 12.2% vs 9.8%; SHR, 1.27; 95% CI, 0.49-3.26). Overall, 19 patients (25.7%) and 20 patients (23.8%) died in the rivaroxaban and dalteparin groups, respectively (hazard ratio, 1.05; 95% CI, 0.56-1.97). Interpretation: In this trial comparing rivaroxaban and dalteparin in the treatment of cancer-associated VTE, the number of patients was insufficient to reach the predefined criteria for noninferiority, but efficacy and safety results were consistent with those previously reported with DOACs. An updated meta-analysis of randomized trials comparing DOACs with low-molecular-weight heparin in patients with cancer-associated VTE is provided.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/03/2022
• Auteurs : Joseph AckermannPhilippe J.R. CohenKévin AlessandriAndrea LeonardPierre NassoyJ.-F. JoannyMartine Ben Amar
• Organismes : Biophysique et Neuroscience Théoriques Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences Treefrog Therapeutics Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences Collège de France - Chaire Matière molle et biophysique Biophysique et Neuroscience Théoriques
• Publié dans Journal of the Mechanics and Physics of Solids le 30/10/2020

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Résumé : Human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) are a promising cellular source in cell therapies or regenerative medicine and they allow to address fundamental mechanisms in embryo-genesis. However, their culture to provide large amounts of high quality stem cells remains challenging. Here, using an encapsulation microfluidic device, we observe that hiPSCs self-organize into cysts, which are spherical closed epithelia reminiscent of the early stages of in vitro embryo models. We monitor their morphology, organization and growth in a pseudo-stratified epithelium before and after they get confined by the capsule wall. Then, we present a morpho-elastic model to quantitatively explain the growth dynamics. The model based on Neo-Hookean elasticity with anisotropic growth shows that the stresses, concentrated within the cyst, remain at a low level. Cyst growth is shown to be quasi-exponential, slightly reduced by a compression-induced correction. We hypothesize that this peculiar morphological dynamics, which is controlled by elasticity and anisotropic growth, might provide new strategies to optimize the production of medical grade hiPSCs.

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Fichiers liés : 74504_0_art_file_562734_qs9htn_convrt.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/03/2022
• Auteurs : Floriane ProvostDavid MichéaJean-Philippe MaletEnguerran BoissierElisabeth PointalAndré StumpfFabrizio PaciniMarie-Pierre DoinPascal LacroixCatherine ProyPhilippe Bally
• Organismes : Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre Agence Spatiale Européenne = European Space Agency Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre Institut Terre Environnement Strasbourg Terradue Srl Institut de Physique du Globe de Paris GAF AG [Munich] Terradue Srl Institut des Sciences de la Terre Institut des Sciences de la Terre Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] Agence Spatiale Européenne = European Space Agency
• Publié dans Remote Sensing of Environment le 28/10/2020

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Fichiers liés : S0034425722000633.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/03/2022
• Auteurs : Nicolas GalloisBéatrice Alpha-BazinNicolas BremondPhilippe Ortet​mohamed BarakatLaurie PietteAbbas Mohamad AliDavid LemairePierre LegrandNicolas TheodorakopoulosMagali FlorianiLaureline FevrierChristophe Den AuwerPascal ArnouxC. BerthomieuJean ArmengaudVirginie Chapon
• Organismes : Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Interactions Protéine Métal Service de Pharmacologie et Immunoanalyse Médicaments et Technologies pour la Santé Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Interactions Protéine Métal Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Laboratoire d'Ecologie Microbienne de la Rhizosphère et d'Environnements Extrêmes Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Interactions Protéine Métal Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Interactions Protéine Métal Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Interactions Protéine Métal Synchrotron SOLEIL Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Laboratoire de recherche sur les transferts des radionucléides dans les écosystèmes terrestres Interactions Protéine Métal Laboratoire d'écotoxicologie des radionucléides Laboratoire de recherche sur les transferts des radionucléides dans les écosystèmes terrestres Institut de Chimie de Nice Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Microbiologie Environnementale et Moléculaire Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Interactions Protéine Métal Service de Pharmacologie et Immunoanalyse Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic Médicaments et Technologies pour la Santé Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) Interactions Protéine Métal
• Publié dans The International Society of Microbiologial Ecology Journal le 29/10/2020

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Résumé : Uranium is a naturally occurring radionuclide. Its redistribution, primarily due to human activities, can have adverse effects on human and non-human biota, which poses environmental concerns. The molecular mechanisms of uranium tolerance and the cellular response induced by uranium exposure in bacteria are not yet fully understood. Here, we carried out a comparative analysis of four actinobacterial strains isolated from metal and radionuclide-rich soils that display contrasted uranium tolerance phenotypes. Comparative proteogenomics showed that uranyl exposure affects 39–47% of the total proteins, with an impact on phosphate and iron metabolisms and membrane proteins. This approach highlighted a protein of unknown function, named UipA, that is specific to the uranium-tolerant strains and that had the highest positive fold-change upon uranium exposure. UipA is a single-pass transmembrane protein and its large C-terminal soluble domain displayed a specific, nanomolar binding affinity for UO$_2^{2+}$ and Fe$^{3+}$. ATR-FTIR and XAS-spectroscopy showed that mono and bidentate carboxylate groups of the protein coordinated both metals. The crystal structure of UipA, solved in its apo state and bound to uranium, revealed a tandem of PepSY domains in a swapped dimer, with a negatively charged face where uranium is bound through a set of conserved residues. This work reveals the importance of UipA and its PepSY domains in metal binding and radionuclide tolerance.

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Fichiers liés : Gallois et al..pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 23/02/2022
• Auteurs : El Hadji Tombé BodianDiene ThiareJean Pierre BakhoumOlivier Maurice Aly MbayeNdeye Arame DiopPape Abdoulaye DiawBernard Le JeuneAtanasse ColyPhilippe Giamarchi
• Organismes : Laboratoire d'Optique et de Magnétisme Université Cheikh Anta Diop de Dakar [Sénégal] Université Cheikh Anta Diop de Dakar [Sénégal] Laboratoire d'Optique et de Magnétisme Université Cheikh Anta Diop de Dakar [Sénégal] Université Cheikh Anta Diop de Dakar [Sénégal] Université Cheikh Anta Diop de Dakar [Sénégal] Université Cheikh Anta Diop de Dakar [Sénégal] Laboratoire d'Optique et de Magnétisme Université Cheikh Anta Diop de Dakar [Sénégal] Laboratoire d'Optique et de Magnétisme
• Publié dans Analytical Letters le 26/10/2020

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Résumé : Flumethrin and tau-fluvalinate pyrethroid insecticides were determined in natural water using photochemically induced fluorescence (PIF). As these pesticides are not naturally fluorescent, PIF using ultraviolet irradiation was employed to produce highly fluorescent derivatives. This method was optimized for irradiation interval, solvent and pH. The calibration curves were linear with limits of detection (LOD) from 0.5 to 73.8 ng mL−1 without matrix effects. Applications were carried out in aqueous solutions on tap water, seawater, well water and river water from Niayes, Senegal and the Brest, France using solid phase extraction and standard addition procedures. The samples were analyzed with mean recoveries between 99.0 and 109.0%. The analytical performances of these systems were favorable compared with published photoinduced fluorescence methods for the determination of pyrethroids. The results show that the developed PIF method is suitable for the determination of trace organic pollutants in natural waters.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 23/02/2022
• Auteurs : Étienne IorioFrançois DusoulierFabien SoldatiFranck NoëlJean-Alain GuillotonGuillaume DoucetPhilippe PonelPascal DupontRégis Krieg-JacquierStéphane CheminPierre TillierJulien Touroult
• Organismes : ECOTER (Écologie & Territoires) Direction générale déléguée aux collections Office National des Forêts Auteur indépendant Auteur indépendant Auteur indépendant Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale Patrimoine naturel Auteur indépendant ECOTER (Écologie & Territoires) Patrimoine naturel Patrimoine naturel
• Publié dans Naturae le 22/10/2020

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Résumé : L'évaluation environnementale est un processus réglementaire visant à évaluer les projets de travaux ou d’aménagements qui peuvent avoir des incidences sur l’environnement. L’étude d’impact comporte un volet « milieux naturels » dans lequel un diagnostic écologique donne un état initial du site, notamment de ses enjeux faunistiques, floristiques et d’habitats, à partir de la bibliographie et de prospections dédiées. Il s’ensuit la proposition de mesures « ERC » (éviter, réduire, compenser) visant une neutralité écologique entre incidences et gains générés. Les Arthropodes constituent de loin le phylum le plus diversifié du règne animal, et devraient logiquement y tenir une place importante. Pourtant, en France, seuls quatre ordres comportent des espèces inscrites dans les textes réglementaires nationaux et européens. Le phylum des Arthropodes y est donc très peu représenté comparativement aux Vertébrés. Cet article questionne la place des Arthropodes dans les études d’impacts, leur utilité pour identifier des enjeux sur leurs habitats, et propose de nouveaux groupes qui pourraient apporter un complément à la fois taxinomique et écologique. L’examen d’un échantillon de 50 études d’impact montre que seuls trois principaux groupes y sont étudiés, tous comportant des espèces protégées : les papillons diurnes (Rhopalocères et Zygaena), les Odonates (Odonata) et les Orthoptères (Orthoptera) ; ainsi que quelques Coléoptères saproxylophages réglementés. Un effet « vase clos » probablement inhérent à la réglementation s’observe, car ces groupes sont ceux sur lesquels les connaissances progressent le plus et qui font l’objet de la plupart des évaluations de type Liste rouge. Ce déséquilibre entre les groupes abordés dans les études d’impact et la diversité réelle des Arthropodes continentaux, de leurs spécialisations et fonctions écologiques, de leurs particularités de répartition, induit que leurs enjeux sont évalués de manière inégale selon les habitats et secteurs géographiques concernés. Ainsi, les papillons diurnes et les Orthoptères mettent principalement en exergue des espèces et des enjeux de conservation pour les milieux prairiaux, puis secondairement les landes, fourrés et garrigues ; les Odonates les milieux dulcicoles. Les Rhopalocères et Odonates comportent également un nombre non négligeable d’espèces à enjeux inféodées aux tourbières et marais. Ces groupes sont globalement de bons indicateurs des enjeux pour ces habitats. Les Coléoptères qui reviennent le plus régulièrement dans les études d’impact mettent surtout en valeur les arbres isolés, le bocage, les alignements d’arbres et les lisières forestières. A contrario, les milieux littoraux et les milieux forestiers fermés ne sont que très peu valorisés par ces groupes. Les papillons diurnes et Odonates sont parmi les Arthropodes avec les plus faibles taux d’endémisme en France métropolitaine, ce qui, de fait, sous-représente cet enjeu de conservation dans les études d’impacts. D’un point de vue fonctionnel, les coprophages, les nécrophages ou encore les prédateurs et décomposeurs litiéricoles sont aussi quasiment oubliés dans les études d’impacts. Cet article propose six groupes pour lesquels les connaissances ont bien progressé depuis 10 ou 20 ans et qui apporteraient un complément écologique et taxinomique aux espèces actuellement utilisées dans les études réglementaires : les Chilopodes (Chilopoda), les Isopodes terrestres (Isopoda, Oniscidea), les Coléoptères « Longicornes » (Cerambycidae et Vesperidae), Scarabaeoidea et Tenebrionidae, les Hétéroptères Pentatomoidea. La plupart des espèces à enjeux de conservation élevés de ces six groupes se situent sur les plages ou les dunes, les forêts ou les milieux tels que les grottes, les falaises ou les éboulis. Les Chilopodes, les Isopodes terrestres et les Coléoptères Tenebrionidae comportent un grand nombre d’endémiques induisant une responsabilité nationale élevée. Les plages et milieux côtiers, de la partie médiolittorale supérieure aux milieux dunaires, constituent l’exemple le plus frappant de sous-représentation au sein des espèces protégées et des groupes actuellement priorisés dans les études d’impact, comportant des dizaines d’espèces spécialisées à enjeux apparaissant menacées et aucun « parapluie » ne permettant de bien les préserver. De façon moindre, il en est de même pour les forêts fermées. Les grottes paraissent d’emblée moins concernées ; cependant, la répartition souvent étroite des Arthropodes endémiques qu’elles abritent leur confère des enjeux à ne pas négliger. Les listes de protection paraissent donc à compléter par d’autres groupes que ceux pris en compte jusqu’ici, mais de manière appropriée aux Arthropodes continentaux : protection priorisant les habitats et non les spécimens, en corrélation avec les particularités de leur étude et de leur biologie. Pour les papillons diurnes, Odonates et Orthoptères, bien qu’un grand nombre d’espèces réglementées demeure pertinent, les listes paraissent à réajuster. La présente étude propose une liste argumentée de 135 espèces à forts enjeux de conservation dans neuf groupes d’Arthropodes. La prise en compte de l’ensemble par les bureaux d’études, les aménageurs et les autorités environnementales permettrait de refléter les enjeux des Arthropodes continentaux dans les études d’impact et donc de prendre des mesures plus adaptées à leur conservation.

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Fichiers liés : Iorio et al ArthropodesEtudesd'Impact 2022.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 22/02/2022
• Auteurs : Laura Le GallWilliam J DuddyCécile MartinatVirginie MariotOwen ConnollyVanessa MillaEkene AnakorZamalou G OuandaogoStephanie MillecampsJeanne LainéUdaya Geetha VijayakumarSusan KnoblachCédric RaoulOlivier LucasJean Philippe LoefflerPeter BedeAnthony BehinHelene BlascoGaelle BruneteauMaria del Mar AmadorDavid DevosAlexandre HenriquesAdele HestersLucette LacomblezPascal LaforetTimothee LangletPascal LeblancNadine Le ForestierThierry MaisonobeVincent MeiningerLaura RobelinFrancois SalachasTanya StojkovicGiorgia QuerinJulie DumonceauxGillian Butler BrowneJose‐luis González de AguilarStephanie DuguezPierre Francois Pradat
• Organismes : Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM Northern Ireland Center for Stratified Medicine Institut de Myologie Northern Ireland Center for Stratified Medicine Institut des cellules souches pour le traitement et l'étude des maladies monogéniques NIHR Biomedical Research Centre [London] University College London [UCL] Great Ormond Street Hospital for Children NHS Foundation Trust [London, UK] Northern Ireland Center for Stratified Medicine Northern Ireland Center for Stratified Medicine Northern Ireland Center for Stratified Medicine Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM Institut de Myologie Institut du Cerveau = Paris Brain Institute Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM Institut de Myologie Northern Ireland Center for Stratified Medicine The George Washington University Institut des Neurosciences de Montpellier Hôpital Saint Eloi [CHU Montpellier] Institut des Neurosciences de Montpellier Hôpital Saint Eloi [CHU Montpellier] Mécanismes Centraux et Périphériques de la Neurodégénérescence Laboratoire d'Imagerie Biomédicale [Paris] CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Trinity College Dublin CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Institut de Myologie Hôpital Bretonneau Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Institut de Myologie CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 - EA 1046 Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] Mécanismes Centraux et Périphériques de la Neurodégénérescence CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Laboratoire d'Imagerie Biomédicale [Paris] CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP] CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Hôpital privé des Peupliers (Paris) Mécanismes Centraux et Périphériques de la Neurodégénérescence CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Institut de Myologie Laboratoire d'Imagerie Biomédicale [Paris] CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] University College London [UCL] Great Ormond Street Institute of Child Health Great Ormond Street Hospital for Children NHS Foundation Trust [London, UK] Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM Institut de Myologie Mécanismes Centraux et Périphériques de la Neurodégénérescence Northern Ireland Center for Stratified Medicine Northern Ireland Center for Stratified Medicine Laboratoire d'Imagerie Biomédicale [Paris] CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
• Publié dans Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle le 28/10/2020

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Résumé : Background: The cause of the motor neuron (MN) death that drives terminal pathology in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) remains unknown, and it is thought that the cellular environment of the MN may play a key role in MN survival. Several lines of evidence implicate vesicles in ALS, including that extracellular vesicles may carry toxic elements from astrocytes towards MNs, and that pathological proteins have been identified in circulating extracellular vesicles of sporadic ALS patients. Because MN degeneration at the neuromuscular junction is a feature of ALS, and muscle is a vesicle-secretory tissue, we hypothesized that muscle vesicles may be involved in ALS pathology. Methods: Sporadic ALS patients were confirmed to be ALS according to El Escorial criteria and were genotyped to test for classic gene mutations associated with ALS, and physical function was assessed using the ALSFRS-R score. Muscle biopsies of either mildly affected deltoids of ALS patients (n = 27) or deltoids of aged-matched healthy subjects (n = 30) were used for extraction of muscle stem cells, to perform immunohistology, or for electron microscopy. Muscle stem cells were characterized by immunostaining, RT-qPCR, and transcriptomic analysis. Secreted muscle vesicles were characterized by proteomic analysis, Western blot, NanoSight, and electron microscopy. The effects of muscle vesicles isolated from the culture medium of ALS and healthy myotubes were tested on healthy human-derived iPSC MNs and on healthy human myotubes, with untreated cells used as controls. Results: An accumulation of multivesicular bodies was observed in muscle biopsies of sporadic ALS patients by immunostaining and electron microscopy. Study of muscle biopsies and biopsy-derived denervation-naïve differentiated muscle stem cells (myotubes) revealed a consistent disease signature in ALS myotubes, including intracellular accumulation of exosome-like vesicles and disruption of RNA-processing. Compared with vesicles from healthy control myotubes, when administered to healthy MNs the vesicles of ALS myotubes induced shortened, less branched neurites, cell death, and disrupted localization of RNA and RNA-processing proteins. The RNA-processing protein FUS and a majority of its binding partners were present in ALS muscle vesicles, and toxicity was dependent on the expression level of FUS in recipient cells. Toxicity to recipient MNs was abolished by anti-CD63 immuno-blocking of vesicle uptake. Conclusions: ALS muscle vesicles are shown to be toxic to MNs, which establishes the skeletal muscle as a potential source of vesicle-mediated toxicity in ALS.

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Fichiers liés : J Cachexia Sarcopenia Muscle 2022.pdf

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