Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Autre publication
• Date de publi. : 01/02/2022
• Auteurs : Valérie CadotJorick CélarierJulien GarnierHadhami GarbougeMarlène FaureMartin EcarnotPierre RoumetLama Al BassitNicolas MascherMargot ChagnotFréderic SerreSylvie RochePierre DesrayIsabelle SerandatJean-Philippe MaignielStéphane PorrezGrégory CohendyDavid Rousseau
• Organismes : Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement Technologies et systèmes d'information pour les agrosystèmes Université Clermont Auvergne Département mathématiques, informatique, sciences de la donnée et technologies du numérique
• Publié dans PHYTOMA le 26/06/2024

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Résumé : Disposer d’un outil d’évaluation de la résistance fiable, reproductible, permettant du phénotypage à grande échelle est aujourd’hui indispensable pour identifier de potentielles sources de résistance et pour mieux en comprendre les bases génétiques exploitables en sélection.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2022
• Auteurs : Virginie NerichChristophe GuyeuxMichel Henry-AmarRaphaël CouturierCatherine ThieblemontVincent RibragHervé TillyCorinne HaiounRené‐olivier CasasnovasFranck MorschhauserPierre FeugierDavid SibonLoic YsebaertEmmanuelle Nicolas‐virelizierFlorence Broussais‐guillaumotGandhi L DamajJean‐philippe JaisGilles André SallesMacha Woronoff‐lemsiNicolas Mounier
• Organismes : Pôle pharmaceutique [CHRU Besançon] Interactions hôte-greffon-tumeur, ingénierie cellulaire et génique - UFC (UMR INSERM 1098) Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies (UMR 6174) Ligue Nationale Contre le Cancer Radiothérapie [Centre François Baclesse] Centre de Traitement des Données du Cancéropôle Nord-Ouest Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies (UMR 6174) Hopital Saint-Louis [AP-HP] Institut Gustave Roussy Département d'hématologie [Gustave Roussy] Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen Hôpital Henri Mondor CHU Dijon Groupe de Recherche sur les formes Injectables et les Technologies Associées - ULR 7365 Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 Hôpital Henri Mondor Service Hématologie - IUCT-Oncopole [CHU Toulouse] Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse Centre Léon Bérard [Lyon] Université Claude Bernard Lyon 1 Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] CHU Caen Normandie – Centre Hospitalier Universitaire de Caen Normandie Laboratory of Biostatistics, Paris V University-Descartes, Paris Weill Medical College of Cornell University [New York] Interactions hôte-greffon-tumeur, ingénierie cellulaire et génique - UFC (UMR INSERM 1098) Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon Hôpital l'Archet
• Publié dans Cancer le 29/10/2020

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Résumé :

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Fichiers liés : Cancer - 2021 - Nerich - Economic burden in non‐Hodgkin lymphoma survivors The French Lymphoma Study Association SIMONAL.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2022
• Auteurs : Nguyen Thu TrangLuong Anh NgocDao Thi Dieu ThuyNicolas NagotDidier LaureillardLaurent VisierLe Minh GiangMélusine DurandQuynh Bach Thi NhuR. ValloLinh Le Thi ThuyHuong Thi DuongBinh Nguyen ThanhDelphine RapoudCatherine QuilletHong Thi TranLaurent MichelThanh Nham Thi TuyetOanh Khuat Thi HaiVinh Vu HaiJonathan FeelemyerPhilippe Vande PerreDon Des JarlaisPham Minh KhueJean-Pierre MolesDon C Des JarlaisKamyar ArastehDuong Thi HuongKhuat Thi Hai OanhPham Minh KhueHoang Thi GiangNham Thi Tuyet ThanhJean-Pierre MolesVu Hai VinhLaurianne MorinLuc BéhanzinFernand GuédouRené Kpèmahouton KêkêLane BushmanPeter AndersonFlore GangboSouleymane DiabatéMichel AlaryLaurence ChandeboisErika NoguéCatherine BouschbacherSabine DurandFlorence MassonRenaud MesnageGilles CamboniePhilippe van de PerreJean-Pierre MolesEdouard TuaillonPierre‐emmanuel CeccaldiAmeena GogaAndrew PrendergastNigel RollinsChloé ChamardHéléna HuguetAlain BronCatherine Creuzot-GarcherMax VillainIsabelle CarrièreThibault MuraVincent DaienJulien Gomez-MartinezVincent FoulongneBrigitte MontèsJean-François CantaloubeChantal Fournier-WirthJean-Charles BrèsRomy RayssiguierFlorent FuchsEve MoustyEstelle MorauTarik HliouaConstance WellsYuri MusizzanoChristelle GrafCharles LegouxPierre BoulotCoralie DumontFabien HuetQuentin DelbaereSylvain AguilhonValentin DupasquierDelphine DelsenyRichard GervasoniJean-Christophe MaciaFlorence LeclercqNidal JammoulSandra KahloucheSonia SoltaniFanny CardonAnne-Marie DupuyJean-Paul CristolDenis Mariano-GoulartMyriam AkodadFrançois RoubilleAna Montoya-FerrerArmen SanosyanAlexis Fayd’herbe de MaudaveAmandine PisoniKarine BolloreMarianne PeriesThorkild TylleskärJames TumwineGrace NdeeziMiguel GorgolasMandisa Singata-MadlikiAmandine CournilJoyce NalugyaSouleymane TassembedoMelany TongaNicolas MedaChipepo KankasaMwiya MwiyaPaul BangiranaJoanne BattingIngunn EngebretsenAnaïs MennecierPaulin FaoSabrina Eymard-DuvernaySamiratou OuedraogoCatherine Chunda-LiyokaLeticia SakanaDavid RutagweraMaria Melany Wilfred-TongaBeatriz MosqueiraAngela DevineAlice VahanianBernard SawadogoSouleymane ZanFadima Yaya BocoumHelen KellyClare GilhamJason OngRosa LegoodAlec MinersPhilippe MayaudSigismond LasockiPierre AsfarSamir JaberMartine FerrandiereT KerforneKarim AsehnounePhilippe MontraversPhilippe SeguinKatell Peoc’hSoizic GergaudThibaud LefebvreSylvain LehmannFrançois BeloncleAlain MercatThomas GaillardMaxime LegerEmmanuel RineauCyril SargentiniClaire GeneveHervé PuyGrégoire MercierGregory MarinConstance DelabyChristophe HirtzGerald ChanquesAntoine RoquillyMatthieu BoissonClaire Dahyot-FizelierOlivier MimozSonia IsslameYoann LauneyMathilde BarbazSao Mai LeAudrey MonninAmélie VizeneuxJames Kashugyera TumwineAdmire ChikandiwaPamela MichelowOlga Goumbri LompoTanvier OmarPrecious MagooaMichel SegondySinead Delany-MoretlweThuy Thi Thu DongGiang Thi HoangThanh Tuyet Thi NhamJoëlle CastellaniLan Phuong NguyenHoi van LeNhung Viet NguyenLuan Nguyen Quang Vo
• Organismes : Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Université de Montpellier Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale EFS UNIVERSITE ANTILLES-GUYANE Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Université de Montpellier Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale EFS UNIVERSITE ANTILLES-GUYANE INFECTIOUS DISEASES DEPARTMENT CAREMEAU UNIVERSITY HOSPITAL Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Université de Montpellier Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale EFS UNIVERSITE ANTILLES-GUYANE Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Université de Montpellier Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale EFS UNIVERSITE ANTILLES-GUYANE Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Université de Montpellier Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale EFS UNIVERSITE ANTILLES-GUYANE Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Université de Montpellier Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale EFS UNIVERSITE ANTILLES-GUYANE Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Université de Montpellier Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale EFS UNIVERSITE ANTILLES-GUYANE Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Université de Montpellier Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale EFS UNIVERSITE ANTILLES-GUYANE
• Publié dans Open Forum Infectious Diseases le 22/10/2020

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Résumé : Abstract Background The tuberculosis (TB) epidemic is not homogeneous in the general population but presents high-risk groups. People who inject drugs (PWID) are such a group. However, TB among PWID remains largely undocumented. Our goal was to assess the prevalence of TB and the risk factors associated with TB among PWID in Vietnam. Methods We implemented a cross-sectional survey among 2 community-based cohorts of human immunodeficiency virus (HIV)-positive and HIV-negative PWID in Hai Phong. Participants were screened for TB using questions on TB symptoms. Those who reported any symptom were accompanied by peers to the TB clinic for chest x-ray. If the latter was abnormal, a sputum was collected to perform an Xpert MTB/RIF test. Results A total of 885 PWID were screened for TB. For both cohorts, most PWID were male (>90.0%), with a median age of 42 years. Beside heroin injection, 52.5% of participants reported smoking methamphetamine, and 63.2% were on methadone. Among HIV-positive PWID (N = 451), 90.4% were on antiretroviral therapy and 81.6% had a viral load <1000 copies/mL. Using a complete-case analysis, the estimated TB prevalence was 2.3% (95% confidence interval [CI], 1.0–4.5) and 2.1% (95% CI, 0.8–4.2) among HIV-positive and HIV-negative people, respectively. Living as a couple, arrest over the past 6 months, homelessness, and smoking methamphetamine were independently associated with TB but not HIV infection. Conclusions In the context of very large antiretroviral therapy coverage, this extremely high rate of TB among PWID requires urgent actions.

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Fichiers liés : ofab548.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2022
• Auteurs : Philippe ColsonJeremy DelerceEmilie BurelMamadou BeyePierre-Edouard FournierAnthony LevasseurJean-Christophe LagierDidier Raoult
• Organismes : Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection
• Publié dans Virus Genes le 26/10/2020

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2022
• Auteurs : Agnès CousinV. SautterCécile FabreGilles DromartGilles MontagnacChristophe DrouetPierre-Yves MeslinOlivier GasnaultOlivier BeyssacSylvain BernardEdward CloutisOlivier ForniPierre BeckThierry FouchetJeffrey JohnsonJérémie LasueA. M. OllilaPhilippe de ParsevalSophie GouyBenoît CaronJuan Manuel MadariagaG. AranaMorten Bo MadsenJ. LasernaJ. MorosJ.A. ManriqueGuillermo López-ReyesF. RullS. MauriceRoger C. Wiens
• Organismes : Institut de recherche en astrophysique et planétologie Research On Carbon-rich Key Samples [IMPMC] GeoRessources Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement Centre interuniversitaire de recherche et d'ingénierie des matériaux Institut de recherche en astrophysique et planétologie Institut de recherche en astrophysique et planétologie Research On Carbon-rich Key Samples [IMPMC] Research On Carbon-rich Key Samples [IMPMC] Department of Geography [Winnipeg] Institut de recherche en astrophysique et planétologie Institut de Planétologie et d'Astrophysique de Grenoble Laboratoire d'études spatiales et d'instrumentation en astrophysique = Laboratory of Space Studies and Instrumentation in Astrophysics Johns Hopkins University Applied Physics Laboratory [Laurel, MD] Institut de recherche en astrophysique et planétologie Los Alamos National Laboratory Géosciences Environnement Toulouse Géosciences Environnement Toulouse Institut des Sciences de la Terre de Paris Universidad del País Vasco [Espainia] / Euskal Herriko Unibertsitatea [España] = University of the Basque Country [Spain] = Université du pays basque [Espagne] Universidad del País Vasco [Espainia] / Euskal Herriko Unibertsitatea [España] = University of the Basque Country [Spain] = Université du pays basque [Espagne] Niels Bohr Institute [Copenhagen] Universidad de Málaga [Málaga] = University of Málaga [Málaga] Universidad de Málaga [Málaga] = University of Málaga [Málaga] Centro de Astrobiologia [Madrid] Universidad de Valladolid [Valladolid] Centro de Astrobiologia [Madrid] Universidad de Valladolid [Valladolid] Centro de Astrobiologia [Madrid] Universidad de Valladolid [Valladolid] Institut de recherche en astrophysique et planétologie Los Alamos National Laboratory
• Publié dans Spectrochimica Acta Part B: Atomic Spectroscopy le 31/10/2020

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Résumé : The Perseverance rover is exploring Jezero crater on Mars since February 2021. SuperCam instrument is part of the scientific payload, combining five different techniques in order to characterize the targets to sample: LIBS (Laser-Induced Breakdown Spectroscopy), Raman and Visible and Infrared (VISIR) spectroscopies, Sound Recording and a colored Imager. Thirty-six calibration targets have been developed for this instrument. Twenty-three of these calibration targets are dedicated to the LIBS technique, corresponding to rocks and/or minerals. Raman and VISIR spectroscopy have their own calibration targets but may also use the LIBS mineral targets as reference on Mars to test mineral detections. The choice and the fabrication of these calibration targets have been made in order to fulfill the science intents of the mission, as well as the technical and science intents of each of the SuperCam technique. These calibration targets have been spectrally characterized and they have shown to be chemically homogeneous at the SuperCam LIBS scale. Their elementary compositions are given, using two different quantitative methods. The composition of the calibration targets will be used as reference for future assessment of the quantitative capability of the SuperCam LIBS technique.

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Fichiers liés : SAPB-D-21-00222_submitted.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2022
• Auteurs : Philippe ColsonJacques FantiniNouara YahiJeremy DelerceAnthony LevasseurPierre-Edouard FournierJean-Christophe LagierDidier RaoultBernard La Scola
• Organismes : Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille Unité de Neurobiologie des canaux Ioniques et de la Synapse Unité de Neurobiologie des canaux Ioniques et de la Synapse Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille
• Publié dans Archives of Virology le 27/10/2020

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Résumé : We detected SARS-CoV-2 of PANGO lineage R.1 with the spike substitution E484K in three patients. Eleven other sequences in France and 8,831 worldwide were available from GISAID, 92% originating from Japan. The three genome sequences from our institute were phylogenetically closest to another from Guinea-Conakry, where one of the patients had travelled. These viruses did not exhibit any unusual features in cell culture. Spike structural predictions indicated a 1.3-time higher transmissibility index than for the globally spread B.1.1.7 variant but also an affinity loss for gangliosides that might have slowed dissemination. The spread of new SARS-CoV-2 mutants/variants is still not well understood and therefore difficult to predict, and this hinders implementation of effective preventive measures, including adapted vaccines.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2022
• Auteurs : Florian PhilippeNelly DubrulleBenjamin MarteauxBrice BonnetPatrick ChoisyJean‐yves BerthonLaurence GarnierNadine LeconteSandrine MilesiPierre‐yves MorvanAlex SaunoisJian‐sheng SunSandrine WeberNicole Giraud
• Organismes : DNA Gensee [Le Bourget du Lac] DNA Gensee [Le Bourget du Lac] DNA Gensee [Le Bourget du Lac] L'Oréal Recherche France LVMH Recherche GREENTECH L'Oréal Recherche France Nuxe [Boulogne Billancourt] Laboratoires Clarins Codif [Saint-Malo] Sederma [Le Perray-en-Yvelines] Structure et Instabilité des Génomes Laboratoires Clarins DNA Gensee [Le Bourget du Lac]
• Publié dans International Journal of Cosmetic Science le 30/10/2020

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Résumé : Objective: This study was initiated and conducted by several laboratories, 3 of the main cosmetic ingredient suppliers and 4 brands of cosmetics in France. Its objective is to show the interest and robustness of coupling chemical and genetic analyses in the identification of plant species. In this study, the Lavandula genus was used. Methods: In this study, we used two analytical methods. Chemical analysis from UHPLC (ultra-high-performance liquid chromatography) and genetic analysis from barcoding with genetic markers. Results: Eleven lavender species were selected (botanically authenticated) and analysed. The results show that three chemical compounds (coumaric acid hexoside, ferulic acid hexoside and rosmarinic acid) and three genetic markers (RbcL, trnH-psbA and ITS) are of interest for the differentiation of species of the genus lavandula. Conclusion: The results show that the combination of complementary analytical methods is a relevant system to prove the botanical identification of lavender species. This first study, carried out on a plant of interest for cosmetics, demonstrates the need for authentication using a tool combining genetic and chemical analysis as an advance over traditional investigation methods used alone, in terms of identification and authentication reliability.

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Fichiers liés : Intern J of Cosmetic Sci - 2021 - Philippe - Combining DNA Barcoding and Chemical fingerprints to authenticate Lavender raw.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2022
• Auteurs : Jean-Pierre AlcarazLaurence Le CoqJérémie PourchezDominique ThomasSandrine ChazeletIsabelle BoudryMaud BarbadoSophie SilventClaire DessaleFabienne AntoineCatherine Guimier-PingaultLaurent CortellaSophie RouifNathalie Bardin-MonnierAugustin CharvetOlivier DufaudLara LeclercYoann MontigaudCoralie LaurentPaul O VerhoevenAurélie JoubertAla BouhanguelYves AndresJoël GafféDonald K MartinChristophe HuetSandrine BoissetMax MaurinPascal RumeauFrédéric CharlotEmmanuel RichaudAlexandre Moreau-GaudryVincent BonneterrePhilippe CinquinCaroline Landelle
• Organismes : Systèmes Nanobiotechnologiques et Biomimétiques IMT Atlantique Valorisation Energie-matière des Résidus et Traitement des Emissions École des Mines de Saint-Étienne Santé Ingénierie Biologie Saint-Etienne Laboratoire Réactions et Génie des Procédés Institut national de recherche et de sécurité (Vandoeuvre lès Nancy) Centre d'Investigation Clinique - Innovation Technologique - INSERM - CHU de Grenoble Centre d'Investigation Clinique - Innovation Technologique - INSERM - CHU de Grenoble Centre Hospitalier Universitaire [CHU Grenoble] Centre d'Investigation Clinique - Innovation Technologique - INSERM - CHU de Grenoble Centre d'Investigation Clinique - Innovation Technologique [Nancy] Centre d'Investigation Clinique - Innovation Technologique [Nancy] Centre Hospitalier Universitaire [CHU Grenoble] ARC-Nucleart CEA Grenoble Ionisos SAS Laboratoire Réactions et Génie des Procédés Laboratoire Réactions et Génie des Procédés Laboratoire Réactions et Génie des Procédés Santé Ingénierie Biologie Saint-Etienne Santé Ingénierie Biologie Saint-Etienne Santé Ingénierie Biologie Saint-Etienne Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis [CIRI] Traitement Eau Air Métrologie Département Systèmes Energétiques et Environnement
• Publié dans Chemosphere le 29/10/2020

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Fichiers liés : 2022-Alcaraz ReUse Mask- CHEM.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2022
• Auteurs : Marc HilmiElisabeth AshtonMatthieu DelayePhilippe GiraudCindy NeuzilletJean-Philippe SpanoJoseph GligorovLuc OllivierAdrien RousseauNatacha NaounAlice Boilève
• Organismes : UFR Sciences de la santé Simone Veil Institut Curie [Paris] Epidémiologie, Systèmes d'Information, Modélisation
• Publié dans Bulletin du Cancer le 01/11/2020

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Résumé : Introduction > L'Association d'enseignement et de recherche des internes en oncologie (AERIO) a mené une enquête nationale auprès des internes en « phase socle » de la promotion 2020 du diplôme d'études spécialisées d'oncologie. L'objectif était de recueillir et décrire leurs motivations, ainsi que les objectifs et les obstacles de vie et de carrière de ces internes, lors de cette première année de leur cursus. Méthodes > Un questionnaire comprenait 45 questions fermées réparties en six sections permettant de décrire : les caractéristiques démographiques de la population interrogée, l'engagement et les attentes cliniques et liées à la recherche des étudiants, leur formation, leurs objectifs de vie et de carrière, ainsi que leur engagement associatif. Résultats > Soixante-dix-huit internes sur 119 ont participé (66 %), dont 68 (87 %) ayant complété le questionnaire dans son intégralité. La population était constituée en majorité de femmes (60 %) avec un âge médian de 24 ans. Le choix entre oncologie option médicale ou option radiothérapie était le plus souvent indéterminé (87 %), 15 % des internes ont songé au droit au remord. Le temps de travail hospitalier moyen déclaré était majoritairement situé entre 45 et 65 heures par semaine (83 %). Soixante-neuf pour cent souhaitaient s'investir dans la recherche clinique. Environ un interne sur deux (52 %) n'avait pas accès à la demi-journée de formation en autonomie. Conclusion > Cette étude nationale a permis de décrire la perception des internes en phase socle d'oncologie vis à vis de leur formation, ainsi que leurs aspirations de carrière et leur rapport à la recherche.

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Fichiers liés : [Goals, motivations, and difficulties of young oncology residents]..pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/02/2022
• Auteurs : John B WhitfieldTae-Hwi Schwantes-AnRebecca DarlayGuruprasad P AithalStephen R AtkinsonRamon BatallerGreg BotwinNaga P ChalasaniHeather J CordellAnn K DalyChristopher P DayFlorian EyerTatiana ForoudDermot GleesonDavid GoldmanPaul S HaberJean-Marc JacquetTiebing LiangSuthat LiangpunsakulSteven MassonPhilippe MathurinRomain MoirandAndrew McquillinChristophe MorenoMarsha y MorganSebastian MuellerBeat MüllhauptLaura E NagyPierre NahonBertrand NalpasSylvie NaveauPascal PerneyMunir PirmohamedHelmut K SeitzMichael SoykaFelix StickelAndrew ThompsonMark R ThurszEric TrépoTimothy R MorganDevanshi Seth
• Organismes : QIMR Berghofer Medical Research Institute Indiana University School of Medicine Newcastle University [Newcastle] University of Nottingham, UK Imperial College London University of Pittsburgh Medical Center [Pittsburgh, PA, États-Unis] California State University [Long Beach] Indiana University - Purdue University Indianapolis Newcastle University [Newcastle] Newcastle University [Newcastle] Newcastle University [Newcastle] Technische Universität Munchen = Technical University Munich = Université Technique de Munich Indiana University School of Medicine National Institute on Alcohol Abuse and Alcoholism The University of Sydney Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] Indiana University - Purdue University Indianapolis Indiana University System Newcastle University [Newcastle] Hôpital Claude Huriez [Lille] Institute for Translational Research in Inflammation - U 1286 Nutrition, Métabolismes et Cancer University College London [UCL] Université libre de Bruxelles = Free University of Brussels University College London [UCL] University of Heidelberg, Medical Faculty University hospital of Zurich [Zurich] Lerner Research Institute [Cleveland, OH, USA] Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart] Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] University of Liverpool University of Heidelberg, Medical Faculty University-Hospital Munich-Großhadern [München] University hospital of Zurich [Zurich] University of Liverpool Imperial College London Université libre de Bruxelles = Free University of Brussels University of California The University of Sydney
• Publié dans Journal of Hepatology le 23/10/2020

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Résumé : Background & aims - Only a minority of excess alcohol drinkers develop cirrhosis. We developed and evaluated risk stratification scores to identify those at highest risk. Methods - Three cohorts (GenomALC-1: n = 1,690, GenomALC-2: n = 3,037, UK Biobank: relevant n = 6,898) with a history of heavy alcohol consumption (≥80 g/day (men), ≥50 g/day (women), for ≥10 years) were included. Cases were participants with alcohol-related cirrhosis. Controls had a history of similar alcohol consumption but no evidence of liver disease. Risk scores were computed from up to 8 genetic loci identified previously as associated with alcohol-related cirrhosis and 3 clinical risk factors. Score performance for the stratification of alcohol-related cirrhosis risk was assessed and compared across the alcohol-related liver disease spectrum, including hepatocellular carcinoma (HCC). Results - A combination of 3 single nucleotide polymorphisms (SNPs) (PNPLA3:rs738409, SUGP1-TM6SF2:rs10401969, HSD17B13:rs6834314) and diabetes status best discriminated cirrhosis risk. The odds ratios (ORs) and (95% CIs) between the lowest (Q1) and highest (Q2) score quintiles of the 3-SNP score, based on independent allelic effect size estimates, were 5.99 (4.18-8.60) (GenomALC-1), 2.81 (2.03-3.89) (GenomALC-2), and 3.10 (2.32-4.14) (UK Biobank). Patients with diabetes and high risk scores had ORs of 14.7 (7.69-28.1) (GenomALC-1) and 17.1 (11.3-25.7) (UK Biobank) compared to those without diabetes and with low risk scores. Patients with cirrhosis and HCC had significantly higher mean risk scores than patients with cirrhosis alone (0.76 ± 0.06 vs. 0.61 ± 0.02, p = 0.007). Score performance was not significantly enhanced by information on additional genetic risk variants, body mass index or coffee consumption. Conclusions - A risk score based on 3 genetic risk variants and diabetes status enables the stratification of heavy drinkers based on their risk of cirrhosis, allowing for the provision of earlier preventative interventions. Lay summary - Excessive chronic drinking leads to cirrhosis in some people, but so far there is no way to identify those at high risk of developing this debilitating disease. We developed a genetic risk score that can identify patients at high risk. The risk of cirrhosis is increased >10-fold with just two risk factors - diabetes and a high genetic risk score. Risk assessment using this test could enable the early and personalised management of this disease in high-risk patients.

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Fichiers liés : Whitfield et al-2021-A genetic risk score and diabetes predict development of alcohol-related.pdf

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