Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 17/02/2022
• Auteurs : Violeta Gámez RosasJacob IsbellWalter JaffeR. G. PetrovJames LeftleyKarl-Heinz HofmannFlorentin MillourLeonard BurtscherKlaus MeisenheimerAnthony MeillandLaurens WatersBruno LopezStéphane LagardeGerd WeigeltPhilippe BérioFatmé AlloucheSylvie Robbe-DuboisPierre CruzalèbesFelix BettonvilThomas HenningJean-Charles AugereauPierre AntonelliUdo BeckmannRoy van BoekelPhilippe BendjoyaWilliam DanchiCarsten DominikJulien DrevonJack GallimoreUwe GraserMatthias HeiningerVincent HocdéMichiel HogerheijdeJosef HronCaterina ImpellizzeriLucia KlarmannElena KokoulinaLucas LabadieMichael LehmitzAlexis MatterClaudia PaladiniÉric PantinJörg-Uwe PottDieter SchertlAnthony SoulainPh. SteeKonrad TristramJózsef VargaJulien WoillezSebastian WolfGideon YoffeGérard Zins
• Organismes : Leiden Observatory [Leiden] Max-Planck-Institut für Astronomie Leiden Observatory [Leiden] Joseph Louis LAGRANGE Joseph Louis LAGRANGE Max-Planck-Institut für Radioastronomie Joseph Louis LAGRANGE Leiden Observatory [Leiden] Max-Planck-Institut für Astronomie Joseph Louis LAGRANGE Department of Astrophysics [Nijmegen] SRON Netherlands Institute for Space Research Joseph Louis LAGRANGE Joseph Louis LAGRANGE Max-Planck-Institut für Radioastronomie Joseph Louis LAGRANGE Joseph Louis LAGRANGE Joseph Louis LAGRANGE Joseph Louis LAGRANGE NOVA Optical Infrared Instrumentation Group Max-Planck-Institut für Astronomie Institut de Planétologie et d'Astrophysique de Grenoble Joseph Louis LAGRANGE Max-Planck-Institut für Radioastronomie Max-Planck-Institut für Astronomie Joseph Louis LAGRANGE NASA Goddard Space Flight Center Astronomical Institute Anton Pannekoek Joseph Louis LAGRANGE Department of Physics and Astronomy [Lewisburg] Max-Planck-Institut für Astronomie Max-Planck-Institut für Radioastronomie Joseph Louis LAGRANGE Leiden Observatory [Leiden] Astronomical Institute Anton Pannekoek Department of Astrophysics [Univ. Vienna] Leiden Observatory [Leiden] Max-Planck-Institut für Astronomie Joseph Louis LAGRANGE Physikalisches Institut [Köln] Max-Planck-Institut für Astronomie Joseph Louis LAGRANGE European Southern Observatory [Santiago] Centre d'Études de Saclay Max-Planck-Institut für Astronomie Max-Planck-Institut für Radioastronomie Sydney Institute for Astronomy Joseph Louis LAGRANGE European Southern Observatory [Santiago] Leiden Observatory [Leiden] European Southern Observatory Institut für Theoretische Physik und Astrophysik [Kiel] Max-Planck-Institut für Astronomie European Southern Observatory [Santiago]
• Publié dans Nature le 29/10/2020

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Résumé : In the widely accepted ‘unified model’ solution of the classification puzzle of active galactic nuclei, the orientation of a dusty accretion torus around the central black hole dominates their appearance. In ‘type-1’ systems, the bright nucleus is visible at the centre of a face-on torus. In ‘type-2’ systems the thick, nearly edge-on torus hides the central engine. Later studies suggested evolutionary effects and added dusty clumps and polar winds but left the basic picture intact. However, recent high-resolution images of the archetypal type-2 galaxy NGC 1068, suggested a more radical revision. The images displayed a ring-like emission feature that was proposed to be hot dust surrounding the black hole at the radius where the radiation from the central engine evaporates the dust. That ring is too thin and too far tilted from edge-on to hide the central engine, and ad hoc foreground extinction is needed to explain the type-2 classification. These images quickly generated reinterpretations of the dichotomy between types 1 and 2. Here we present new multi-band mid-infrared images of NGC 1068 that detail the dust temperature distribution and reaffirm the original model. Combined with radio data (J.F.G. and C.M.V.I., manuscript in preparation), our maps locate the central engine that is below the previously reported ring and obscured by a thick, nearly edge-on disk, as predicted by the unified model. We also identify emission from polar flows and absorbing dust that is mineralogically distinct from that towards the Milky Way centre.

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Fichiers liés : 2112.13694.pdf

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 16/02/2022
• Auteurs : Anthony BuissonHarry SokolNassim HammoudiStéphane NanceyXavier TretonMaria NachuryMathurin FumeryXavier HebuterneMichael RodriguesJean-Pierre HugotGilles BoschettiCarmen StefanescuPauline WilsPhilippe SeksikLionel Le BourhisMadeleine BezaultPierre SauvanetBruno PereiraMatthieu AllezNicolas Barnich
• Organismes : Service Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Clermont-Ferrand] CHU Saint-Antoine [AP-HP] Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] Service de Gastroentérologie [Hôpital Beaujon] Hôpital Claude Huriez [Lille] CHU Amiens-Picardie Périnatalité et Risques Toxiques - UMR INERIS_I 1 UPJV Servcie Hépato-gastroentérolgie et Nutrition clinique [CHU Nice] Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte Centre de recherche sur l'Inflammation Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] Service de Gastroentérologie [Hôpital Beaujon] Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] Centre de Recherche Saint-Antoine Hopital Saint-Louis [AP-HP] Remind Study Group Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte Service Biostatistiques, Télématiques, Traitement de l’image [CHU Clermont-Ferrand] Hopital Saint-Louis [AP-HP] Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 14/02/2022
• Auteurs : Dominique GrandjeanCapucine GalletClothilde JulienRiad SarkisQuentin MuzzinVinciane RogerDidier RoisseNicolas DirnClement LevertErwan BretonArnaud GaltatAlexandre ForgetSebastien CharreaudeauFabien GasmiCaroline Jean-BaptisteSebastien PetitjeanKatia HamonJean-Michel DuquesneChantal CoudertJean-Pierre TourtierChristophe BillyJean-Marc WurtzAnthony ChauvinXavier EyerSabrina ZianiLaura PrevelIlaria CherubiniEnfel Khelili-HouasPierre HausfaterPhilippe DevillierLoic Desquilbet
• Organismes : Hôpital Foch [Suresnes]
• Publié dans PLoS ONE le 25/10/2020

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Résumé : There is an increasing need for rapid, reliable, non-invasive, and inexpensive mass testing methods as the global COVID-19 pandemic continues. Detection dogs could be a possible solution to identify individuals infected with SARS-CoV-2. Previous studies have shown that dogs can detect SARS-CoV-2 on sweat samples. This study aims to establish the dogs’ sensitivity (true positive rate) which measures the proportion of people with COVID-19 that are correctly identified, and specificity (true negative rate) which measures the proportion of people without COVID-19 that are correctly identified. Seven search and rescue dogs were tested using a total of 218 axillary sweat samples (62 positive and 156 negative) in olfaction cones following a randomised and double-blind protocol. Sensitivity ranged from 87% to 94%, and specificity ranged from 78% to 92%, with four dogs over 90%. These results were used to calculate the positive predictive value and negative predictive value for each dog for different infection probabilities (how likely it is for an individual to be SARS-CoV-2 positive), ranging from 10–50%. These results were compared with a reference diagnostic tool which has 95% specificity and sensitivity. Negative predictive values for six dogs ranged from ≥98% at 10% infection probability to ≥88% at 50% infection probability compared with the reference tool which ranged from 99% to 95%. Positive predictive values ranged from ≥40% at 10% infection probability to ≥80% at 50% infection probability compared with the reference tool which ranged from 68% to 95%. This study confirms previous results, suggesting that dogs could play an important role in mass-testing situations. Future challenges include optimal training methods and standardisation for large numbers of detection dogs and infrastructure supporting their deployment.

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Fichiers liés : Identifying SARS-COV-2 infected patients through canine olfactive detection on axillary.pdf

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• Type de publi. : Rapport
• Date de publi. : 14/02/2022
• Auteurs : Alicia TorrigliaPierre DegauqueLaura DraettaJean-François DoréIrina Guseva CanuJürg KesselringAnne Pereira de VasconcelosF. PeronnetHakeim TallebGyörgy ThuróczyMarie-Pierre RolsBenjamin VatovezThomas ClaudepierreBrigitte DebuireThierry DoukiJack FalcónEmmanuel FlahautFrançois GaudaireMartine HoursChaker LarabiJoël LelongFrédérique MoatiCatherine MouneyracFabien NdagijimanaAnne-Lise ParadisValérie SimonneauxAlain SoyezEsko ToppilaFrançoise ViénotCatherine YardinValentina AndreevaSerge BoariniAnne BourdieuJean-Marie BurkhardtPhilippe Chaumet-RiffaudDidier DulonGuillaume DutilleuxNicolas FeltinLuc FontanaPierre-Marie GirardFabrice GiraudetPascal GuenelThierry LetertreJean-Luc MorelDina AttiaMarion BoyerOlivier MerckelLucile MigaultRémi Poirier
• Organismes : Centre de Recherche des Cordeliers Institut d’Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie - UMR 8520 Télécommunication, Interférences et Compatibilité Electromagnétique - IEMN Interaction, Technologies, Activités Département Sciences Economiques et Sociales Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Centre Léon Bérard [Lyon] Université de Lausanne = University of Lausanne Office fédéral de l'environnement Laboratoire de neurosciences cognitives et adaptatives Institut de Biologie Paris Seine Laboratoire Génie électrique et électronique de Paris Centre National de Santé Publique Institut de pharmacologie et de biologie structurale Institut scientifique de service public [Liège] Unité de Recherches Animal et Fonctionnalités des Produits Animaux Chimie Interface Biologie pour l’Environnement, la Santé et la Toxicologie Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques Centre interuniversitaire de recherche et d'ingénierie des matériaux Centre Scientifique et Technique du Bâtiment Unité Mixte de Recherche Epidémiologique et de Surveillance Transport Travail Environnement Université de Poitiers = University of Poitiers Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux BIOlogie des populations, Stress, Santé, Environnement G2Elab-Electronique de puissance Neuroscience Paris Seine CeZaMe - Cervelet, navigation et mémoire = Memory, Navigation and Aging Institut de Biologie Paris Seine Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives Caisse d'Assurance Retraite et de la Santé au Travail [Villeneuve d'Ascq] Institut finlandais de santé au travail Centre de Recherche sur la Conservation Hôpital Dupuytren [CHU Limoges] Nutritional Epidemiology Research Team | Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle Université Savoie Mont Blanc Institut national de recherche et de sécurité (Vandoeuvre lès Nancy) Laboratoire de Psychologie et d’Ergonomie Appliquées Université Paris-Saclay Institut de l'Audition [Paris] Institut Pasteur [Paris] NTNU Acoustics Research Center Laboratoire National de Métrologie et d'Essais [Trappes] Université Jean Monnet - Faculté de Médecine Jacques Lisfranc Signalisation, radiobiologie et cancer Université Clermont Auvergne Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations Sondra, CentraleSupélec, Université Paris-Saclay Institut des Maladies Neurodégénératives [Bordeaux] Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques

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Résumé : L’Anses a été saisie le 9 janvier 2019 par les ministères en charge de la santé, de l’environnement et de l’économie pour la réalisation de l’expertise suivante : « Exposition aux champs électromagnétiques liée au déploiement de la technologie de communication « 5G » et effets sanitaires associés ».Le déploiement des infrastructures de communication 5G a pour objectif de favoriser le développement de services innovants, à l’attention à la fois des particuliers et des entreprises utilisatrices, dans des domaines variés comme la santé, les médias, les transports ou encore les industries du futur. En effet, deux tendances importantes poussent les industries des technologies mobiles à développer un réseau de communication de nouvelle génération : l’augmentation très importante de l’offre en services sans-fil, qui nécessite des réseaux plus rapides et de plus grande capacité pour fournir des services riches en contenu, comme les vidéos, et les perspectives de croissance de l’internet des objets (IoT), qui alimentent le besoin d'une connectivité massive d'appareils, mais aussi d'une connectivité très fiable et à très faible latence (délai dans le temps de communication) pour des applications telles que les voitures connectées, les automatisations industrielles ou encore certaines applications dans le domaine de la santé.Ces évolutions nécessitent non seulement l’exploitation des fréquences d’ores et déjà utilisées par les précédentes générations de téléphonie mobile, mais également celle de nouvelles bandes de fréquences. Parmi elles, deux bandes de fréquences ont déjà été identifiées pour les futurs déploiements en France : la bande 3,5 GHz (3,4-3,8 GHz) permettra d’assurer l’objectif de couverture en téléphonie mobile à très haut débit et la bande 26 GHz (24,25-27,5 GHz) couvrira des besoins de communication pour un grand nombre d’objets et de faible latence sur une zone géographique très localisée.Ces évolutions technologiques vont non seulement modifier les modalités d’exposition de la population, mais nécessiteront également d’adapter les méthodologies de mesure et d’estimation de ces expositions Afin d’accompagner le déploiement et le développement de la 5G, le Gouvernement a présenté le 16 juillet 2018 sa feuille de route nationale 5G. Un des quatre chantiers lancés par le Gouvernement vise à « assurer la transparence et le dialogue sur le déploiement et l’exposition du public ».La saisine de l’Anses se décompose en trois points :1. Une description des caractéristiques et de la nature des signaux émis.2. Une évaluation du niveau d’exposition des personnes lié aux communications mobiles de technologie 5G.3. Une revue des connaissances existantes sur les effets sanitaires liés à l’exposition aux champs électromagnétiques dans les bandes 3,5 GHz et 26 GHz.Constatant la convergence de leurs préoccupations, l’Anses et l’ANFR ont souhaité construire un programme scientifique commun afin, d’une part, de décrire les caractéristiques techniques de la technologie 5G, notamment les dispositifs rayonnants spécifiquement développés pour la 5G dans le cadre des déploiements pilotes et, d’autre part, d’évaluer les niveaux d’exposition des populations à partir des mesures effectuées sur les zones pilotes sans utilisateurs, dont les essais étaient exploratoires.La réponse à la saisine est donc fournie sous la forme de rapports de l’Anses et de l’ANFR complémentaires :- plusieurs rapports de l’ANFR : le premier, publié en juillet 2019, est une présentation générale de la 5G abordée sous l’angle de l’exposition des personnes2 ; le deuxième, publié en version intermédiaire en juillet 20193 puis mis à jour en avril 2020, présente les résultats de mesures d’exposition effectuées pendant les expérimentations pilotes 5G. À noter que l’ANFR a par ailleurs publié en septembre 2020 les résultats de ses travaux de simulation de l’exposition dans une zone urbaine très dense, le 14e arrondissement de Paris, dans le cadre de scénarios d’évolution des réseaux 4G et 5G5 ;-deux rapports de l’Anses : un rapport préliminaire publié en janvier 20206 qui a permis d’identifier les études disponibles portant sur les effets sanitaires éventuels liés à l’exposition aux champs électromagnétiques dans les bandes 3,5 GHz et 26 GHz, et le rapport de cette présente expertise, qui vise à fournir une évaluation des éventuels risques pour la santé liés au déploiement de la 5G, en fonction des données disponibles.L’expertise s’inscrit également dans le cadre d’une attente sociétale forte, émergeant d’une controverse publique qui accompagne le déploiement de la 5G en France et à l’étranger, et qui a la double particularité de relancer le débat sur l’exposition humaine aux radiofréquences et de faire intervenir une grande variété d’acteurs porteurs d’une pluralité de points de vue et de questionnements (associations, citoyens, représentants politiques, collectivités locales, mais aussi médecins et scientifiques). Ainsi, il a été prévu au cours des échanges avec les demandeurs de la saisine qu’en parallèle des travaux d’évaluation des risques, l’Anses décrirait et analyserait les interrogations et mobilisations citoyennes et scientifiques qui se développent autour de la 5G, en s’intéressant notamment :- aux craintes et contestations dans l’espace public relatives au déploiement de la 5G ;- aux argumentaires scientifiques sur lesquelles elles s’appuient.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 14/02/2022
• Auteurs : Dominique GrandjeanCapucine GalletClothilde JulienRiad SarkisQuentin MuzzinVinciane RogerDidier RoisseNicolas DirnClement LevertErwan BretonArnaud GaltatAlexandre ForgetSebastien CharreaudeauFabien GasmiCaroline Jean-BaptisteSebastien PetitjeanKatia HamonJean-Michel DuquesneChantal CoudertJean-Pierre TourtierChristophe BillyJean-Marc WurtzAnthony ChauvinXavier EyerSabrina ZianiLaura PrevelIlaria CherubiniEnfel Khelili-HouasPierre HausfaterPhilippe DevillierLoic Desquilbet
• Organismes : École nationale vétérinaire d'Alfort École nationale vétérinaire d'Alfort École nationale vétérinaire d'Alfort Université Saint-Joseph de Beyrouth / Saint Joseph University of Beirut École nationale vétérinaire d'Alfort École nationale vétérinaire d'Alfort École nationale vétérinaire d'Alfort Hôpital d'Instruction des Armées Begin [Saint-Mandé, France] Centre Hospitalier François Quesnay Groupe hospitalier de la région de Mulhouse Sud-Alsace Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP] Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP] Hôpitaux de Saint Maurice Hôpital Foch [Suresnes] CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] Hôpital Foch [Suresnes] École nationale vétérinaire d'Alfort IMRB - "Biologie du système neuromusculaire" [Créteil]
• Publié dans PLoS ONE le 25/10/2020

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Résumé : There is an increasing need for rapid, reliable, non-invasive, and inexpensive mass testing methods as the global COVID-19 pandemic continues. Detection dogs could be a possible solution to identify individuals infected with SARS-CoV-2. Previous studies have shown that dogs can detect SARS-CoV-2 on sweat samples. This study aims to establish the dogs’ sensitivity (true positive rate) which measures the proportion of people with COVID-19 that are correctly identified, and specificity (true negative rate) which measures the proportion of people without COVID-19 that are correctly identified. Seven search and rescue dogs were tested using a total of 218 axillary sweat samples (62 positive and 156 negative) in olfaction cones following a randomised and double-blind protocol. Sensitivity ranged from 87% to 94%, and specificity ranged from 78% to 92%, with four dogs over 90%. These results were used to calculate the positive predictive value and negative predictive value for each dog for different infection probabilities (how likely it is for an individual to be SARS-CoV-2 positive), ranging from 10–50%. These results were compared with a reference diagnostic tool which has 95% specificity and sensitivity. Negative predictive values for six dogs ranged from ≥98% at 10% infection probability to ≥88% at 50% infection probability compared with the reference tool which ranged from 99% to 95%. Positive predictive values ranged from ≥40% at 10% infection probability to ≥80% at 50% infection probability compared with the reference tool which ranged from 68% to 95%. This study confirms previous results, suggesting that dogs could play an important role in mass-testing situations. Future challenges include optimal training methods and standardisation for large numbers of detection dogs and infrastructure supporting their deployment.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 11/02/2022
• Auteurs : Caroline PapeixGiovanni CastelnovoEmmanuelle LerayMarc CoustansPierre LevyJean-Marc VisyGisela KobeltFabienne LamyBashar AllafFrançois HeintzmannIsabelle ChouetteEric RaponiBarbara DurandEmmanuelle GrevatDriss KamarMarc DebouverieChristine Lebrun-FrénayAbdelhakim AbdelmoumniMouhmmad Jamal Al AloucyAbdullatif Al KhedrAmer Al Najjar CarpentierBernard AlonzoTony AltarchaAmevi AnaniviGéraldine AndrodiasGilles AngibaudMarie-Sylvie Artaud-UriotDominique Audry-ChaboudMarie BarrePhilippe BarresRabah BenrabahEric BergerFrançois-Xavier BergouignanPatricia BernadyChristophe BillyChristian BlanchardMickaël BonnanJean-Paul BorsottiCatherine Bossu-van NieuwenhuyseJean-Claude BouffeteauSophie BouillaguetYassine BoukricheJean-Marc BoulesteixBertrand BourreDavid BrassatAlain BredinBruno BrochetHelene Brugeilles BaguelinOusmane CamaraJean-Philippe CamdessanchéWilliam CamuChristophe CarelBertrand CarlanderOlivier CasezMarie-Pierre Chanel-SoulierStéphane ChapuisMirella CimpoesuJonathan CironPierre ClavelouChristine ClercRenato ColamarinoChristophe CouratierSylvie CourtoisAlain CreangeAntoine DanielliThomas de BrouckerJérôme de SèzeGilles DeferJérôme DelormeBéatrice DenisFayçal DerouichePhilippe DevosAnne-Marie DeyrolleMichel DibJoseph DibEric DiotEmmanuelle DourySophie Dufourd-DelalandeCorinne Dupel-PottierPatrick DussauxGilles EdanThibault EdouardJean-Pierre EscaillasDidier FerribyNicolas FouilletGuillaume FromagerTsouria Gaida-RostanePhilippe GaidaGuillaume GalGuillaume GarriguesAnnick Gayou-JoyeuxArnaud GentilPhilippe GerardJulien GereLaurence GignouxPhilippe GirardPierric GiraudMichel GouttardPierre GrasAnne Marie GuennocMichel GugenheimLaurent GuillotonKarim HadjoutPatrick HautecoeurYawo HegbeOlivier HeinzlefPatrice HenryYann HerveJihad HijaziPascale HomeyerBernard HuttinOlivier IlleAlain JagerLaurentiu JomirNabil KardousAgnès KerouantonComlan Paul KpadeChristophe KublerPierre M. LabaugeFrançois LallementNicolas LandraginDavid-Axel LaplaudHenda LaribiGilles LavernhePierre-Éric Le BiezFrançoise Le BrasPatrick Le CozJosette LecheSara Julia LederAlain LegoutMichele LevasseurAlberta Lorenzi-PernotPierre LouchartFabien LouilletLaurent MagySophie MaillardElisabeth MaillartMarcel Maillet-VioudCatherine Mallecourt-EmbergerÉric ManchonAlexandre ManiaLaurent Martinez-AlmoynaMikel MartinezSerge MassengoDominique MauginSouraya MedjbeurGayané MeliksetyanMichael MenassaDalia Meshaka-Dimitri-BoulosGérard MickThibault MoreauAntoine MoulignierIsabelle MourandJean-Philippe MullerPhilippe NeuschwanderArgentino NibbioChantal NifleJean-Bertin NkendjuoGhislain Nokam TalomSophie OryIvania PatryBernard PedespanJean PelletierDelia-Gianina PencuBruno PerroutyStéphane PeyssonIrène Popa-ComanAndré PouliquenChristophe PratAdriana PrundeanFataï RadjiHaja Tiana RakotoharinandrasanaLilia RazlogPhilippe RemyChristophe RobinGilles RodierJérôme RomeroBrigitte RoualdesFrançois RouhartIrene RuggieriFeras Abdul SamadIrina SarafiantStephane SchaefferNicolas SchmidtPhilippe SchuermansNicolas SeillerThierry SoissonAnnie SortaisBruno StankoffSabrina Stefanizzi-DebucLaurent SuchetJean TardyGregory TaurinFlorent ThabuyMarie TheaudinCaroline FromentAyman TourbahPatricia TourniaireSylvie TrefouretMichel VastenePierre VerdurePatrick VermerschFrédérique VialaDorothée Videt-GibouElisabeth VidrySandra VukusicMarc WagnerValery WattierChristophe ZaenkerFrançois ZieglerJean-Médard Zola
• Organismes : Arènes: politique, santé publique, environnement, médias École des Hautes Études en Santé Publique Département Méthodes quantitatives en santé publique Collectif de recherche handicap, autonomie et société inclusive Recherche sur les services et le management en santé
• Publié dans Neurology and Therapy le 11/08/2020

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Résumé : Introduction: It is important to confirm the effectiveness and tolerability of disease-modifying treatments for relapsing-remitting multiple sclerosis (RRMS) in real-world treatment settings. This prospective observational cohort study (VIRGILE) was performed at the request of the French health authorities. The primary objective was to evaluate the effectiveness of fingolimod 0.5 mg in reducing the annualised relapse rate (ARR) in patients with RRMS. Methods: Participating neurologists enrolled all adult patients with RRMS starting fingolimod treatment between 2014 and 2016, who were followed for 3 years. Follow-up consultations took place at the investigator's discretion. The primary outcome measure was the change in ARR at month 24 after fingolimod initiation. Relapses and adverse events were documented at each consultation; disability assessment (EDSS) and magnetic resonance imagery were performed at the investigator's discretion. Results: Of 1055 eligible patients, 633 patients were assessable at month 36; 405 (64.0%) were treated continuously with fingolimod for 3 years. The ARR decreased from 0.92 ± 0.92 at inclusion to 0.31 ± 0.51 at month 24, a significant reduction of 0.58 [95% CI - 0.51 to - 0.65] relapses/year (p < 0.001). Since starting fingolimod, 461 patients (60.9%) remained relapse-free at month 24 and 366 patients (55.5%) at month 36. In multivariate analysis, no previous disease-modifying treatment, number of relapses in the previous year and lower EDSS score at inclusion were associated with a greater on-treatment reduction in ARR. The mean EDSS score remained stable over the course of the study. Sixty-one out of 289 (21.1%) patients presented new radiological signs of disease activity. Treatment-related serious adverse events were lymphopenia (N = 21), bradycardia (N = 19), elevated transaminases (N = 9) and macular oedema (N = 9). Conclusions: The effectiveness and tolerability of fingolimod in everyday clinical practice are consistent with findings of previous phase III studies. Our study highlights the utility of fingolimod for the long-term management of patients with multiple sclerosis.

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Fichiers liés : Papeix2022_Article_Long-TermEffectivenessSafetyAn.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 08/02/2022
• Auteurs : Dominique LauresserguesMélanie OrmanceyBruno GuillotinHélène San ClementeLaurent CambordeCarine DuboéSabine TourneurPierre CharpentierAmélie BarozetAlain JauneauAurélie Le RuPatrice ThuleauVirginie GervaisSerge PlazaJean-Philippe Combier
• Organismes : Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales LRSV-Interactions Microbiennes dans la Rhizosphère et les Racines LRSV-Peptides et petits ARN Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales Micropep Technologies Micropep Technologies Plateforme TRI FR-AIB Plateforme TRI FR-AIB LRSV-Peptides et petits ARN Institut de pharmacologie et de biologie structurale LRSV-Peptides et petits ARN LRSV-Peptides et petits ARN
• Publié dans Cell Reports le 30/10/2020

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Résumé : MicroRNAs (miRNAs) are transcribed as long primary transcripts (pri-miRNAs) by RNA polymerase II. Plant pri-miRNAs encode regulatory peptides called miPEPs, which specifically enhance the transcription of the pri-miRNA from which they originate. However, paradoxically, whereas miPEPs have been identified in different plant species, they are poorly conserved, raising the question of the mechanisms underlying their specificity. To address this point, we identify and re-annotate multiple Arabidopsis thaliana pri-miRNAs in order to identify ORF encoding miPEPs. The study of several identified miPEPs in different species show that non-conserved miPEPs are only active in their plant of origin, whereas conserved ones are active in different species. Finally, we find that miPEP activity relies on the presence of its own miORF, explaining both the lack of selection pressure on miPEP sequence and the ability for non-conserved peptides to play a similar role, i.e., to activate the expression of their corresponding miRNA.

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Fichiers liés : Lauressergues_2022.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 07/02/2022
• Auteurs : Constance RenaultNicolas VeyrencheFranck MennechetAnne-Sophie BedinJean-Pierre RoutyPhilippe Van De PerreJacques ReynesEdouard Tuaillon
• Organismes : Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Laboratoire de Virologie [CHRU Montpellier] Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections McGill University Health Center [Montreal] Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Laboratoire de Virologie [CHRU Montpellier] Laboratoire de Virologie [CHRU Montpellier] Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes Département Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Montpellier] Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections Laboratoire de Virologie [CHRU Montpellier]
• Publié dans Frontiers in Immunology le 25/10/2020

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Résumé : Among CD4+ T-cells, T helper 17 (Th17) cells play a sentinel role in the defense against bacterial/fungal pathogens at mucosal barriers. However, Th17 cells are also highly susceptible to HIV-1 infection and are rapidly depleted from gut mucosal sites, causing an imbalance of the Th17/Treg ratio and impairing cytokines production. Consequently, damage to the gut mucosal barrier leads to an enhanced microbial translocation and systemic inflammation, a hallmark of HIV-1 disease progression. Th17 cells’ expression of mucosal homing receptors (CCR6 and α4β7), as well as HIV receptors and co-receptors (CD4, α4β7, CCR5, and CXCR4), contributes to susceptibility to HIV infection. The up-regulation of numerous intracellular factors facilitating HIV production, alongside the downregulation of factors inhibiting HIV, helps to explain the frequency of HIV DNA within Th17 cells. Th17 cells harbor long-lived viral reservoirs in people living with HIV (PLWH) receiving antiretroviral therapy (ART). Moreover, cell longevity and the proliferation of a fraction of Th17 CD4 T cells allow HIV reservoirs to be maintained in ART patients.

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Fichiers liés : fimmu-13-822576.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 07/02/2022
• Auteurs : Philippe ColsonPierre-Edouard FournierHervé ChaudetJérémy DelerceAudrey Giraud-GatineauLinda HouhamdiClaudia AndrieuLudivine BrechardMarielle BedottoElsa PrudentCéline GazinMamadou BeyeEmilie BurelPierre DudouetHervé Tissot-DupontPhilippe GautretJean-Christophe LagierMatthieu MillionPhilippe BrouquiPhilippe ParolaFlorence FenollarMichel DrancourtBernard La ScolaAnthony LevasseurDidier Raoult
• Organismes : Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection Microbes Evolution Phylogénie et Infections
• Publié dans Frontiers in Microbiology le 31/10/2020

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Résumé : After the end of the first epidemic episode of SARS-CoV-2 infections, as cases began to rise again during the summer of 2020, we at IHU Méditerranée Infection in Marseille, France, intensified the genomic surveillance of SARS-CoV-2, and described the first viral variants. In this study, we compared the incidence curves of SARS-CoV-2-associated deaths in different countries and reported the classification of SARS-CoV-2 variants detected in our institute, as well as the kinetics and sources of the infections. We used mortality collected from a COVID-19 data repository for 221 countries. Viral variants were defined based on ≥5 hallmark mutations along the whole genome shared by ≥30 genomes. SARS-CoV-2 genotype was determined for 24,181 patients using next-generation genome and gene sequencing (in 47 and 11% of cases, respectively) or variant-specific qPCR (in 42% of cases). Sixteen variants were identified by analyzing viral genomes from 9,788 SARS-CoV-2-diagnosed patients. Our data show that since the first SARS-CoV-2 epidemic episode in Marseille, importation through travel from abroad was documented for seven of the new variants. In addition, for the B.1.160 variant of Pangolin classification (a.k.a. Marseille-4), we suspect transmission from farm minks. In conclusion, we observed that the successive epidemic peaks of SARS-CoV-2 infections are not linked to rebounds of viral genotypes that are already present but to newly introduced variants. We thus suggest that border control is the best mean of combating this type of introduction, and that intensive control of mink farms is also necessary to prevent the emergence of new variants generated in this animal reservoir.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 04/02/2022
• Auteurs : Chris WymantDaniela BezemerFrançois BlanquartLuca FerrettiAstrid GallMatthew HallTanya GolubchikMargreet BakkerSwee Hoe OngLele ZhaoDavid BonsallMariateresa de CesareGeorge Macintyre-CockettLucie Abeler-DörnerJan AlbertNorbert BannertJacques FellayMary Kate GrabowskiBarbara Gunsenheimer-BartmeyerHuldrych GünthardPia KiveläRoger KouyosOliver LaeyendeckerLaurence MeyerKholoud PorterMatti RistolaArd van SighemBen BerkhoutPaul KellamMarion CornelissenPeter ReissChristophe FraserV. AubertM. BattegayE. BernasconiJ. BöniD. BraunH. BucherC. Burton-JeangrosA. CalmyM. CavassiniG. DollenmaierM. EggerL. ElziJ. FehrJ. FellayH. FurrerC. FuxM. GorgievskiH. GünthardD. HaerryB. HasseH. HirschM. HoffmannI. HösliC. KahlertL. KaiserO. KeiserT. KlimkaitR. KouyosH. KovariB. LedergerberG. MartinettiB. Martinez de TejadaC. MarzoliniK. MetznerN. MüllerD. NadalD. NiccaG. PantaleoA. RauchS. RegenassC. RudinF. Schöni-AffolterP. SchmidR. SpeckM. StöckleP. TarrA. TrkolaP. VernazzaR. WeberS. YerlyM. van der ValkS. GeerlingsA. GoorhuisJ. HoviusB. LempkesF. NellenT. van der PollJ. PrinsP. ReissM. van VugtW. WiersingaF. WitM. van DuinenJ. van EdenA. HazenbergA. van HesF. PijnappelS. SmalhoutA. WeijsenfeldS. JurriaansN. BackH. ZaaijerB. BerkhoutM. CornelissenC. SchinkelK. WolthersE. PetersM. van AgtmaelR. AutarM. BomersK. SigaloffM. HeitmullerL. LaanC. AngR. van HoudtM. JongesT. KuijpersD. PajkrtH. ScherpbierC. de BoerA. van der PlasM. van den BergeA. StegemanS. BaasL. Hage de LooffA. BuitingA. ReuwerJ. VeenemansB. WintermansM. PronkH. AmmerlaanD. van den BersselaarE. de MunnikB. DeimanA. JanszV. ScharnhorstJ. TjhieM. WegdamA. van EedenJ. NellenW. BrokkingL. ElsenburgH. NobelM. van KasterenM. BerrevoetsA. BrouwerA. AdamsR. van ErveB. de Kruijf-van de WielS. Keelan-PhafB. van de VenB. van der VenA. BuitingJ. MurckT. de Vries-SluijsH. BaxE. van GorpN. de Jong-PeltenburgM. de Mendonç̧a MeloE. van NoodJ. NouwenB. RijndersC. RokxC. SchurinkL. SlobbeA. VerbonN. BassantJ. van BeekM. VriesdeL. van ZonneveldJ. de GrootC. BoucherM. KoopmansJ. van KampenP. FraaijA. van RossumC. VermontL. van der KnaapE. VisserJ. BrangerR. DoumaA. Cents-BosmaC. Duijf-van de VenE. SchippersC. van NieuwkoopJ. van IjperenJ. GeilingsG. van der HutN. van BurgelE. LeytenL. GelinckF. MollemaS. Davids-VeldhuisC. TearnoG. WildenbeestE. HeikensP. GroeneveldJ. BouwhuisA. LammersS. KraanA. van HulzenM. KruiperG. van der BliekP. BorS. DebastG. WagenvoortF. KroonM. de BoerH. JolinkM. LambregtsA. RoukensH. ScheperW. DoramaN. van HoltenE. ClaasE. WesselsJ. den HollanderR. El MoussaouiK. PoganyC. BrouwerJ. SmitD. Struik-KalkmanT. van NiekerkO. PontesilliS. LoweA. Oude LashofD. PosthouwerM. van WolfswinkelR. AckensK. BurgersJ. SchippersB. Weijenberg-MaesI. van LooT. HavenithM. van VonderenL. KampschreurS. FaberR. Steeman-BoumaA. Al MoujahidG. KootstraC. DelsingM. van der Burg-van de PlasL. ScheiberlichW. KortmannG. van TwillertR. RenckensD. Ruiter-PronkF. van Truijen-OudJ. Cohen StuartEr. JansenM. HoogewerfW. RozemeijerW. van der ReijdenJ. SinnigeK. BrinkmanG. van den BerkW. BlokK. LettingaM. de RegtW. SchoutenJ. StalenhoefJ. VeenstraS. VrouenraetsH. BlaauwG. GeerdersM. KleeneM. KokM. KnapenI. van der MechéE. Mulder-SeelemanA. ToonenS. WijnandsE. WttewaalD. KwaR. van CrevelK. van AerdeA. DofferhoffS. HenrietH. ter HofstedeJ. HoogerwerfM. KeuterO. RichelM. AlbersK. Grintjes-HuismanM. de HaanM. MarneefR. Strik-AlbersJ. Rahamat-LangendoenF. StelmaD. BurgerE. GisolfR. HassingM. ClaassenG. ter BeestP. van BentumN. LangebeekR. TiemessenC. SwaninkS. van LelyveldR. SoetekouwL. van der PrijtJ. van der SwaluwN. BermonW. van der ReijdenR. JansenB. HerpersD. VeenendaalD. VerhagenF. LauwM. van BroekhuizenM. van WijkW. BiermanM. BakkerJ. KleinnijenhuisE. KloezeA. MiddelD. PostmaE. SchölvinckY. StienstraA. VerhageM. Wouthuyzen-BakkerA. BoonstraH. de Groot-de JongeP. van der MeulenD. de WeerdH. NiestersC. van Leer-ButerM. KnoesterA. HoepelmanJ. ArendsR. BarthA. BrunsP. EllerbroekT. MudrikovaJ. OosterheertE. SchaddB. van WelzenK. AarsmanB. Griffioen-van SantenI. de KroonM. van BerkelC. van RooijenR. SchuurmanF. Verduyn-LunelA. WensingL. BontS. GeelenY. LoeffenT. WolfsN. NautaE. RooijakkersH. HoltsemaR. VoigtD. van de WeteringA. AlbertoI. van der MeerA. RosinghT. HalabyS. ZaheriA. BoydD. BezemerA. van SighemC. SmitM. HillebregtA. de JongT. WoudstraD. BergsmaR. MeijeringL. van de SandeT. RutkensS. van der VlietL. de GrootM. van den AkkerY. BakkerA. El BerkaouiM. BezemerN. BrétinE. DjoechroM. GrotersE. KruijneK. LeliveltC. LodewijkE. LucasL. MunjishviliF. PalingB. PeeckC. ReeR. RegtopY. RuijsM. SchoorlP. SchnörrA. ScheigrondE. TuijnL. VeenenbergK. VisserE. WitteY. RuijsMaartje van FrankenhuijsenThierry AllegreDjamila MakhloufiJean-Michel LivrozetPierre ChiarelloMathieu GodinotFlorence Brunel-DalmasSylvie GibertChristian TrepoDominique PeyramondPatrick MiailhesJoseph KoffiValérie ThoirainCorinne BrochierThomas BaudrySylvie PailhesAlain LafeuilladeGisèle PhilipGilles HittingerAssi AssiVéronique LambryEric RosenthalAlissa NaqviBrigitte DunaisEric CuaChristian PradierJacques DurantAline JoulieDenis QuinsatSerge TempestaIsabelle RavauxIsabelle Poizot MartinOlivia FaucherNicolas CloarecHélène ChampagneGilles PichancourtPhilippe MorlatThierry PistoneFabrice BonnetPatrick MercieIsabelle FaureMojgan HessamfarDenis MalvyDenis LacosteMarie-Carmen PertusaMarie-Anne VandenhendeNoëlle BernardFrançois PaccalinCédric MartellJulien Roger-SchmelzMarie-Catherine ReceveurPierre DuffauDenis DondiaEmmanuel RibeiroSabrina CaltadoDidier NeauMichel DupontHervé DutroncFrédéric DauchyCharles CazanaveMarc-Olivier VareilGaétane WirthSéverine Le PuilJean-Luc PellegrinIsabelle RaymondJean-François ViallardSeverin Chaigne de LalandeDaniel GaripuyPierre DelobelMartine ObadiaLise CuzinMuriel AlvarezNoemie BiezunskiLydie PortePatrice MassipAlexa DebardFlorence BalsarinMyriam LagarrigueFrançois Prevoteau Du ClaryChristian AquilinaJacques ReynesVincent BaillatCorinne MerleVincent LemoingNadine AtouiAlain MakinsonJean Marc JacquetChristina PsomasChristine TramoniHugues AumaitreMathieu SaadaMarie MedusMartine MaletAurélia EdenSégolène NeuvilleMilagros FerreyraAlbert SottoClaudine BarbuatIsabelle RouanetDidier LeureillardJean-Marc MauboussinCatherine LechicheRégine DonsescoAndré CabieSylvie AbelSandrine Pierre-FrancoisAnne-Sophie BatalaChristophe CerlandCamille RangomNadine TheresineBruno HoenIsabelle LamauryIsabelle FabreKinda SchepersElodie CurlierRachida OuissaCatherine GaudCarole RicaudRoland RodetGuillaume WartelCarmele SautronGeneviève Beck-WirthCatherine MichelCharles BeckJean-Michel HalnaJakub KowalczykMeryem BenomarChristine Drobacheff-ThiebautCatherine ChirouzeJean-François FaucherFrançois ParcelierAdeline FoltzerCécile Haffner-MauvaisMathieu Hustache MathieuAurélie ProustLionel PirothPascal ChavanetMichel DuongMarielle BuissonAnne WaldnerSophie MahySandrine GohierDelphine CroisierThierry MayMikael DelestanMarie AndreMahsa Mohseni ZadehMartin MartinotBéatrice RosolenAnne PachartBenoît MarthaNoëlle JeunetDavid ReyChristine CheneauMaria PartisaniMichèle PriesterClaudine Bernard-HenryMarie-Laure BatardPatricia FischerJean-Luc BergerIsabelle KmiecOlivier RobineauThomas HuleuxFaïza AjanaIsabelle AlcarazChristophe AllienneVéronique BacletAgnès MeybeckMichel ValetteNathalie VigetEmmanuelle AissiRaphael BiekrePauline CornavinDominique MerrienJean-Christophe SeghezziMoise MachadoGeorges DiabFrançois RaffiBénédicte BonnetClotilde AllavenaOlivier GrossiVéronique ReliquetEric BillaudCecile BrunetSabelline BouchezPascale Morineau-Le HoussineFabienne SauserDavid BoutoilleMichel BesnierHervé HueNolwenn HallDelphine 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• Organismes : Big Data Institute Stichting HIV Monitoring, Amsterdam Centre interdisciplinaire de recherche en biologie Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution Big Data Institute European Bioinformatics Institute [Hinxton] Big Data Institute Big Data Institute Amsterdam University Medical Centers The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge] Big Data Institute Big Data Institute Nuffield Department of Clinical Medicine [Oxford] Nuffield Department of Clinical Medicine [Oxford] Big Data Institute Nuffield Department of Clinical Medicine [Oxford] Big Data Institute Karolinska Institutet [Stockholm] Karolinska University Hospital [Stockholm] Robert Koch Institute [Berlin] Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne Swiss Institute of Bioinformatics [Basel] Centre Hospitalier Universitaire Vaudois = Lausanne University Hospital [Lausanne] Université de Lausanne = University of Lausanne Johns Hopkins University [Baltimore] Robert Koch Institute [Berlin] University hospital of Zurich [Zurich] Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich Helsinki University Hospital [Finland] University hospital of Zurich [Zurich] Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations Helsinki University Hospital [Finland] Stichting HIV Monitoring, Amsterdam Amsterdam University Medical Centers Stichting HIV Monitoring, Amsterdam Big Data Institute Nuffield Department of Clinical Medicine [Oxford] Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694
• Publié dans Science le 22/10/2020

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Résumé : We discovered a highly virulent variant of subtype-B HIV-1 in the Netherlands. One hundred nine individuals with this variant had a 0.54 to 0.74 log 10 increase (i.e., a ~3.5-fold to 5.5-fold increase) in viral load compared with, and exhibited CD4 cell decline twice as fast as, 6604 individuals with other subtype-B strains. Without treatment, advanced HIV—CD4 cell counts below 350 cells per cubic millimeter, with long-term clinical consequences—is expected to be reached, on average, 9 months after diagnosis for individuals in their thirties with this variant. Age, sex, suspected mode of transmission, and place of birth for the aforementioned 109 individuals were typical for HIV-positive people in the Netherlands, which suggests that the increased virulence is attributable to the viral strain. Genetic sequence analysis suggests that this variant arose in the 1990s from de novo mutation, not recombination, with increased transmissibility and an unfamiliar molecular mechanism of virulence.

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Fichiers liés : Lineage Effect Paper_V12_WithFigures.pdf

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