Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 24/09/2021
• Auteurs : Florent CornetJean‐paul PillotPhilippe Le BrisJean-Bernard PouvreauNicolas ArnaudAlexandre de Saint GermainCatherine Rameau
• Organismes : Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal Université Paris-Saclay Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal Laboratoire de biologie et pathologie végétales Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal
• Publié dans New Phytologist le 01/11/2020

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Résumé : The timing of leaf emergence at the shoot apical meristem, or plastochron, is highly regulated in plants. Among the genes known to regulate the plastochron in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana), KLUH (KLU), orthologous to the rice (Oryza sativa) PLASTOCHRON1, encodes the cytochrome P450 CYP78A5, and is thought to act through generation of a still unknown mobile signal. As klu mutants display not only a short plastochron but also a branching phenotype reminiscent of strigolactone (SL) mutants, we investigated whether KLU/CYP78A5 is involved in SL biosynthesis. We combined a genetic approach, a parasitic plant seed germination bioassay to test klu root exudates, and analysis of transcript abundances of SL-biosynthesis genes in the Arabidopsis klu mutants. We demonstrate that KLU is not involved in the SL-biosynthesis pathway. Moreover, this work allowed us to uncover a new role for SL during Arabidopsis development in modulating plastochron via a KLU-dependent pathway. Globally our data reveal that KLU is required for plastochron-specific SL responses, a first indication of crosstalk between SL and the KLU-derived signal.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 24/09/2021
• Auteurs : Jean-Marie SaurelEric JacquesChastity AikenAnne LemoineLise RetailleauAude LavayssièreOcéane FoixAnthony DofalAngèle LaurentNicolas MercuryWayne C. CrawfordArnaud LemarchandRomuald DanielPascal PelleauMaxime Bès de BercGrégoire DectotDidier BertilAgathe RoulleCéleste BrouckeAlison ColombainHélène JundSimon BesançonPierre GuyavarchPhilippe KowalskiMickaël RoudautRonan ApprioualJean BattagliaSoumya BodiharPatrice BoissierMarie Paule BouinChristophe BrunetKévin CanjamalePhilippe CatherineNicolas DesfeteCécile DoubreRémi DretzenTom DumouchePhilippe FernaguValérie FerrazziniFabrice R. R. FontaineArnaud GaillotLouis GéliCyprien GriotMarc GrunbergEmre Can GuzelRoser Hoste-ColomerSophie LambotteFrédéric LauretFélix LégerEmmanuel MarosAline PeltierJerôme VergneClaudio SatrianoFrédéric TronelJerome van Der WoerdYves FouquetStephan JorryEmmanuel RinnertIsabelle ThinonNathalie Feuillet
• Organismes : Institut de Physique du Globe de Paris Institut de Physique du Globe de Paris Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Bureau de Recherches Géologiques et Minières Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Institut de Physique du Globe de Paris Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Institut de Physique du Globe de Paris Laboratoire GéoSciences Réunion Institut de Physique du Globe de Paris Bureau de Recherches Géologiques et Minières Institut de Physique du Globe de Paris Institut de Physique du Globe de Paris Institut de Physique du Globe de Paris Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Institut Terre Environnement Strasbourg Bureau de Recherches Géologiques et Minières Bureau de Recherches Géologiques et Minières Bureau de Recherches Géologiques et Minières Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre Bureau de Recherches Géologiques et Minières Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre Institut de Physique du Globe de Paris Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Laboratoire Magmas et Volcans Institut de Physique du Globe de Paris Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Institut de Physique du Globe de Paris Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Institut Terre Environnement Strasbourg Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre Institut de Physique du Globe de Paris Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Institut de Physique du Globe de Paris Laboratoire GéoSciences Réunion Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre Faculty of Electrical and Electronics Engineering [Istanbul] Bureau de Recherches Géologiques et Minières Institut Terre Environnement Strasbourg Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Institut de Physique du Globe de Paris Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Institut de Physique du Globe de Paris Observatoire Volcanologique du Piton de la Fournaise Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre Institut de Physique du Globe de Paris Bureau de Recherches Géologiques et Minières Institut Terre Environnement Strasbourg Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer Bureau de Recherches Géologiques et Minières Institut de Physique du Globe de Paris
• Publié dans Geophysical Journal International le 25/10/2020

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Résumé : Summary The brutal onset of seismicity offshore Mayotte island North of the Mozambique Channel, Indian Ocean, that occurred in May 2018 caught the population, authorities, and scientific community off guard. Around 20 potentially felt earthquakes were recorded in the first 5 days, up to magnitude Mw 5.9. The scientific community had little pre-existing knowledge of the seismic activity in the region due to poor seismic network coverage. During 2018 and 2019, the MAYOBS/REVOSIMA seismology group was progressively built between four French research institutions to improve instrumentation and data sets to monitor what we know now as an on-going exceptional sub-marine basaltic eruption. After the addition of 3 medium-band stations on Mayotte island and 1 on Grande Glorieuse island in early 2019, the data recovered from the Ocean Bottom Seismometers were regularly processed by the group to improve the location of the earthquakes detected daily by the land network. We first built a new local 1D velocity model and established specific data processing procedures. The local 1.66 low VP/VS ratio we estimated is compatible with a volcanic island context. We manually picked about 125,000 P and S phases on land and sea bottom stations to locate more than 5,000 events between February 2019 and May 2020. The earthquakes outline two separate seismic clusters offshore that we named Proximal and Distal. The Proximal cluster, located 10km offshore Mayotte eastern coastlines, is 20 to 50 km deep and has a cylindrical shape. The Distal cluster start 5 km to the east of the Proximal cluster and extends below Mayotte's new volcanic edifice, from 50 km up to 25 km depth. The two clusters appear seismically separated, however our dataset is insufficient to firmly demonstrate this.

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Fichiers liés : ggab392.pdf

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• Type de publi. : Rapport
• Date de publi. : 23/09/2021
• Auteurs : Philippe FravaloMichel FederighiJean Pierre GanièreLionel GrisotDidier HilaireSophie Le BouquinCaroline Le MaréchalFrancois MeurensMichèle TremblayFrédéric AuvrayMickaël BoniCatherine ChubilleauFlorence Dubois-BrissonnetSteven DuretMichèle GourmelonMichel GautierStéphane GuyotNathalie Jourdan-da SilvaRenaud LaillerBertrand LombardSandra Martin-LatilFlorence MathieuJeanne-Marie MembréÉric OswaldPascal PiveteauSabine Schorr-GalindoNalini Rama RaoRégine TalonMuriel ThomasIsabelle VillenaGilles MeyerCatherine BellocStéphane BertagnoliAlain BoissyHenri-Jean BoulouisÉric CollinJean-Claude DesfontisMaria-Eleni FilippitziDavid FretinEmmanuelle Gilot-FromontÉtienne GiraudNadia HaddadViviane HenauxElsa JourdainSophie Le PoderÉlodie Monchatre-LeroyMonique L’hostisVirginie MichelPierre MormedeHervé MorvanCarine ParaudAriane PayneMichel PepinCarole PerozClaire PonsartClaude SaegermanGaëlle SimonJean-Pierre VaillancourtPauline KoohLaurent GuillierKarine Petit
• Organismes : Conservatoire National des Arts et Métiers [Cnam] École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique Retraité École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique Groupement Technique Vétérinaire Délégation générale de l'armement Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort [ANSES] Epidémiologie, Santé et Bien-être Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort [ANSES] Hygiène et qualité des produits avicoles et porcins École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique Direction de la santé publique de Montréal Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] Centre Hospitalier Georges Renon [Niort] AgroParisTech MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé Génie des procédés frigorifiques pour la sécurité alimentaire et l'environnement Unité Dynamiques des Écosystèmes Côtiers AGROCAMPUS OUEST Procédés Microbiologiques et Biotechnologiques Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France] Unité Epidémiologie et Appui à la Surveillance Direction de la Stratégie et des Programmes Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Normandie Laboratoire de Génie Chimique SECurité des ALIments et Microbiologie Institut de Recherche en Santé Digestive Optimisation des procédés en Agriculture, Agroalimentaire et Environnement Université de Montpellier Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement INRAE Transfert INRAE Transfert Hôpital universitaire Robert Debré [Reims] Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse INRAE Transfert École nationale vétérinaire d'Alfort École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique Sciensano [Bruxelles] Sciensano [Bruxelles] VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse École nationale vétérinaire d'Alfort Laboratoire de Lyon [ANSES] École nationale vétérinaire d'Alfort Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort [ANSES] Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail INRAE Transfert Environnement [Narbonne] LABOCEA Laboratoire [Plouzané, France] Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort [ANSES] Office national de la chasse et de la faune sauvage VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement Centre Hospitalier Universitaire Vétérinaire d'Oniris [Nantes] Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail Université de Liège = University of Liège = Universiteit van Luik = Universität Lüttich Laboratoire de Lyon [ANSES] Université de Montréal Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques

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Résumé : Le botulisme est une maladie neurologique humaine et animale provoquée par l’action de neurotoxines bactériennes (toxines botuliques) produites par des bactéries du genre Clostridium et qui se manifeste par des paralysies flasques pouvant aller jusqu’à la paralysie respiratoire et l’arrêt cardiaque. Il existe neuf types connus de toxines botuliques. Le botulisme animal en France concerne essentiellement les oiseaux (sauvages et domestiques) et les bovins. Les cas chez les bovins sont dus aux types mosaïque D/C (majoritaire), C, C/D et rarement au D. Au niveau national, l’incidence observée les 10 dernières années est en moyenne d’une dizaine de foyers par an. Bien qu’il s’agisse d’une maladie animale de première catégorie, il n’y a pas à l’heure actuelle de mesures de police sanitaire établies par la réglementation, lors de la confirmation d’un foyer de botulisme animal, ce qui conduit à une gestion au cas par cas par les directions départementales de la protection des populations (DDPP) et la mission des urgences sanitaires (MUS) de la DGAL. Ces services peuvent s’appuyer sur deux documents émis par l’Afssa : le rapport sur le botulisme animal établi en 2002 et l’avis rendu en janvier 2009 sur un projet d’arrêté fixant des mesures techniques et administratives relatives à la lutte contre le botulisme aviaire. Les rapports et avis cités étant relativement anciens, la DGAL a saisi l’Anses via 4 saisines (saisines 2019-SA-0112 à 2019-SA-0115), dont l’objet est une demande d’actualisation des connaissances et des évaluations de risque pour la santé humaine et/ou animale. L’expertise a été réalisée en deux étapes : 1. Une mise à jour des connaissances sur Clostridium botulinum (types C, D, mosaïques C/D et D/C et E) effectuée par le groupe de travail (GT) « Groupe socle botulisme », portant sur les caractéristiques microbiologiques, les maladies humaine et animale (bovins, oiseaux et poissons), la présence des différentes formes et types dans l’environnement, le danger dans les denrées alimentaires d’origine animale ainsi que l’efficacité des méthodes et procédés d’inactivation. 2. Le traitement des questions d’évaluation des risques par des groupes de travail spécifiques (« Botulisme bovin-aviaire » ; « Décontamination » ; « Faune sauvage et environnement »). La présente saisine porte sur l’évaluation des risques en appui des mesures de gestion de produits dans la filière bovine, lors de suspicion et de confirmation de cas de botulisme dans un troupeau. Les questions posées dans la saisine sont les suivantes : - « Quel est le risque pour l’Homme lié à la consommation de produits carnés ou laitiers provenant d’un bovin en incubation ou atteint de botulisme ? Le risque est-il différent selon les souches bactériennes et la population concernée (nourrissons, enfants, adultes, personnes fragiles) ? Comment l’état de santé des animaux influence-t-il le risque pour le consommateur final (importance relative entre la phase d’incubation et la phase clinique) ? - Quel est le risque potentiel associé aux produits carnés et laitiers issus des autres animaux du troupeau que ceux strictement malades ? Existe-t-il des moyens pour diminuer ce risque de contamination des produits ? - La manipulation de carcasses en abattoir d’un animal issu d’un lot de bovins atteints de botulisme mais dépourvus de signes cliniques présente-t-elle un risque pour les employés de contracter le botulisme ? Comment le maîtriser ? - Quelle est l’efficacité des différents traitements du lait sur les formes végétatives et sporulées (pasteurisation, traitement UHT, bactofugation, filtration membranaire) ? Dans quelle mesure peuvent-ils être considérés comme assainissant ?

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 23/09/2021
• Auteurs : Jordan NowakPhilippe FraisseAndrea CherubiniJean-Pierre Daurès
• Organismes : Interactive Digital Humans Interactive Digital Humans Interactive Digital Humans Clinique Médicale Beausoleil

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Résumé : Current day robots often rely - for visual perception - on the coupling of two cameras: one for color and one for depth. While for custom RGB-D cameras, the manufacturer takes care of aligning the two images, this is not done when two commercial cameras are coupled (e.g., on the Pepper robot) without having been calibrated beforehand. In this article, we present a simple open library for reconstructing the 3D position of RGB pixels without knowing the parameters of the two cameras. The library requires a simple preliminary calibration step based on pixel-to-pixel matching, and then automatically reconstructs 3D colored point clouds from a given set of pixels in the RGB image. The source code is available at the following link https://github.com/jordan-nowak/OpenHSML.

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Fichiers liés : C45-2021_PointCloudsWithColorASimpleOpenLibraryForMatchingRGBAndDepthPixelsFromAnUncalibratedStereoPair_Nowak.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 23/09/2021
• Auteurs : Christian JungJesper FjølnerRaphael Romano BrunoBernhard WernlyAntonio ArtigasBernardo Bollen PintoJoerg C SchefoldGeorg WolffMalte KelmMichael BeilSigal SviriPeter Vernon Van HeerdenWojciech SzczeklikMiroslaw CzuczwarMichael JoannidisSandra OeyenTilemachos ZafeiridisFinn H AndersenRui MorenoSusannah LeaverAriane BoumendilDylan W De LangeBertrand GuidetHans FlaattenPhilipp EllerMichael JoannidisDieter MesottenPascal ReperSandra OeyenWalter SwinnenHelene BrixJens BrushoejMaja VillefranceHelene Korvenius NedergaardAnders Thais BjerregaardIda Riise BallebyKasper AndersenMaria Aagaard HansenStine UhrenholtHelle BundgaardJesper FjølnerAliae Ar Hussein MohamedRehab SalahYasmin Khairy Nasreldin Mohamed AliKyrillos WassimYumna A ElgazzarSamar TharwatAhmed Y AzzamAyman Abdelmawgoad HabibHazem Maarouf AbosheaishaaMohammed A AzabSusannah LeaverArnaud GalboisBertrand GuidetCyril CharronEmmanuel GuerotGuillaume BeschJean-Philippe RigaudJulien MaizelMichel DjibréPhilippe BurtinPierre GarconSaad NseirXavier ValetteNica AlexandruNathalie MarinMarie VaissiereGaëtan PlantefeveThierry VanderlindenIgor JurcisinBuno MegarbaneAnais CaillardArnaud ValentMarc GarnierSebastien BessetJohanna OzielJean-Herlé RaphaelenStéphane DaugerGuillaume DumasBruno GoncalvesGaël PitonChristian JungRaphael Romano BrunoMalte KelmGeorg WolffEberhard BarthUlrich GoebelEberhard BarthAnselm KunsteinMichael SchusterMartin WelteMatthias LutzPatrick MeybohmStephan SteinerTudor PoernerHendrik HaakeStefan SchallerDetlef Kindgen-MillesChristian MeyerMuhammed KurtKarl Friedrich KuhnWinfried RanderathJakob WollbornZouhir DindaneHans-Joachim KabitzIngo VoigtGonxhe ShalaAndreas FaltlhauserNikoletta RovinaZoi AidoniEvangelia ChrisanthopoulouAntonios PapadogoulasMohan GurjarAta MahmoodpoorAbdullah Khudhur AhmedBrian MarshAhmed ElsakaSigal SviriVittoria ComelliniAhmed RabhaHazem AhmedSilvio A Namendys-SilvaAbdelilah GhannamMartijn GroenendijkMarieke ZegersDylan De LangeAlex CornetMirjam EversLenneke HaasTom DormansWillem DieperinkLuis RomundstadBritt SjøbøFinn H AndersenHans Frank StrietzelTheresa OlasveengenMichael HahnMiroslaw CzuczwarRyszard GawdaJakub KlimkiewiczMaria Campos De LurdessantosAndré GordinhoHenrique SantosRui AssisAna Isabel Pinho OliveiraMohamed Raafat BadawyDavid Perez-TorresGemma GomàMercedes Ibarz VillamayorAngela Prado MiraPatricia Jimeno CuberoSusana Arias RiveraTeresa TomasaDavid IglesiasEric Mayor VázquezCesar AldecoaAida Fernández FerreiraBegoña Zalba-EtayoIsabel Canas-PerezLuis Tamayo-LomasCristina Diaz-RodriguezSusana SanchoJesús PriegoEnas M Y AbualqumbozMomin Majed Yousuf HillesMahmoud SalehNawfel Ben-HamoudaAndrea RobertiAlexander DullenkopfYvan FleuryBernardo Bollen PintoJoerg C SchefoldMohammed Al-SadawiNicolas SerckElisabeth DewaelePritpal KumarCamilla BundesenRichard InnesJames GoochLenka CagovaElizabeth PotterMichael ReayMiriam DaveySally HumphreysCaroline Hauw BerlemontBenjamin ChoustermanFrançois DépretAlexis FerreLucie VettorettiDidier TheveninAndreas FaltlhauserMilena MilovanovicPhilipp SimonMarco LorenzSandra Emily StollSimon DublerKristina FuestFrancesk MulitaEumorifa KondiliIoannis AndrianopoulosIwan MeynaarAlexander Daniel CornetBritt SjøbøeAnna KluzikPaweł ZatorskiTomasz DrygalskiWojciech SzczeklikJoanna Solek-PastuszkaDariusz OnichimowskiJan StefaniakKarina Stefanska-WronkaEwa ZabulFilipe Sousa CardosoMaria José Arche BanzoTeresa Maria Tomasa-IrriguibleÁngela Prado MiraSusana Arias-RiveraFernando Frutos-VivarSonia Lopez-CuencaPablo Ruiz De GopeguiNour AbidiIvan ChauRichard PughSara Smuts
• Organismes : Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique CHU Saint-Antoine [AP-HP] Mécanismes physiopathologiques et conséquences des calcifications cardiovasculaires - UR UPJV 7517
• Publié dans Critical Care le 31/10/2020

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Résumé : Background: The primary aim of this study was to assess the outcome of elderly intensive care unit (ICU) patients treated during the spring and autumn COVID-19 surges in Europe. Methods: This was a prospective European observational study (the COVIP study) in ICU patients aged 70 years and older admitted with COVID-19 disease from March to December 2020 to 159 ICUs in 14 European countries. An electronic database was used to register a number of parameters including: SOFA score, Clinical Frailty Scale, co-morbidities, usual ICU procedures and survival at 90 days. The study was registered at ClinicalTrials.gov (NCT04321265). Results: In total, 2625 patients were included, 1327 from the first and 1298 from the second surge. Median age was 74 and 75 years in surge 1 and 2, respectively. SOFA score was higher in the first surge (median 6 versus 5, p < 0.0001). The PaO2/FiO2 ratio at admission was higher during surge 1, and more patients received invasive mechanical ventilation (78% versus 68%, p < 0.0001). During the first 15 days of treatment, survival was similar during the first and the second surge. Survival was lower in the second surge after day 15 and differed after 30 days (57% vs 50%) as well as after 90 days (51% vs 40%). Conclusion: An unexpected, but significant, decrease in 30-day and 90-day survival was observed during the second surge in our cohort of elderly ICU patients. The reason for this is unclear. Our main concern is whether the widespread changes in practice and treatment of COVID-19 between the two surges have contributed to this increased mortality in elderly patients. Further studies are urgently warranted to provide more evidence for current practice in elderly patients.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 23/09/2021
• Auteurs : Claire LamaisonSimon LatourNelson HélaineValerie Le MorvanJulien Saint-VanneIsabelle MahoucheCeline MonvoisinChristelle DussertLaetitia AndriqueLaurent DeleurmeElise DessaugeCeline PangaultSylvain BaulandePatricia LegoixMarine SeffalsLea Broca-BrissonKévin AlessandriMartina Prochazkova-CarlottiPierre SoubeyranJean-Philippe MerlioFrédéric MourcinPierre NassoyGaëlle RecherKarin TarteLaurence Bresson-Bepoldin
• Organismes : Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer Etablissement français du sang [Rennes] University of Toronto Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences Actions for OnCogenesis understanding and Target Identification in ONcology Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer Etablissement français du sang [Rennes] Actions for OnCogenesis understanding and Target Identification in ONcology Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer Actions for OnCogenesis understanding and Target Identification in ONcology Université de Bordeaux Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer Etablissement français du sang [Rennes] Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer Université de Rennes Institut Curie [Paris] Institut Curie [Paris] Plateforme de sequencage ICGEX Université de Rennes Actions for OnCogenesis understanding and Target Identification in ONcology Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] Institut Bergonié [Bordeaux] Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer Etablissement français du sang [Rennes] Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer Etablissement français du sang [Rennes] Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux]
• Publié dans Blood Advances le 24/10/2020

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Résumé : Non-Hodgkin B-cell lymphomas (B-NHL) mainly develop within lymph nodes as aggregates of tumor cells densely packed with their surrounding microenvironment, creating a tumor niche specific to each lymphoma subtypes. In vitro preclinical models mimicking biomechanical forces, cellular microenvironment, and 3D organization of B-cell lymphomas remain scarce, while all these parameters are key determinants of lymphomagenesis and drug resistance. Using a microfluidic method based on cell encapsulation inside permeable, elastic, and hollow alginate microspheres, we developed a new tunable 3D model incorporating lymphoma B cells, extracellular matrix (ECM), and/or tonsil stromal cells (TSC). Under 3D confinement, lymphoma B cells were able to form cohesive spheroids resulting from overexpression of ECM components. Moreover, lymphoma B cells and TSC dynamically formed self-organized 3D spheroids favoring tumor cell growth. 3D culture induced resistance to the classical chemotherapeutic agent doxorubicin, but not to the BCL2 inhibitor ABT-199, identifying this approach as a relevant in vitro model to assess the activity of therapeutic agents in B-NHL. RNA-sequence analysis highlighted the synergy of 3D, ECM, and TSC in upregulating similar pathways in malignant B cells in vitro than those overexpressed in primary lymphoma B cells in situ. Finally, our 3D model including ECM and TSC allowed long-term in vitro survival of primary follicular lymphoma B cells. In conclusion, we propose a new high-throughput 3D model mimicking lymphoma tumor niche and making it possible to study the dynamic relationship between lymphoma B cells and their microenvironment and to screen new anti-cancer drugs.

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Fichiers liés : Lamaison et al - 2021 - A novel 3D culture model recapitulates primary FL B cell features.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 23/09/2021
• Auteurs : Marc-Antoine BenderraAinhoa AparicioJudith LeblancDemian WassermannEmmanuelle KempfGilles GalulaMélodie BernauxAnthony CanellasThomas MoreauAli BellamineJean-Philippe SpanoChristel DanielJulien ChampFlorence Canouï-PoitrineJoseph Gligorov
• Organismes : CHU Tenon [AP-HP] IMRB - CEPIA/"Clinical Epidemiology And Ageing : Geriatrics, Primary Care and Public Health" [Créteil] Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique Modelling brain structure, function and variability based on high-field MRI data Service d'Oncologie médicale [CHU Henri Mondor] Laboratoire d'Informatique Médicale et Ingénierie des Connaissances en e-Santé CHU Tenon [AP-HP] Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) CHU Tenon [AP-HP] Modelling brain structure, function and variability based on high-field MRI data Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) Institut Universitaire de Cancérologie [Sorbonne Université] Laboratoire d'Informatique Médicale et Ingénierie des Connaissances en e-Santé Scientific Data Management Institut Mondor de Recherche Biomédicale IMRB - CEPIA/"Clinical Epidemiology And Ageing : Geriatrics, Primary Care and Public Health" [Créteil] CHU Tenon [AP-HP] Institut Universitaire de Cancérologie [Sorbonne Université]
• Publié dans Cancers le 21/10/2020

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Résumé : Background: COVID-19 may be more frequent and more severe in cancer patients than in other individuals. Our aims were to assess the rate of COVID-19 in hospitalized cancer patients, to describe their demographic characteristics, clinical features and care trajectories, and to assess the mortality rate. Methods: This multicenter cohort study was based on the Electronic Health Records of the Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP). Cancer patients with a diagnosis of COVID-19 between 3 March and 19 May 2020 were included. Main outcome was all-cause mortality within 30 days of COVID-19 diagnosis. Results: A total of 29,141 cancer patients were identified and 7791 (27%) were tested for SARS-CoV-2. Of these, 1359 (17%) were COVID-19-positive and 1148 (84%) were hospitalized; 217 (19%) were admitted to an intensive care unit. The mortality rate was 33% (383 deaths). In multivariate analysis, mortality-related factors were male sex (aHR = 1.39 [95% CI: 1.07–1.81]), advanced age (78–86 y: aHR = 2.83 [95% CI: 1.78–4.51] vs. <66 y; 86–103 y: aHR = 2.61 [95% CI: 1.56–4.35] vs. <66 y), more than two comorbidities (aHR = 2.32 [95% CI: 1.41–3.83]) and C-reactive protein >20 ng/mL (aHR = 2.20 [95% CI: 1.70–2.86]). Primary brains tumors (aHR = 2.19 [95% CI: 1.08–4.44]) and lung cancer (aHR = 1.66 [95% CI: 1.02–2.70]) were associated with higher mortality. Risk of dying was lower among patients with metabolic comorbidities (aHR = 0.65 [95% CI: 0.50–0.84]). Conclusions: In a hospital-based setting, cancer patients with COVID-19 had a high mortality rate. This mortality was mainly driven by age, sex, number of comorbidities and presence of inflammation. This is the first cohort of cancer patients in which metabolic comorbidities were associated with a better outcome.

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Fichiers liés : cancers-13-04749-v5.pdf

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 22/09/2021
• Auteurs : Philippe GouézinEmmanuel MensVincent Ard
• Organismes : Centre de Recherche en Archéologie, Archéosciences, Histoire Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés Travaux et recherches archéologiques sur les cultures, les espaces et les sociétés

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 21/09/2021
• Auteurs : Guillaume ThirelLila ColletFabienne RoussetOlivier DelaigueDidier FrancoisJoël GailhardMatthieu Le LayCharles PerrinMathieu ReverdyRaphaëlle SamacoitsMorgane TerrierJean-Philippe VidalJean-Pierre Wagner
• Organismes : Hydrosystèmes continentaux anthropisés : ressources, risques, restauration Hydrosystèmes continentaux anthropisés : ressources, risques, restauration Météo-France Direction Interrégionale Sud-Est Hydrosystèmes continentaux anthropisés : ressources, risques, restauration Centre de Recherche en Géographie EDF – Électricité de France EDF – Électricité de France Hydrosystèmes continentaux anthropisés : ressources, risques, restauration RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes Météo-France Direction Interrégionale Sud-Est Hydrosystèmes continentaux anthropisés : ressources, risques, restauration RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes Direction Régionale de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement - Grand Est

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Fichiers liés : CHIMERE21_AG_HYCAR_20210927.pdf

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• Type de publi. : Communication dans un congrès
• Date de publi. : 20/09/2021
• Auteurs : Raphaël GarinCharles VanwynsberghePhilippe ForjonelBeatrice TomasiPierre-Jean Bouvet
• Organismes : Systèmes Embarqués, Acoustique et Télécommunications Systèmes Embarqués, Acoustique et Télécommunications Systèmes Embarqués, Acoustique et Télécommunications Systèmes Embarqués, Acoustique et Télécommunications Systèmes Embarqués, Acoustique et Télécommunications

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Résumé : Currently in the field of autonomous underwater vehicles localization, it is difficult to do without a Doppler Velocity Log (DVL). Combined with distance measurements or not, this fairly expensive sensor is a must-have. In this paper we introduce our method by combining underwater acoustic communication and localization through Doppler shift estimation needed in the vehicle transmission modem for communication. This cost-effective technique provides an information on transmitter/receiver relative speed. We consider a fixed anchor with known position transmitting regularly to a receiver in a water pool of 3m². Using an Extended Kalman filter, we compare standalone range measurements estimation with speed-only measurements and speed with range combined in the estimation filter. Experimental results demonstrate a consequent gain using speed computation associated with range measurement.

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Fichiers liés : 2021151014 (1).pdf

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