Philippe JEAN-PIERRE

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 05/03/2025
• Auteurs : Billal TedbirtEstelle HouivetMaud Maho-VaillantMarie-Laure GolinskiSébastien CalboCatherine Prost-SquarcioniBruno LabeilleCatherine Picard-DahanG. ChabyMarie-Aleth RichardEmmanuelle Tancrède-BohinSophie Duvert-LehembreEmmanuel DelaportePhilippe BernardFrédéric CauxMarina AlexandrePhilippe MusetteSaskia Ingen‐housz‐oroPierre VabresGaëlle QuéreuxAlain DupuySébastien DebarbieuxMartine Avenel-AudranMichel D’incanChristophe BédaneNathalie BénétonDenis JullienNicolas DupinLaurent MiseryLaurent MachetMarie Beylot-BarryOlivier DereureBruno SassolasNadège CordelGéraldine JeudyJacques BénichouVivien HébertPascal Joly
• Organismes : CHU Rouen Physiopathologie, Autoimmunité, maladies Neuromusculaires et THErapies Régénératrices CHU Rouen CHU Rouen Physiopathologie, Autoimmunité, maladies Neuromusculaires et THErapies Régénératrices CHU Rouen Physiopathologie, Autoimmunité, maladies Neuromusculaires et THErapies Régénératrices Physiopathologie, Autoimmunité, maladies Neuromusculaires et THErapies Régénératrices AP-HP - Hôpital Avicenne Université Jean Monnet - Saint-Étienne CIC Hôpital Bichat Centre Hospitalier Universitaire d'Amiens-Picardie Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie AP-HP - Hôpital Saint-Louis [Paris] Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] Hôpital Alexandra Lepève – Centre Hospitalier de Dunkerque Hôpital Nord [CHU - APHM] Université de Reims Champagne-Ardenne AP-HP - Hôpital Avicenne AP-HP - Hôpital Avicenne AP-HP - Hôpital Avicenne Epidemiology in Dermatology and Evaluation in Therapeutics Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand Immunology and New Concepts in ImmunoTherapy Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Pontchaillou] Institut de recherche en santé, environnement et travail Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] Université d'Angers Université Clermont Auvergne Université de Limoges Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans) Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL] Assistance publique - Hôpitaux de Paris Université Paris Cité Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest Laboratoire sur les interactions Epithéliums Neurones Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours Université de Bordeaux Université de Montpellier Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest Institute for Research and Innovation in Biomedicine Physiopathologie, Autoimmunité, maladies Neuromusculaires et THErapies Régénératrices Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations CHU Rouen Physiopathologie, Autoimmunité, maladies Neuromusculaires et THErapies Régénératrices CHU Rouen Physiopathologie, Autoimmunité, maladies Neuromusculaires et THErapies Régénératrices
• Publié dans JAMA Dermatology le 28/10/2020

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Résumé : No abstract available

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• Type de publi. : Rapport
• Date de publi. : 05/03/2025
• Auteurs : Fabrice NesslanySabrina BoutefnouchetPierre ChampyHanh DufatMarion GirardotThierry HennebelleMarie-Aleth Lacaille-DuboisSerge MichaletCéline RivièreFlorence SouardDominique Angèle VuittonBernard WenigerMartine AvenelCéline DelermeJean-Philippe JaegNgoc an LeLudovic Le HegaratIsabelle Lussot-KervernHervé PouliquenSophie SimarFrançois MariottiFrédérik BarreauCharlotte BeaudartCatherine Bennetau-PelisseroClara Benzi-SchmidMarie-Christine Boutron-RuaultBlandine de Lauzon-GuillainAmandine Divaret-ChauveauChristine Feillet-CoudrayAmandine Gautier-SteinJacques GroberJean-François HuneauEmmanuelle Kesse-GuyotCorinne Malpuech-BrugereChristine MorandBéatrice Morio-LiondoreAnne-Sophie RousseauStéphane WalrandKarine Adel-PatientAnnabelle BedardCécile BetryPatrick BorelTao JiangNathanael LapidusThomas MouillotRuddy RichardOlivier SteichenClaire MathiotAymeric DopterPerrine NadaudFanny Huret
• Organismes : Institut Pasteur de Lille Cibles Thérapeutiques et conception de médicaments Biomolécules : Conception, Isolement, Synthèse Université Paris Descartes - Paris 5 Microorganismes, Hôtes, Environnements [Équipe du laboratoire EBI Poitiers] BioEcoAgro - Equipe 5 - Specialized Metabolites of Plant Origin Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 BioEcoAgro - UMR transfrontalière INRAE 1158 BioEcoAgro - Equipe 5 - Specialized Metabolites of Plant Origin Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] Université de Strasbourg Agence nationale de sécurité du médicament et des produits de santé [Saint-Denis] École nationale vétérinaire de Toulouse Agence nationale de sécurité du médicament et des produits de santé [Saint-Denis] Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique Institut Pasteur de Lille Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Université de Liège = University of Liège = Universiteit van Luik = Universität Lüttich Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine Office fédéral de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations Obstetrical, Perinatal and Pediatric Epidemiology | Épidémiologie Obstétricale, Périnatale et Pédiatrique Service d’allergologie pédiatrique [CHRU de Nancy] Dynamique du Muscle et Métabolisme Nutrition, diabète et cerveau Center for Translational and Molecular medicine [Dijon - UMR1231] Institut Agro Dijon Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire Nutritional Epidemiology Research Team | Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle Université Sorbonne Paris Nord Université Clermont Auvergne Unité de Nutrition Humaine Unité de Nutrition Humaine Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition Institut de Biologie Valrose Unité de Nutrition Humaine CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand] Médicaments et Technologies pour la Santé Service de Pharmacologie et Immunoanalyse Laboratoire d'immuno-allergie alimentaire Département Alimentation Humaine - INRAE Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations Modélisation et Évaluation des données complexes en Santé Publique CHU de Grenoble-Alpes - Centre Hospitalier Universitaire CHU Grenoble Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique AP-HP - Hôpital Saint-Antoine Service d'Hépato-Gastro-Entérologie (CHU de Dijon) CHU Clermont-Ferrand AP-HP - Hôpital Tenon Drépanocytose : groupe de Recherche de Paris – Sorbonne Université Surveillance et modélisation des maladies transmissibles [iPLesp] Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques Direction de l'Evaluation des Risques

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Résumé : L’Anses s’est autosaisie le 31 mars 2020 pour évaluer les risques liés à la consommation de compléments alimentaires contenant du « Garcinia cambogia ». CONTEXTE ET OBJET DE LA SAISINE Garcinia cambogia Desr. est une plante traditionnellement utilisée en Asie en tant que condiment dans des préparations culinaires et pour des usages médicinaux. Cette plante est autorisée dans les compléments alimentaires dans plusieurs pays de l’Union européenne. En France, l’utilisation de plantes dans les compléments alimentaires est encadrée par le décret n°2006-352 du 20 mars 2006 relatif aux compléments alimentaires et par l’arrêté du 24 juin 2014 établissant la liste des plantes, autres que les champignons, autorisées dans les compléments alimentaires et les conditions de leur emploi, ci-après dénommé « arrêté plantes » [1]. Garcinia cambogia Desr. ne figure pas sur cette liste mais elle est inscrite, du fait de la reconnaissance mutuelle entre les Etats membres au titre de l’article 16 du décret n°2006-352, sous le nom erroné de Garcinia gummi-gutta (L.) Roxb [2], sur la liste consolidée par la Direction générale de la concurrence, de la consommation et de la répression des fraudes (DGCCRF) [3] et publiée en janvier 2019 ainsi que sur le site Compl'Alim mis en place par la Direction générale de l’alimentation (DGAL) en 2024 [4]. Les extraits de Garcinia cambogia Desr. sont présents dans des compléments alimentaires visant la perte de poids. Ses propriétés amaigrissantes sont attribuées à l’acide (-)-hydroxycitrique (AHC) présent dans le péricarpe du fruit. Cette substance fait actuellement l’objet d’une évaluation par l’Autorité européenne de sécurité des aliments (Efsa) dans le cadre de la procédure prévue à l’article 8 du règlement 1925/2006 du parlement et du conseil du 20 décembre 2006 concernant l'adjonction de vitamines, de minéraux et de certaines autres substances aux denrées alimentaires. Dans le cadre de son dispositif de nutrivigilance, l’Anses a reçu en 2019, le signalement d’un cas d’hépatite fulminante mortelle associée à la consommation du complément alimentaire Slim Metabol®, contenant notamment du Garcinia cambogia Desr. Au vu de la sévérité des effets indésirables et de l’imputabilité très vraisemblable de ce produit, ce signalement a été publié sur le site de l’Anses5. La revue bibliographique menée à l’occasion de l’expertise de ce cas, a mis en évidence l’implication majeure de Garcinia cambogia Desr. dans la survenue d’hépatites fulminantes similaires à partir de 2005. Depuis la mise en place du dispositif de nutrivigilance en 2009, trente-huit signalements d’effets indésirables susceptibles d’être liés à la consommation de compléments alimentaires contenant du Garcinia cambogia Desr. ont été portés à la connaissance de l’Anses. Aux États-Unis et au Canada, des signalements d’atteintes hépatiques, musculaires, cardiaques et neurologiques parfois graves ont été rapportés quelques années après la commercialisation de produits multi-ingrédients contenant du Garcinia cambogia Desr.. Cela a d’ailleurs conduit, en 2009, la Food and Drug Administration (FDA) à demander le retrait de Garcinia cambogia Desr. de la composition de ces produits. En France, l’Agence nationale de sécurité du médicament et des produits de santé (ANSM) a interdit en 2012 « l’importation, la préparation, la prescription et la délivrance de préparations magistrales, officinales et hospitalières composées de Garcinia cambogia, ainsi que la prescription, la délivrance et l’administration à l’homme de la plante Garcinia cambogia ». Au vu de ces données, l’Anses et compte tenu de la mission de nutrivigilance qui lui a été confiée par la loi du 21 juillet 20096, l’agence a décidé de s’autosaisir afin de dresser un état des lieux des connaissances relatives aux propriétés physico-chimiques de Garcinia cambogia Desr. ainsi qu’une analyse des cas cliniques publiés dans la littérature ou rapportés dans le cadre de dispositifs de vigilance, afin de tirer les conclusions de cet ensemble de signaux. [1] Arrêté du 24 juin 2014 établissant la liste des plantes, autres que les champignons, autorisées dans les compléments alimentaires et les conditions de leur emploi : https://www.legifrance.gouv.fr/loda/id/JORFTEXT000029254516 [2] Cette désignation erronée ne correspond à aucune plante [3]https://www.economie.gouv.fr/files/files/directions_services/dgccrf/securite/produits_alimentaires/Complement_alimentaire/CA_Liste_PlantesAutres_janvier2019.pdf? [4] https://compl-alim.beta.gouv.fr/entreprises

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 05/03/2025
• Auteurs : Nathalie KomatiElio RiboliJoel DoreEmma BoylandJean-Pierre CravediFrans FolkvordJean-Michel LecerfFrançoise LescourretAlain PeetersChristian ReynoldsBenjamin AllèsMarie-Josephe AmiotPhilippe BinardNathalie M DelzenneNita G. ForouhiCéline GinerBoitshepo GiyoseCarmen Gloria GonzalezMarc J. GunterRemi KahaneAnna HerforthRoel HermansDiego S IntriglioloGiuseppe MontanaroDavide NeriSophie NicklausPilar SantacolomaDaniel SauvaitreMarc-André SelosseTim SmitsS. StrangesPeter BergstenPiedad Coscollá ToledoMachteld van LieshoutW VerschurenKremlin WickramasingheGertrude ZeinstraClaire ChambrierJohanna CalvarinDelphine Tailliez
• Organismes : Agence pour la Recherche et l’Information en Fruits et Légumes Imperial College London MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé University of Liverpool Agence pour la Recherche et l’Information en Fruits et Légumes Tilburg University [Tilburg] Institut Pasteur de Lille Plantes et systèmes de culture horticoles Agroecology Europe and Terres Vivantes, Corbais University of London [London] Nutritional Epidemiology Research Team | Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle Montpellier Interdisciplinary center on Sustainable Agri-food systems (Social and nutritional sciences) Freshfel Europe, Brussels Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain University of Cambridge [Cambridge, UK] Organisation de Coopération et de Développement Economiques = Organisation for Economic Co-operation and Development African Union Development Agency – New Partnership for Africa’s Development [Midrand, South Africa] Universidad de Chile = University of Chile [Santiago] Imperial College London Cirad Direction Générale Harvard T.H. Chan School of Public Health LeefstijlLab, Arnhem Desertification Research Centre Università degli studi della Basilicata = University of Basilicata Polytechnic University of Marche / Università Politecnica delle Marche Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] Viale delle Terme de Caracalla Association Nationale Pommes Poires Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité University of Gdańsk Institut universitaire de France Catholic University of Leuven = Katholieke Universiteit Leuven Western University [Ontario] University of Naples Federico II = Università degli studi di Napoli Federico II Université Clermont Auvergne Anecoop, Valencia Université des sciences appliquées de La Haye National Institute for Public Health and the Environment [Bilthoven] University Medical Center [Utrecht] Universiteit Utrecht / Utrecht University [Utrecht] Organisation Mondiale de la Santé - World Health Organization Regional Office for Europe [Copenhagen] Wageningen University and Research [Wageningen] Agence pour la Recherche et l’Information en Fruits et Légumes Agence pour la Recherche et l’Information en Fruits et Légumes Agence pour la Recherche et l’Information en Fruits et Légumes
• Publié dans European Journal of Nutrition le 22/10/2020

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Résumé : Purpose To present the outcomes of the EGEA Conference on the state of knowledge regarding the contribution of diets rich in fruit and vegetables (FV) to human and planetary health, commonly included in the One Health concept. Methods The 9th edition of EGEA Conference (20-22 September 2023, Barcelona) provided a transversal and multidisciplinary perspective on the contribution of FV to One Health, in particular to the health of individuals, society and the planet. Nearly 150 international scientists and stakeholders discussed the current state of knowledge. These proceedings are based both on a literature review and the scientic studies presented by the speakers. Results Scientic evidence conrms the role of FV in preventing cardiovascular diseases and type 2 diabetes; more evidence is needed on the eects and mechanisms of FV in cancer prevention. FV production and consumption helps ensure territorial cohesion and provides a denser, nutrient-rich diet with less environmental impact (except water use) than other food groups, but use of synthetic pesticides in FV production remains a challenge that could be addressed with agro-ecological solutions. Various factors inuence consumer choice and behaviour towards FV consumption across the lifespan, with specic periods being more conducive to change. New research is emerging on the role of FV consumption in regulating gut microbiota and on both mental and brain health; the potential role of FV production and supply in tackling biodiversity loss and climate change; and better monitoring of FV consumption. Conclusion Sucient evidence conrms the contribution of diet rich in FV to One Health, with some emerging research on this topic. Concerted actions are required towards an increased consumption of FV and a more diversied and environmentally neutral FV production.

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Fichiers liés : komati_2025_vol64_108_ejn.pdf

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• Type de publi. : Pré-publication, Document de travail
• Date de publi. : 04/03/2025
• Auteurs : Aude NicolasRichard ShervaBenjamin Grenier-BoleyYoontae KimMasataka KikuchiJigyasha TimsinaItziar de RojasMaría Carolina DalmassoXiaopu ZhouYann Le GuenCarlos Arboleda-BustosMaria Aparecida Camargos BicalhoMaëlenn GuerchetSven van der LeeMonica GossAtahualpa CastilloCéline BellenguezFahri KüçükaliClaudia SatizabalBernard FongangQiong YangOliver PetersAnja SchneiderMartin DichgansDan RujescuNorbert ScherbaumJürgen DeckertSteffi Riedel-HellerLucrezia HausnerLaura Molina PorcelEmrah DüzelTimo GrimmerJens WiltfangStefanie Heilmann-HeimbachSusanne MoebusThomas TegosNikolaos ScarmeasOriol Dols-IcardoFermin MorenoJordi Pérez-TurMaría BullidoPau PastorRaquel Sánchez-ValleVictoria ÁlvarezHan CaoNancy IpAmy FuFanny IpNatividad OlivarCarolina MuchnikCarolina CuestaLorenzo CampanelliPatricia SolisDaniel Gustavo PolitisSilvia KochenLuis Ignacio BruscoMercè BoadaPablo García-GonzálezRaquel PuertaPablo MirLuis RealGerard Piñol-RipollJose María García-AlbercaJose Luís RoyoEloy Rodriguez-RodriguezHilkka SoininenSami HeikkinenAlexandre de MendonçaShima MehrabianLatchezar TraykovJakub HortMartin VyhnalekKatrine Laura RasmussenJesper Qvist ThomassenYolande A.L. PijnenburgHenne HolstegeJohn van SwietenHarro SeelaarJurgen A.H.R. ClaassenWillemijn JansenInez RamakersFrans VerheyAad van der LugtPhilip ScheltensJenny Ortega-RojasAna Gabriela Concha MeraMaria MahechaRodrogo PardoGonzalo ArboledaShahram BahramiVera FominykhGeir SelbækCaroline GraffGoran PapenbergVilmantas GiedraitisAnne BolandJean-François DeleuzeLuiz Armando de MarcoEdgar Nunes de MoraesBernardo de Mattos VianaMarco Túlio Gualberto CintraTeresa Juárez-CedilloAnthony GrsiwoldTatiana ForundJonathan HainesLindsay FarrerAnita DestefanoEllen WijsmanRichard MayeuxMargaret Pericak-VanceBrian KunkleAlison GoateGerard SchellenbergBadri VardarajanLi-San WangYuk Yee LeungClifton DalgardGaël NicolasDavid WallonCarole DufouilFlorence PasquierOlivier HanonStéphanie DebetteEdna GrünblattJulius PoppBárbara AngelSergio GolgerMaria Victoria ChaconRafael AranguizPaulina OrellanaAndrea SlachevskyChristian Gonzalez-BillaultCecilia AlbalaPatricio FuentesPerminder SachdevKaren MatherRichard HaugerVictoria MerrittMatthew PanizzonRui ZhangMichael GazianoRoberta GhidoniDaniela GalimbertiBeatrice ArosioPatrizia MecocciVincenzo SolfrizziLucilla ParnettiAlessio SquassinaLucio TremolizzoBarbara BorroniBenedetta NacmiasPaolo CaffarraDavide SeripaInnocenzo RaineroAntonio DanieleFabrizio PirasHampton LeonardJennifer YokoyamaMike NallsAkinori MiyashitaNorikazu HaraKouichi OzakiShumpei NiidaJulie WilliamsCarlo MasulloPhilippe AmouyelPierre-Marie PreuxPascal MbelessoBébène BandzouziAndrew J SaykinFrank JessenPatrick KehoeCornelia van DuijnNesrine Ben SalemRuth Frikke-SchmidtLofti CherniMichael GreiciusMagda TsolakiPascual Sánchez-JuanMarco Aurélio Romano SilvaTenielle PorterSimon LawsKristel SleegersMartin IngelssonJean-François DartiguesSudha SeshadriGiacomina RossiLaura MorelliMikko HiltunenRebecca SimsWiesje M van der FlierOle AndreassenHumberto ArboledaCarlos CruchagaValentina Escott-PriceAgustín RuizKun Ho LeeTakeshi IkeuchiAlfredo RamirezJungsoo GimMark LogueJean-Charles Lambert
• Organismes : Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 Institut du Cerveau = Paris Brain Institute Virginia Commonwealth University Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 The University of Osaka Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale Laboratory of Chronic and Neurological Diseases Epidemiology Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 Centre National de Recherche en Génomique Humaine Centre National de Recherche en Génomique Humaine Fondation Jean Dausset - Centre d’Études du Polymorphisme Humain Centre de référence, d’innovation, d’expertise et de transfert Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167

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Résumé : A polygenic score (PGS) for Alzheimer’s disease (AD) was recently derived from data on genome-wide significant loci in European ancestry populations. We applied this PGS to populations in 17 European countries and observed a consistent association with AD risk, age at onset, and cerebrospinal fluid levels of AD biomarkers, independently of apolipoprotein E (APOE) . This PGS was also associated with the AD risk in many other populations of diverse ancestries. A cross-ancestry polygenic risk score (PRS) improved the association with AD risk in most of the multi-ancestry populations tested when the APOE region was included. Lastly, we found that the PGS/PRS, captured AD-specific information because the association weakened as the diagnosis was broadened. In conclusion, a simple PGS captures the AD-specific genetic information that is common to populations of different ancestries, but studies of more diverse populations are still needed for a better characterization of the AD genetics.

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Fichiers liés : 2023.10.17.23297061v2.full.pdf

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• Type de publi. : Pré-publication, Document de travail
• Date de publi. : 04/03/2025
• Auteurs : Raian LefgoumSezin AfsarPierre CarpentierJean-Philippe ChancelierMichel de Lara
• Organismes : Centre d'Enseignement et de Recherche en Mathématiques et Calcul Scientifique Universidad de Oviedo = University of Oviedo Optimisation et commande Centre d'Enseignement et de Recherche en Mathématiques et Calcul Scientifique Centre d'Enseignement et de Recherche en Mathématiques et Calcul Scientifique

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Résumé :

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Fichiers liés : preprint_Hympulsion_v1.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 03/03/2025
• Auteurs : Erell GachonJérémie BigotElsa CazellesAudrey BidetJean-Philippe VialPierre-Yves DumasAguirre Mimoun
• Organismes : Institut de Mathématiques de Bordeaux Institut de Mathématiques de Bordeaux Centre National de la Recherche Scientifique Signal et Communications Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
• Publié dans Cytometry Part A le 31/10/2020

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Résumé : Representing and quantifying Minimal Residual Disease (MRD) in Acute Myeloid Leukemia (AML), a type of cancer that affects the blood and bone marrow, is essential in the prognosis and follow-up of AML patients. As traditional cytological analysis cannot detect leukemia cells below 5\%, the analysis of flow cytometry dataset is expected to provide more reliable results. In this paper, we explore statistical learning methods based on optimal transport (OT) to achieve a relevant low-dimensional representation of multi-patient flow cytometry measurements (FCM) datasets considered as high-dimensional probability distributions. Using the framework of OT, we justify the use of the K-means algorithm for dimensionality reduction of multiple large-scale point clouds through mean measure quantization by merging all the data into a single point cloud. After this quantization step, the visualization of the intra and inter-patients FCM variability is carried out by embedding low-dimensional quantized probability measures into a linear space using either Wasserstein Principal Component Analysis (PCA) through linearized OT or log-ratio PCA of compositional data. Using a publicly available FCM dataset and a FCM dataset from Bordeaux University Hospital, we demonstrate the benefits of our approach over the popular kernel mean embedding technique for statistical learning from multiple high-dimensional probability distributions. We also highlight the usefulness of our methodology for low-dimensional projection and clustering patient measurements according to their level of MRD in AML from FCM. In particular, our OT-based approach allows a relevant and informative two-dimensional representation of the results of the FlowSom algorithm, a state-of-the-art method for the detection of MRD in AML using multi-patient FCM.

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Fichiers liés : Low_dimensional_representation_of_multi_patient_flow_cytometry_datasets_using_optimal_transport_for_measurable_residual_disease_detection_in_leuke__1_.pdf

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• Type de publi. : Chapître d'ouvrage
• Date de publi. : 03/03/2025
• Auteurs : Jean-Philippe EglingerPierre Journoud
• Organismes : Institut National des Langues et Civilisations Orientales Université de Montpellier Paul-Valéry Centre de Recherches Interdisciplinaires en Sciences humaines et Sociales de Montpellier

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Fichiers liés : ase2025-online.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/03/2025
• Auteurs : Tim DarsautJean-Christophe GentricJonathan HeppnerCamille LopezRoland JabreDaniela IancuDaniel RoyAlain WeillMichel BojanowskiChiraz ChaalalaPierre-Olivier CombyDavid RobergeChristophe CognardAnne-Christine JanuelJean-Francois SabatierHubert DesalVincent RoualdesJean-Christophe FerréQuentin AliasChrysanthi PapagiannakiStéphane DerreyStanislas SmajdaSorin AldeaThomas GaberelCharlotte BarbierXavier BarreauGaultier MarnatVincent JeckoRene AnxionnatIsabelle MerlotThanh NguyenMohamad AbdalkaderChloé DumotRoberto RivaThomas GraillonLucas TroudeBasile KerlerouxIrene OllivierRemy BeaujeuxGrégoire BoulouisAlexia Planty-BonjourLaurent SpelleVanessa ChalumeauOlivier NaggaraPierre-Henri LefevreMarine Le CorreEimad ShotarAndrew CarlsonAlessandra BiondiLaurent ThinesRabih TawkThien HuynhRobert FahedJ. Max FindlayEmmanuel ChabertJustine ZehrGuylaine GevryRuby KlinkGeraldine ViardElsa MagroJean Raymond_ _Daniela IancuDaniel RoyAlain WeillJean RaymondPierre-Olivier CombyMichel BojanowskiChiraz ChaalalaRoland JabreDavid RobergeTim DarsautJonathan HeppnerCian O’kellyMichael ChowJ. Max FindlayJeremy RempelRobert FahedHoward LesiukBrian DrakeMarlene dos SantosJean-Christophe GentricCamille LopezMichel NonentJulien OgnardMourad Cheddad El-AouniElsa MagroRomuald SeizeurSerge TimsitOlivier PradierHubert DesalRomain BoursierFrançois ThillaysVincent RoualdesMichel PiotinRaphael BlancStanislas SmajdaSorin AldeaChristophe CognardAnne-Christine JanuelJean-François SabatierLionel CalviereJean-Yves GauvritFrançois EugeneJean-Christophe FerréQuentin AliasJulien BoucheritXavier MorandiIsabelle LecouillardAurelien BriensThomas RonziereStephane VannierDenis TrystramOlivier NaggaraChristine Rodriguez-RegentBasile KerlerouxCharlotte BarbierThomas GaberelEvelyne EmeryEmmanuel TouzeChrysanthi PapagiannakiStéphane DerreyOmer EkerRoberto RivaIsabelle Pellisou-GuyotatJacques GuyotatMonsef BerhoumaChloé DumotAlessandra BiondiLaurent ThinesNassim BougaciGuillaume CharbonnierSerge BracardRené AnxionnatBenjamin GoryIsabelle MerlotThierry CivitValérie Bernier-ChastagnerXavier BarreauGaultier MarnatVincent JeckoGuillaume PenchetEdouard GimbertAymeri HuchetDenis HerbreteauGrégoire BoulouisRichard BibiHéloïse IferganKévin JanotAlexia Planty-BonjourStéphane VelutHervé BrunelPierre-Hugues RocheThomas GraillonHadrien PeyriereJean-Marc KayaAdamou ToutaLucas TroudeSébastien BoissonneauFrédéric ClarençonEimad ShotarNader SourourStéphanie LenckKévin PrematAnne-Laure BochPhilippe CornuAurélien NouetVincent CostalatAlain BonafeCyril DargazanliGregory GascouPierre-Henri LefevreCarlos RiquelmeMarine Le CorreRémy BeaujeuxRaoul PopFrançois ProustHélène CebulaIrène OllivierGiorgio SpatolaLaurent SpelleVanessa ChalumeauSophie GallasLéon IkkaCristian MihaleaAugustin OzanneJildaz CaroffEmmanuel ChabertCharbel MounayerAymeric RouchaudFrançois CaireFrédéric RicolfiPierre ThouantCatherine CaoKlaus-Luc MourierWalid FarahThanh NguyenMohamad AbdalkaderThien HuynhRabih TawkAndrew CarlsonLuciana Alves Oliveira SilvaNayara de Lima FroioGisele Sampaio SilvaFrancisco Mont’alverneJose Luri MartinsGeorge Nunes MendesRodrigo Rivera Miranda
• Organismes : Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille Institut Marseille Maladies Rares Service de neurochirurgie [CHU Marseille]
• Publié dans Journal of Neurosurgery le 26/10/2020

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Résumé : OBJECTIVE Many patients recruited in the Treatment of Brain Arteriovenous Malformations Study (TOBAS) are managed conservatively. The aim of this study was to monitor what happened to those patients. METHODS TOBAS comprises two randomized controlled trials and multiple prospective registries. All patients with brain arteriovenous malformations (AVMs) can participate. This report concerns patients selected for conservative management. The primary trial outcome measure is related death or dependency (modified Rankin Scale [mRS] score > 2) at 10 years. Secondary outcomes include intracranial hemorrhages, nonhemorrhagic neurological events, and serious adverse events (SAEs). For this report, outcome results are presented using patient-years, Kaplan-Meier survival curves, and Cox log-rank tests. There was no blinding. RESULTS From June 2014 to May 2021, 1010 patients were recruited, of whom 498 (49%) were proposed the prospective observation registry. After exclusions, 434 (87%) patients remained for analysis. The majority of patients had unruptured AVMs (378/434 [87%]), of which 195 (52%) were low grade (Spetzler-Martin grade I or II). During a mean follow-up period of 3.2 years (total 1368 patient-years), the primary outcome occurred in 23 of 434 (5%) patients, corresponding to an incidence of 1.7 (95% CI 1.1–2.5) per 100 patient-years. For unruptured AVMs the incidence was 1.1 (95% CI 0.7–1.9) per 100 patient-years, and for low-grade unruptured AVMs it was 0.6 (95% CI 0.2–1.7) per 100 patient-years. Poor outcomes were more frequent in patients with a history of rupture (HR 5.6 [95% CI 2.4–13.0], p < 0.001), infratentorial AVMs (HR 2.9 [95% CI 1.1–7.3], p = 0.027), and age ≥ 55 years (HR 3.2 [95% CI 1.4–7.6], p = 0.007). Major intracranial hemorrhage occurred in 35 of 434 (8%) patients (incidence of 2.6 [95% CI 1.9–3.6] per 100 patient-years; 2.0 [95% CI 1.3–2.9] per 100 patient-years for unruptured AVMs and 1.3 [95% CI 0.6–2.6] per 100 patient-years for low-grade unruptured AVMs). Major AVM hemorrhages were more frequent in ruptured (HR 4.4 [95% CI 2.1–8.9], p < 0.001), large (HR 2.6 [95% CI 1.1–6.6], p = 0.039), and high-grade (HR 2.5 [95% CI 1.2–5.3], p = 0.013) AVMs and those with deep venous drainage (HR 2.1 [95% CI 1.1–4.2], p = 0.032). SAEs occurred in 48 of 434 (11%) patients (incidence of 3.6 [95% CI 2.7–4.8] per 100 patient-years). For unruptured AVMs the incidence was 2.8 (95% CI 2.0–4.0) per 100 patient-years, and for low-grade unruptured AVMs it was 1.8 (95% CI 1.0–3.2) per 100 patient-years. CONCLUSIONS Nearly half of TOBAS participants were observed. Rates of untoward neurological events were within expected boundaries.

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Fichiers liés : j-neurosurg-article-p637.pdf

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/03/2025
• Auteurs : Yann PéréonDavid AdamsJean-Philippe CamdessanchéJean-Baptiste ChansonPascal CintasLaurent MagyAïssatou SignatéGuilhem SoléJuliette SvahnCéline TardCyrla HababouShahram Attarian
• Organismes : Physiopathologie Animale et bioThérapie du muscle et du système nerveux Maladies et hormones du système nerveux Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Filière Neuromusculaire Service Neurologie Pédiatrique [CHU Toulouse] Service de Neurologie [CHU Limoges] Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique] Université de Bordeaux Hôpital Pellegrin Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL] Lille Neurosciences & Cognition - U 1172 Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] Hôpital de la Timone [CHU - APHM] Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille
• Publié dans Orphanet Journal of Rare Diseases le 27/10/2020

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Résumé : Abstract Background and aims Hereditary transthyretin amyloidosis (ATTRv) should be considered in patients diagnosed with intravenous immunoglobulin (IVIg)-resistant chronic inflammatory demyelinating polyradiculoneuropathy (IVIg-NR CIDP). In this 1-year long, retrospective, multicentric study, an online questionnaire was sent to 1100 French healthcare professionals (HCPs) investigating: (i) how many IVIg-NR CIDP patients they followed; (ii) how many IVIg-NR CIDP patients had undergone TTR gene analysis; and (iii) how many IVIg-NR CIDP patients were eventually diagnosed with ATTRv. The questionnaire was sent every 3 months for 1 year and contained information on ATTRv clinical manifestations and diagnosis. Results One-hundred and ten (10%) HCPs responded. A total of 2131 patients with CIDP were identified, including 315 (22.1%) with IVIg-NR CIDP. TTR gene analysis was performed in 144 patients and was positive in 43 cases (29.9%). Conclusions This study demonstrates that ATTRv should be investigated systematically in patients diagnosed with IVIg-NR CIDP. HCP-directed information campaigns are useful for modifying diagnostic practices.

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• Type de publi. : Article dans une revue
• Date de publi. : 01/03/2025
• Auteurs : Eric DurandHélène EltchaninoffDidier TchetcheThomas LevesqueChristian GarmendiaBernard IungHakim BenamerGuillaume CaylaEric van BellePhilippe CommeauHerve Le BretonThomas CuissetMyriam AkodadJean-Philippe VerhoyeSylvain BeurtheretFlorence Du ChaylaManon LeclereMartine GilardNicolas DumonteilHélène EltchaninoffJulien AdjedjBernard AlbatStéphane AubertAlexandre AzmounVincent BachOlivier BarLoïc BelleJérémy BellienBenjamin BertrandBernard BertrandJean-Paul BessouFarzin BeyguiDelphine Béziau-GasnierNicolas BischoffJean-Louis BonnetNicolas BonnetEbba BrakenhielmEric Braun BergerGiuseppina CaligiuriDidier CarriéThierry CausDidier ChampagnacDidier ChatelNicolas ChavanisKarine ChevreulSidney ChocronJean-Noël ChoplainLuc-Philippe ChristiaensCharles ChristopheJean-Philippe ClaudelFrédéric CollartFrédéric ColletJean-Philippe ColletPierre CorbiAlain CurtilNicole DarodesOlivier DarremontFrédérique DebrouckerStéphane DelepineMaxence DelomezThierry DerieuxCamille DiabAlain DibieVincent DoisyEric DurandNicolas DurrlemanGuy Durand de GevigneyOlivier FabreArnaud FargeXavier FavereauThierry FolliguetChristophe FraschiniSaïd GhostineMartine GilardAntoine GommeauxJean-Philippe GrimaudPhilippe GuyonAlain HeppDominique HimbertRémi HouelAndrea InnortaKarl IsaazBernard IungCalin IvascauLaurent JacqueminSaed JazayeriOlivier JegadenPatrick JolyFrancis JuthierSaïd KamelMichel KindoLouis LabrousseAmine LaghzaouiJamila LaschetHervé Le BretonFlorence LeclercqThierry LefevreSimon LemoinePascal LeprinceLionel LerouxGilles LevyLuc LorgisSerge MakowskiThibaut ManigoldAlain ManriqueBertrand MarcheixEric MaupasEmmanuel MessasDavid Messika-ZeitounDamien MetzAnfani MirodeAlain MirzaFranck MohsinalyFrançois MonassierJean-François MorelleEmmanuel MunosPatrick NatafPatrick OhlmannFrédéric PinaudGeorges PinelliFlorence PinetErik PortocarreroBruno PouzetLaurent QuillietVincent RichardGabriel RobertJean-Christian RousselYves SaadeEric SalouxFrançois SchieleGéraud SouteyrandChristian SpauldingDidier TchétchéJacques TeboulEmmanuel TeigerMartin ThoenesChristophe TribouilloyOlivier VahdatEric Van BelleJean-Philippe VerhoyeClaire VézierJacques VilatMarwanne YassineKonstantinos ZannisRachid Zegdi
• Organismes : Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie - Center for Research in Transplantation and Translational Immunology Endothélium, valvulopathies et insuffisance cardiaque CHU Rouen Clinique Pasteur [Toulouse] Endothélium, valvulopathies et insuffisance cardiaque CHU Rouen CHU Rouen Hospital Italiano de Buenos Aires AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris] Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle Hôpital Foch [Suresnes] Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research Institut Pasteur de Lille Polyclinique Les Fleurs - ELSAN Centre Hospitalier Universitaire [Rennes] = Rennes University Hospital [Pontchaillou] Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] University of British Columbia [Canada] Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Pontchaillou] Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image Hôpital Saint-Joseph [Marseille] Clinique Ambroise Paré [Centres Médico-Chirurgicaux Ambroise Paré, Pierre Cherest, Hartmann] Clinique Ambroise Paré [Centres Médico-Chirurgicaux Ambroise Paré, Pierre Cherest, Hartmann] Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest Clinique Pasteur [Toulouse] Endothélium, valvulopathies et insuffisance cardiaque CHU Rouen CHU Montpellier = Montpellier University Hospital CMC Ambroise Paré [Neuilly-sur-Seine] CHU de Grenoble-Alpes - Centre Hospitalier Universitaire CHU Grenoble CHU Rouen Cardiawave SAS [Paris] CHU de Grenoble-Alpes - Centre Hospitalier Universitaire CHU Grenoble CHU Rouen CHU Caen Normandie – Centre Hospitalier Universitaire de Caen Normandie Université de Caen Normandie CHU Rouen Centre Hospitalier Emile Muller [Mulhouse] Hôpital de la Timone [CHU - APHM] Université de Toulouse Service Cardiologie [CHU Toulouse] Centre Hospitalier Universitaire d'Amiens-Picardie Mécanismes physiopathologiques et conséquences des calcifications cardiovasculaires - UR UPJV 7517
• Publié dans Journal of the American College of Cardiology le 26/10/2020

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Résumé : Background: In a context of extending transcatheter aortic valve replacement (TAVR) to patients with a longer life expectancy, it is important to better document the incidence and outcomes of reintervention.Objectives: The authors sought to evaluate the incidence, predictive factors, and long-term outcomes of surgical (explant TAVR) or transcatheter (redo TAVR) reintervention after TAVR.Methods: Patients who had a TAVR between 2010 and 2022 recorded in the FRANCE 2 and FRANCE TAVI registries were included in the analysis. Cumulative incidence of early (≤1 year) and late (>1 year) reintervention was assessed using the Kalbfleisch and Prentice method to account for all-cause death as a competing risk. Patients who had reintervention for infective endocarditis were excluded. Long-term mortality was evaluated using Kaplan-Meier analysis.Results: Among 72,850 patients included, the cumulative incidence of overall reintervention at 8 years was 1.7% including 591 patients who had redo TAVR and 111 patients who required explant TAVR with a low incidence of Bentall intervention. Reintervention occurred mostly early in 62.1% of cases and was more frequent in patients who had a mean aortic gradient >20 mm Hg immediately after index TAVR. Age and mean aortic gradient before TAVR and mean aortic gradient >20 mm Hg, aortic regurgitation ≥ grade 2, and percutaneous coronary intervention after TAVR were predictive of reintervention. Six-year mortality was high but was similar in patients who had early and late reintervention (76.2% vs 64.0%; P = 0.77).Conclusions: Reintervention after TAVR remains rare and was mostly performed early after the procedure and by redo TAVR. Further studies are warranted, particularly in younger patients with longer life expectancy.

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